More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2800 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2800  HflK protein  100 
 
 
360 aa  731    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182223  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2541  HflK protein  94.05 
 
 
362 aa  616  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  68.85 
 
 
362 aa  464  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2818  HFLK protein  69.02 
 
 
383 aa  454  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  59.52 
 
 
383 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  58.01 
 
 
384 aa  402  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  57.4 
 
 
382 aa  397  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  57.77 
 
 
376 aa  397  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  43.68 
 
 
385 aa  285  5.999999999999999e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0924  HflK protein  42.31 
 
 
380 aa  276  5e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  41.82 
 
 
385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  41.27 
 
 
383 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  40.97 
 
 
383 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  40.36 
 
 
389 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0885  HflK protein  41.45 
 
 
394 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  40.98 
 
 
399 aa  250  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  40.8 
 
 
390 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0357  HflK protein  40.82 
 
 
393 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.24266  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2001  HflK protein  40.82 
 
 
393 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610891  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1956  HflK protein  40.52 
 
 
387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.733622  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  40.65 
 
 
407 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  40.21 
 
 
382 aa  242  7e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2736  Protein HflK  38.78 
 
 
382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12799  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  37.73 
 
 
368 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  39.61 
 
 
405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  37.7 
 
 
395 aa  230  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  40.41 
 
 
379 aa  230  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  37.43 
 
 
395 aa  229  7e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  38.64 
 
 
389 aa  228  9e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  36.89 
 
 
400 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3173  HflK protein  39.47 
 
 
394 aa  228  1e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  35.65 
 
 
386 aa  224  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  36.72 
 
 
433 aa  223  4e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  37.03 
 
 
436 aa  222  8e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  40.11 
 
 
393 aa  220  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  41.82 
 
 
398 aa  218  8.999999999999998e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  42.19 
 
 
388 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  36.62 
 
 
399 aa  215  8e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  36.46 
 
 
471 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  39.09 
 
 
405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  39.09 
 
 
393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  36.09 
 
 
367 aa  214  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  39.09 
 
 
393 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  37.25 
 
 
360 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  35.25 
 
 
451 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  35.25 
 
 
451 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  36.73 
 
 
414 aa  213  3.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  0.00000000000633953 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  41.4 
 
 
359 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  38.24 
 
 
393 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  35.77 
 
 
389 aa  209  7e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  34.32 
 
 
447 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  34.93 
 
 
464 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  35.9 
 
 
459 aa  208  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  0.000000000363385 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  36.04 
 
 
400 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  37.29 
 
 
389 aa  208  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  36.11 
 
 
418 aa  207  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  36.17 
 
 
395 aa  207  3e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  34.15 
 
 
465 aa  206  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  0.0000076277 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  38.11 
 
 
387 aa  205  9e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  35.39 
 
 
394 aa  205  9e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  34.99 
 
 
379 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000508673  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  40.07 
 
 
359 aa  204  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  40.4 
 
 
378 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  39.86 
 
 
351 aa  203  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  36 
 
 
420 aa  203  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  32.88 
 
 
477 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  30.83 
 
 
498 aa  202  7e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  37.57 
 
 
386 aa  202  7e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  36.76 
 
 
389 aa  202  8e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  33.24 
 
 
344 aa  201  9.999999999999999e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0605  hflK protein  35 
 
 
381 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  33.33 
 
 
474 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  32.79 
 
 
471 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  33.86 
 
 
457 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2241  ftsH protease activity modulator HflK  35.42 
 
 
445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.753349  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  32.79 
 
 
475 aa  200  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3708  HflK protein  34.99 
 
 
379 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000788714  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  32.2 
 
 
503 aa  200  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  34.55 
 
 
435 aa  200  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3765  HflK protein  34.99 
 
 
379 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000022736  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  33.91 
 
 
355 aa  200  3e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3891  HflK protein  34.99 
 
 
379 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000465537  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  36.04 
 
 
399 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  37.9 
 
 
379 aa  199  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2220  HflK protein  35.15 
 
 
454 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2024  HflK protein  40.48 
 
 
379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  35.63 
 
 
407 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1338  ftsH protease activity modulator HflK  34.33 
 
 
437 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.123813  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2347  ftsH protease activity modulator HflK  35.15 
 
 
442 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  34.26 
 
 
456 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0069  ftsH protease activity modulator HflK  34.33 
 
 
449 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255254  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1099  HflK protein  34.33 
 
 
437 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1827  HflK protein  34.33 
 
 
437 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2182  HflK protein  34.88 
 
 
454 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00651  HflK complex with HflC  34.94 
 
 
383 aa  197  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.763897  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  35.73 
 
 
413 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1601  FtsH protease activity modulator HflK  33.42 
 
 
460 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.13244 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2534  HflK protein  33.51 
 
 
466 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0683686  hitchhiker  0.0000321559 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  33.98 
 
 
452 aa  195  9e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3309  HflK protein  33.82 
 
 
386 aa  195  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>