More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2018 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  100 
 
 		 362 aa  730    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2818  HFLK protein  75.23 
 
 		 383 aa  492  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2541  HflK protein  68.34 
 
 		 362 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2800  HflK protein  68.85 
 
 		 360 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182223  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  64.67 
 
 		 383 aa  438  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  63.48 
 
 		 376 aa  438  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  64.12 
 
 		 384 aa  437  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  63.53 
 
 		 382 aa  432  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  44.68 
 
 		 399 aa  293  3e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  44.27 
 
 		 383 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0885  HflK protein  45.35 
 
 		 394 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  43.83 
 
 		 385 aa  289  5.0000000000000004e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0357  HflK protein  44.74 
 
 		 393 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.24266  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0924  HflK protein  44.48 
 
 		 380 aa  282  6.000000000000001e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2001  HflK protein  44.74 
 
 		 393 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  43.97 
 
 		 383 aa  279  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  44 
 
 		 389 aa  279  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  42.09 
 
 		 385 aa  278  8e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  43.7 
 
 		 390 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2736  Protein HflK  44.12 
 
 		 382 aa  271  2e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12799  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1956  HflK protein  41.81 
 
 		 387 aa  263  3e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.733622  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  43.64 
 
 		 407 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  40.38 
 
 		 405 aa  259  6e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3173  HflK protein  42.09 
 
 		 394 aa  257  3e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  42.93 
 
 		 398 aa  249  5e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  40.53 
 
 		 389 aa  248  8e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  40.36 
 
 		 382 aa  248  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  42.11 
 
 		 379 aa  246  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  38.89 
 
 		 386 aa  243  3.9999999999999997e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  39.58 
 
 		 368 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  38.66 
 
 		 395 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  38.36 
 
 		 400 aa  239  8e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  39.17 
 
 		 395 aa  235  7e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  39.19 
 
 		 414 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  0.00000000000633953 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  38.17 
 
 		 403 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  38.72 
 
 		 367 aa  233  6e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  40.87 
 
 		 386 aa  229  5e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  37.96 
 
 		 389 aa  227  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  41.35 
 
 		 387 aa  226  4e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  40.29 
 
 		 389 aa  226  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  42.03 
 
 		 379 aa  225  8e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  38.96 
 
 		 393 aa  225  8e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  37.6 
 
 		 433 aa  224  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  36.15 
 
 		 459 aa  223  3e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  0.000000000363385 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3309  HflK protein  36.41 
 
 		 386 aa  223  3e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  40.86 
 
 		 388 aa  223  6e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  37.94 
 
 		 436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  36.69 
 
 		 394 aa  220  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  39.68 
 
 		 360 aa  218  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  38.25 
 
 		 400 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0605  hflK protein  35.75 
 
 		 381 aa  215  8e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2024  HflK protein  42.62 
 
 		 379 aa  215  9e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  40.48 
 
 		 359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00651  HflK complex with HflC  38.64 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.763897  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  37.96 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  37.22 
 
 		 389 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  38.79 
 
 		 399 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0600  HflK protein  35.96 
 
 		 381 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0138092  hitchhiker  0.00143389 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  39.18 
 
 		 406 aa  212  7e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  37.68 
 
 		 405 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  36.67 
 
 		 395 aa  212  7.999999999999999e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  37.68 
 
 		 393 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  40.88 
 
 		 378 aa  212  9e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  37.68 
 
 		 393 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  38.36 
 
 		 413 aa  211  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  37.8 
 
 		 378 aa  211  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  35.56 
 
 		 379 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000508673  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3430  HflK protein  35.67 
 
 		 381 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0909026  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2885  HflK protein  42.26 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2658  HflK protein  42.26 
 
 		 382 aa  210  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  33.97 
 
 		 447 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  40.21 
 
 		 351 aa  209  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  39.51 
 
 		 359 aa  209  5e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0524  protease subunit HflK  35.88 
 
 		 380 aa  209  7e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0548  protease subunit HflK  35.88 
 
 		 380 aa  209  9e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  37.08 
 
 		 420 aa  208  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3708  HflK protein  36.03 
 
 		 379 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000788714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3891  HflK protein  36.03 
 
 		 379 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000465537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3765  HflK protein  36.03 
 
 		 379 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000022736  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4527  HflK protein  38.06 
 
 		 394 aa  206  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0579  HflK protein  36.13 
 
 		 386 aa  206  4e-52  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3203  HflK protein  34.08 
 
 		 386 aa  206  6e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.143701  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  35.91 
 
 		 418 aa  205  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0599  HflK protein  35.39 
 
 		 381 aa  205  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0263631  hitchhiker  0.00000131875 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  39.57 
 
 		 399 aa  203  3e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  30.68 
 
 		 498 aa  203  4e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  36.24 
 
 		 464 aa  203  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  34.2 
 
 		 344 aa  202  5e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  38.33 
 
 		 361 aa  203  5e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3278  HflK protein  35.77 
 
 		 380 aa  202  7e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010392  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  33.62 
 
 		 355 aa  202  8e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3023  hflK protein  36.06 
 
 		 377 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000561401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  35.82 
 
 		 435 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  34.77 
 
 		 407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2241  ftsH protease activity modulator HflK  34.82 
 
 		 445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.753349  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  34.29 
 
 		 451 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  34.29 
 
 		 451 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  35.32 
 
 		 471 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  34.09 
 
 		 457 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1827  HflK protein  34.26 
 
 		 437 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>