More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0630 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0630  HflK protein  100 
 
 		 309 aa  618  1e-176  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1107  HflK protein  58.25 
 
 		 308 aa  383  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0999  HflK protein  57.93 
 
 		 308 aa  381  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1321  HflK protein  58.76 
 
 		 331 aa  363  2e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0702  HflK protein  58.9 
 
 		 306 aa  362  6e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  40.86 
 
 		 405 aa  242  5e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  44.96 
 
 		 360 aa  241  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  45.15 
 
 		 361 aa  238  9e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  41.3 
 
 		 388 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  42.75 
 
 		 359 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  45.26 
 
 		 413 aa  232  6e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  40 
 
 		 407 aa  228  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  38.51 
 
 		 387 aa  228  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  40.62 
 
 		 436 aa  225  7e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  41.29 
 
 		 378 aa  221  9e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  38.06 
 
 		 389 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  37.58 
 
 		 386 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  40.98 
 
 		 367 aa  220  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2262  HflK protein  38.71 
 
 		 333 aa  218  7.999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015812  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0184  HflK protein  38.11 
 
 		 350 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.739242 
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  41.06 
 
 		 344 aa  214  9.999999999999999e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  40.34 
 
 		 395 aa  214  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  40.71 
 
 		 393 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  37.12 
 
 		 433 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3613  HflK protein  39.13 
 
 		 350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  40.06 
 
 		 368 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0665  HflK protein  40.88 
 
 		 322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0164  HflK protein  39.68 
 
 		 347 aa  213  3.9999999999999995e-54  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000564548  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3678  HflK protein  39.13 
 
 		 350 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  37.17 
 
 		 385 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  37.37 
 
 		 503 aa  212  7e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  37.04 
 
 		 435 aa  211  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  36.36 
 
 		 465 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  0.0000076277 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  38.62 
 
 		 385 aa  210  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  40.62 
 
 		 399 aa  210  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1332  hflK protein, putative  40.71 
 
 		 318 aa  208  9e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.683912  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2798  HflK protein  36.48 
 
 		 357 aa  208  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  38.41 
 
 		 447 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3522  HflK protein  40.58 
 
 		 378 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  36.45 
 
 		 382 aa  205  8e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  39.86 
 
 		 379 aa  205  9e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  37.19 
 
 		 498 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  37.87 
 
 		 464 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  37.87 
 
 		 406 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  37.21 
 
 		 477 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  39.1 
 
 		 451 aa  203  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  39.1 
 
 		 451 aa  203  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  38.65 
 
 		 390 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  37.66 
 
 		 398 aa  203  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  38.05 
 
 		 475 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  37.94 
 
 		 389 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  42.14 
 
 		 389 aa  201  9e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  38.19 
 
 		 452 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  36.3 
 
 		 383 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  39.25 
 
 		 457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  39 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  38.08 
 
 		 384 aa  200  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  37.09 
 
 		 362 aa  199  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  39.51 
 
 		 403 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2241  ftsH protease activity modulator HflK  35.31 
 
 		 445 aa  199  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.753349  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  39.36 
 
 		 391 aa  199  7e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  38.05 
 
 		 393 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  39.1 
 
 		 471 aa  198  9e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1601  FtsH protease activity modulator HflK  33.22 
 
 		 460 aa  198  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.13244 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2760  hflK protein  35.53 
 
 		 395 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467094  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2861  HflK protein  39.06 
 
 		 393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  37.63 
 
 		 357 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4527  HflK protein  39.64 
 
 		 394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  34.56 
 
 		 407 aa  196  3e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  37.75 
 
 		 382 aa  196  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  38.26 
 
 		 376 aa  197  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  39.19 
 
 		 464 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  37.77 
 
 		 383 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  38.54 
 
 		 474 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  32.66 
 
 		 395 aa  195  8.000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  37.12 
 
 		 405 aa  195  9e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  39.22 
 
 		 447 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0069  ftsH protease activity modulator HflK  33.11 
 
 		 449 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255254  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1338  ftsH protease activity modulator HflK  33.11 
 
 		 437 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.123813  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  34.9 
 
 		 420 aa  194  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  37.12 
 
 		 393 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1099  HflK protein  33.11 
 
 		 437 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2347  ftsH protease activity modulator HflK  33.11 
 
 		 442 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1827  HflK protein  33.11 
 
 		 437 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0579  HflK protein  34.77 
 
 		 386 aa  194  1e-48  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2220  HflK protein  33.11 
 
 		 454 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  37.68 
 
 		 379 aa  193  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  38.19 
 
 		 471 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  37.76 
 
 		 393 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4724  FtsH protease regulator HflK  35.89 
 
 		 419 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2182  HflK protein  32.78 
 
 		 454 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4641  FtsH protease regulator HflK  35.89 
 
 		 419 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.641221  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3203  HflK protein  32.24 
 
 		 386 aa  192  4e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.143701  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4760  FtsH protease regulator HflK  35.89 
 
 		 419 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4781  FtsH protease regulator HflK  35.89 
 
 		 419 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.932984  normal  0.393456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4631  FtsH protease regulator HflK  35.89 
 
 		 419 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00092  serine protease  34.9 
 
 		 401 aa  192  5e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2534  HflK protein  32.17 
 
 		 466 aa  192  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0683686  hitchhiker  0.0000321559 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002261  HflK protein  34.9 
 
 		 401 aa  192  7e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0330443  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  37.63 
 
 		 400 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>