245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3173 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3173  HflK protein  100 
 
 
394 aa  777    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2736  Protein HflK  68.8 
 
 
382 aa  435  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12799  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0357  HflK protein  60.06 
 
 
393 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.24266  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2001  HflK protein  60.61 
 
 
393 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610891  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0885  HflK protein  62.72 
 
 
394 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1956  HflK protein  60.4 
 
 
387 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.733622  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  55.8 
 
 
399 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  40.49 
 
 
385 aa  270  5e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  41.01 
 
 
383 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  42.78 
 
 
376 aa  261  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  41.92 
 
 
362 aa  261  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  41.09 
 
 
382 aa  258  1e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  42.33 
 
 
382 aa  256  5e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  40.8 
 
 
384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  41.27 
 
 
383 aa  251  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  41.74 
 
 
407 aa  250  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  40.83 
 
 
385 aa  248  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  38.89 
 
 
383 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  39.7 
 
 
389 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  40.33 
 
 
368 aa  247  3e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  41.83 
 
 
398 aa  246  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  40.61 
 
 
379 aa  239  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  42.41 
 
 
390 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2024  HflK protein  44 
 
 
379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  39.68 
 
 
395 aa  233  5e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2541  HflK protein  38.86 
 
 
362 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  38.86 
 
 
389 aa  232  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2800  HflK protein  38.92 
 
 
360 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182223  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  41.23 
 
 
393 aa  222  9e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  37.22 
 
 
386 aa  222  9e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  36.34 
 
 
405 aa  221  9.999999999999999e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  41.55 
 
 
399 aa  218  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  38.11 
 
 
436 aa  217  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  36.26 
 
 
389 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4527  HflK protein  37.25 
 
 
394 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  37.74 
 
 
357 aa  211  3e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2818  HFLK protein  36.03 
 
 
383 aa  210  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  36.62 
 
 
379 aa  209  6e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  38.59 
 
 
355 aa  207  3e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  36.07 
 
 
403 aa  206  5e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  38.73 
 
 
406 aa  206  7e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  37.94 
 
 
388 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  35.03 
 
 
395 aa  205  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  40.41 
 
 
359 aa  202  6e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0924  HflK protein  36.08 
 
 
380 aa  201  9.999999999999999e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  37.03 
 
 
433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  34.55 
 
 
414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  0.00000000000633953 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  33.95 
 
 
395 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  34.59 
 
 
359 aa  201  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2658  HflK protein  36.9 
 
 
382 aa  200  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2885  HflK protein  36.9 
 
 
382 aa  199  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  37.54 
 
 
391 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  33.8 
 
 
344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  37.91 
 
 
387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  34.63 
 
 
477 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  34.11 
 
 
475 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  35.07 
 
 
452 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  35.53 
 
 
503 aa  196  7e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  33.87 
 
 
447 aa  196  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  29.62 
 
 
498 aa  194  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  35.41 
 
 
360 aa  194  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  32.89 
 
 
400 aa  193  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  33.81 
 
 
418 aa  192  8e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  32.86 
 
 
420 aa  191  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002261  HflK protein  35.04 
 
 
401 aa  192  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0330443  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00092  serine protease  35.58 
 
 
401 aa  191  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5106  membrane protein, HflK  35.7 
 
 
434 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167659  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6274  HflK protein  36.09 
 
 
462 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.321519  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1805  HflK protein  36.09 
 
 
462 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.644359  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  35.25 
 
 
435 aa  190  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  33.63 
 
 
459 aa  189  7e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  0.000000000363385 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  35.36 
 
 
457 aa  189  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  36.53 
 
 
413 aa  189  9e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  33.24 
 
 
389 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  32 
 
 
386 aa  188  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  33.25 
 
 
447 aa  187  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  33.24 
 
 
389 aa  186  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  34.23 
 
 
471 aa  187  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  34.8 
 
 
361 aa  186  6e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  32.89 
 
 
394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  34.44 
 
 
399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2760  hflK protein  36.27 
 
 
395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467094  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  34.72 
 
 
400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  35.21 
 
 
464 aa  184  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  36.33 
 
 
378 aa  184  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  33.78 
 
 
367 aa  182  7e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2249  HflK protein  38.64 
 
 
386 aa  182  8.000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1716  HflK protein  37.33 
 
 
441 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.40222  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1743  HflK protein  37.33 
 
 
453 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0600  HflK protein  32.7 
 
 
381 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0138092  hitchhiker  0.00143389 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3430  HflK protein  32.7 
 
 
381 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0909026  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  35.37 
 
 
378 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  35.23 
 
 
451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  35.23 
 
 
451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  37.63 
 
 
471 aa  180  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  33.87 
 
 
474 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2534  HflK protein  34.24 
 
 
466 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0683686  hitchhiker  0.0000321559 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2861  HflK protein  36.93 
 
 
393 aa  179  5.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0579  HflK protein  32 
 
 
386 aa  179  8e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1601  FtsH protease activity modulator HflK  34.52 
 
 
460 aa  179  9e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.13244 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>