More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2736 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2736  Protein HflK  100 
 
 		 382 aa  753    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12799  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1956  HflK protein  70.09 
 
 		 387 aa  466  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.733622  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0885  HflK protein  67.43 
 
 		 394 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2001  HflK protein  68.1 
 
 		 393 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0357  HflK protein  67.53 
 
 		 393 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.24266  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3173  HflK protein  69.01 
 
 		 394 aa  430  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  59.73 
 
 		 399 aa  417  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  42.16 
 
 		 383 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  44.29 
 
 		 376 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  44.23 
 
 		 384 aa  281  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  43.94 
 
 		 382 aa  278  1e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  39.95 
 
 		 385 aa  277  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  43.19 
 
 		 368 aa  276  3e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  41.62 
 
 		 383 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  44.94 
 
 		 362 aa  272  6e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  44.7 
 
 		 383 aa  272  6e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  41.16 
 
 		 385 aa  271  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  44.48 
 
 		 407 aa  270  4e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  40.76 
 
 		 382 aa  265  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2818  HFLK protein  43.36 
 
 		 383 aa  264  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  41.86 
 
 		 389 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  41.69 
 
 		 389 aa  263  4e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  43.23 
 
 		 379 aa  259  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  44.16 
 
 		 398 aa  257  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  41.22 
 
 		 390 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  38.87 
 
 		 405 aa  243  5e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2541  HflK protein  38.42 
 
 		 362 aa  242  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2800  HflK protein  38.53 
 
 		 360 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182223  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2024  HflK protein  44.7 
 
 		 379 aa  236  6e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  39.66 
 
 		 389 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  37.11 
 
 		 386 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  41.86 
 
 		 355 aa  231  1e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  38.87 
 
 		 433 aa  230  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  38.34 
 
 		 447 aa  229  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  40.52 
 
 		 357 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  37.6 
 
 		 395 aa  224  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  38.89 
 
 		 436 aa  223  6e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4527  HflK protein  40.07 
 
 		 394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  37.57 
 
 		 379 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  37.3 
 
 		 400 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  35.85 
 
 		 394 aa  217  4e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  39.37 
 
 		 393 aa  216  5e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  41.38 
 
 		 359 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  36.86 
 
 		 452 aa  216  5.9999999999999996e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  37 
 
 		 395 aa  215  8e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  33.71 
 
 		 344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  37.47 
 
 		 457 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  35.55 
 
 		 395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  29.12 
 
 		 498 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  36.17 
 
 		 386 aa  212  7.999999999999999e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  35.9 
 
 		 477 aa  212  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  37.03 
 
 		 451 aa  211  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  39.8 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  37.03 
 
 		 451 aa  211  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  35.69 
 
 		 420 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00092  serine protease  38.46 
 
 		 401 aa  210  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  34.27 
 
 		 367 aa  209  6e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0924  HflK protein  36.24 
 
 		 380 aa  209  7e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  41.5 
 
 		 359 aa  208  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2760  hflK protein  37.72 
 
 		 395 aa  207  3e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467094  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  34.79 
 
 		 414 aa  207  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  0.00000000000633953 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  35.9 
 
 		 475 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  36.2 
 
 		 471 aa  206  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2885  HflK protein  39.59 
 
 		 382 aa  206  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2658  HflK protein  39.59 
 
 		 382 aa  206  5e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002261  HflK protein  37.64 
 
 		 401 aa  206  8e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0330443  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  35.1 
 
 		 503 aa  205  9e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  41.23 
 
 		 406 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  40.27 
 
 		 399 aa  204  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  36.57 
 
 		 403 aa  204  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  37.95 
 
 		 388 aa  204  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  36.97 
 
 		 447 aa  203  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0164  HflK protein  38.62 
 
 		 347 aa  203  4e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000564548  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  34.23 
 
 		 418 aa  203  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  37.74 
 
 		 435 aa  203  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  34.74 
 
 		 389 aa  202  7e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  37.16 
 
 		 464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  37.2 
 
 		 413 aa  200  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  38.41 
 
 		 456 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  33.75 
 
 		 471 aa  197  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  35.93 
 
 		 389 aa  197  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  34.45 
 
 		 407 aa  197  4.0000000000000005e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  36.42 
 
 		 361 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4645  FtsH protease regulator HflK  36.63 
 
 		 419 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.14387 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0579  HflK protein  35.22 
 
 		 386 aa  195  1e-48  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2861  HflK protein  40 
 
 		 393 aa  195  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  35.14 
 
 		 405 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  33.91 
 
 		 474 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  36.99 
 
 		 459 aa  194  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  0.000000000363385 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04041  modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor  36.36 
 
 		 419 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.298849  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  35.93 
 
 		 399 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4705  FtsH protease regulator HflK  36.36 
 
 		 419 aa  194  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.714132  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4416  FtsH protease regulator HflK  36.36 
 
 		 419 aa  194  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.953832  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04003  hypothetical protein  36.36 
 
 		 419 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.317629  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  36.09 
 
 		 391 aa  194  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3839  FtsH protease regulator HflK  36.36 
 
 		 419 aa  194  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.910091  hitchhiker  0.000000232279 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4732  FtsH protease regulator HflK  36.36 
 
 		 419 aa  194  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.938149  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  35.14 
 
 		 393 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5690  FtsH protease regulator HflK  36.36 
 
 		 419 aa  194  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.440871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  37.33 
 
 		 351 aa  194  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>