More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0184 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0184  HflK protein  100 
 
 
350 aa  721    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.739242 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2262  HflK protein  47.51 
 
 
333 aa  335  5.999999999999999e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015812  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3678  HflK protein  47 
 
 
350 aa  281  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3613  HflK protein  47 
 
 
350 aa  281  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3522  HflK protein  46.69 
 
 
378 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0545  HflK protein  42.2 
 
 
366 aa  265  1e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000873771  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2798  HflK protein  43.46 
 
 
357 aa  263  3e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0313  hflK protein, putative  42.95 
 
 
329 aa  253  3e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1332  hflK protein, putative  40.19 
 
 
318 aa  253  5.000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.683912  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  36.34 
 
 
388 aa  218  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  35.41 
 
 
405 aa  215  8e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  36.26 
 
 
367 aa  213  3.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  37.47 
 
 
403 aa  211  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  37.53 
 
 
395 aa  210  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0630  HflK protein  38.97 
 
 
309 aa  209  4e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  34.28 
 
 
360 aa  209  5e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1107  HflK protein  36.96 
 
 
308 aa  209  7e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  37.85 
 
 
378 aa  209  7e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0999  HflK protein  36.63 
 
 
308 aa  207  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  40.21 
 
 
399 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  34.05 
 
 
361 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  36.36 
 
 
359 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  35.2 
 
 
387 aa  199  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  36.62 
 
 
407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0205  HflK protein  34.52 
 
 
311 aa  196  5.000000000000001e-49  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0665  HflK protein  37.5 
 
 
322 aa  194  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  35 
 
 
503 aa  192  7e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0702  HflK protein  37.88 
 
 
306 aa  191  2e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  34.58 
 
 
368 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  37.37 
 
 
436 aa  187  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  38.23 
 
 
391 aa  187  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  34.88 
 
 
498 aa  186  4e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  34.82 
 
 
385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  35.38 
 
 
362 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1956  HflK protein  35.97 
 
 
387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.733622  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  32.87 
 
 
385 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  33.63 
 
 
383 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  34.5 
 
 
382 aa  182  6e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  32.57 
 
 
386 aa  182  7e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1321  HflK protein  36.33 
 
 
331 aa  182  7e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  36.18 
 
 
413 aa  181  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  35.16 
 
 
390 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  37.91 
 
 
471 aa  181  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  32.95 
 
 
383 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  37.92 
 
 
471 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  34.82 
 
 
389 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  33.53 
 
 
384 aa  179  4e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  31.78 
 
 
344 aa  179  5.999999999999999e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  35.33 
 
 
357 aa  179  5.999999999999999e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  34.71 
 
 
386 aa  179  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  35.84 
 
 
433 aa  179  8e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  36.58 
 
 
452 aa  179  9e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0164  HflK protein  34.75 
 
 
347 aa  179  9e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000564548  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  37.42 
 
 
451 aa  178  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  37.42 
 
 
451 aa  178  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  33.52 
 
 
389 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  33.24 
 
 
382 aa  177  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  36.24 
 
 
399 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  35.91 
 
 
435 aa  177  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  34.43 
 
 
398 aa  177  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  36.24 
 
 
400 aa  177  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  34.42 
 
 
447 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  37.16 
 
 
474 aa  176  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  35.69 
 
 
389 aa  175  8e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  35.91 
 
 
394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  33.24 
 
 
376 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  35.05 
 
 
477 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  35.35 
 
 
464 aa  173  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  36.73 
 
 
395 aa  172  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  34.71 
 
 
379 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  36.59 
 
 
464 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  35.05 
 
 
351 aa  172  7.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  31.45 
 
 
355 aa  172  9e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4527  HflK protein  35.64 
 
 
394 aa  172  9e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  36.39 
 
 
400 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  32.86 
 
 
378 aa  171  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  34.81 
 
 
475 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  32.42 
 
 
389 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  35.74 
 
 
399 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  35.45 
 
 
389 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  32.66 
 
 
393 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  36.15 
 
 
456 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  32.09 
 
 
465 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  0.0000076277 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  35.06 
 
 
393 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  33.78 
 
 
457 aa  169  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  34.31 
 
 
383 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2736  Protein HflK  34.94 
 
 
382 aa  169  7e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12799  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2241  ftsH protease activity modulator HflK  33.11 
 
 
445 aa  169  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.753349  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02636  integral membrane protease subunit  33.11 
 
 
375 aa  168  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  34.1 
 
 
405 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2001  HflK protein  36.1 
 
 
393 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610891  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0357  HflK protein  36.1 
 
 
393 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.24266  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0003  HflK protein  34.8 
 
 
329 aa  168  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  35.12 
 
 
379 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2818  HFLK protein  33.83 
 
 
383 aa  168  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  34.1 
 
 
393 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  34.42 
 
 
406 aa  166  4e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  31.07 
 
 
420 aa  166  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  32 
 
 
379 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000508673  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  35.09 
 
 
447 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>