More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1332 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1332  hflK protein, putative  100 
 
 		 318 aa  643    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.683912  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0184  HflK protein  40.19 
 
 		 350 aa  253  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.739242 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0205  HflK protein  46.32 
 
 		 311 aa  250  2e-65  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2262  HflK protein  41.18 
 
 		 333 aa  249  6e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015812  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2798  HflK protein  44.37 
 
 		 357 aa  246  4.9999999999999997e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0313  hflK protein, putative  40.94 
 
 		 329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3678  HflK protein  38.46 
 
 		 350 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3613  HflK protein  39.07 
 
 		 350 aa  232  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3522  HflK protein  39.78 
 
 		 378 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0545  HflK protein  37.7 
 
 		 366 aa  202  7e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000873771  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0630  HflK protein  40.41 
 
 		 309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1107  HflK protein  36.75 
 
 		 308 aa  198  9e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0999  HflK protein  36.75 
 
 		 308 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  38.06 
 
 		 387 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  37.04 
 
 		 378 aa  185  8e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  38.36 
 
 		 359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1321  HflK protein  36.55 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  33.97 
 
 		 362 aa  180  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  35.74 
 
 		 368 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  34.11 
 
 		 393 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  35.86 
 
 		 436 aa  179  8e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  36.39 
 
 		 395 aa  178  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  34 
 
 		 344 aa  177  3e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  35.22 
 
 		 447 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  34.64 
 
 		 355 aa  176  5e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  34.3 
 
 		 405 aa  176  5e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  34.22 
 
 		 477 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  33.89 
 
 		 393 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  35.17 
 
 		 447 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  31.97 
 
 		 464 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  34.68 
 
 		 475 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  35.14 
 
 		 395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  33.99 
 
 		 386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  33.56 
 
 		 405 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4631  FtsH protease regulator HflK  35.62 
 
 		 419 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4641  FtsH protease regulator HflK  35.62 
 
 		 419 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.641221  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4781  FtsH protease regulator HflK  35.62 
 
 		 419 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.932984  normal  0.393456 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  35.14 
 
 		 400 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4724  FtsH protease regulator HflK  35.62 
 
 		 419 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4760  FtsH protease regulator HflK  35.62 
 
 		 419 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  33.54 
 
 		 357 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  34.53 
 
 		 376 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  37.94 
 
 		 388 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  33.56 
 
 		 393 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  36.01 
 
 		 399 aa  172  5e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0357  FtsH protease regulator HflK  34.59 
 
 		 421 aa  172  6.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398708  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  35.22 
 
 		 435 aa  172  9e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2818  HFLK protein  33.11 
 
 		 383 aa  172  9e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  33.88 
 
 		 407 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4645  FtsH protease regulator HflK  35.27 
 
 		 419 aa  171  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.14387 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  34.2 
 
 		 433 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0665  HflK protein  35.08 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  33.33 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  33.66 
 
 		 403 aa  170  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  34.73 
 
 		 360 aa  170  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  37.38 
 
 		 503 aa  170  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  34.33 
 
 		 361 aa  169  4e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  34.35 
 
 		 413 aa  169  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  33.9 
 
 		 391 aa  169  5e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  33.33 
 
 		 379 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000508673  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3765  HflK protein  33.33 
 
 		 379 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000022736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3708  HflK protein  33.33 
 
 		 379 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000788714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3891  HflK protein  33.33 
 
 		 379 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000465537  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04041  modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor  34.93 
 
 		 419 aa  169  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.298849  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5690  FtsH protease regulator HflK  34.93 
 
 		 419 aa  169  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.440871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04003  hypothetical protein  34.93 
 
 		 419 aa  169  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.317629  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4416  FtsH protease regulator HflK  34.93 
 
 		 419 aa  169  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.953832  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4705  FtsH protease regulator HflK  34.93 
 
 		 419 aa  169  6e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.714132  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3839  FtsH protease regulator HflK  34.93 
 
 		 419 aa  169  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.910091  hitchhiker  0.000000232279 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4732  FtsH protease regulator HflK  34.93 
 
 		 419 aa  169  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.938149  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  32.21 
 
 		 407 aa  168  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3203  HflK protein  34.75 
 
 		 386 aa  168  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.143701  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  33 
 
 		 393 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  31.58 
 
 		 385 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0600  HflK protein  32.79 
 
 		 381 aa  166  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0138092  hitchhiker  0.00143389 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3430  HflK protein  32.79 
 
 		 381 aa  166  4e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0909026  normal  0.0445873 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3819  HflK protein  34.59 
 
 		 419 aa  166  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0613795  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  31.37 
 
 		 382 aa  166  5e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  33.1 
 
 		 389 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0605  hflK protein  33.44 
 
 		 381 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  32.34 
 
 		 383 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  31.94 
 
 		 420 aa  165  8e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  33.55 
 
 		 389 aa  165  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  32.47 
 
 		 451 aa  165  9e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  29.61 
 
 		 394 aa  165  9e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  33.77 
 
 		 351 aa  165  9e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  32.47 
 
 		 451 aa  165  9e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2800  HflK protein  35.31 
 
 		 360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182223  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  32.68 
 
 		 471 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  36.27 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  36.89 
 
 		 498 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  33.44 
 
 		 399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  31.68 
 
 		 386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0702  HflK protein  36.55 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  31.49 
 
 		 398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  33.44 
 
 		 400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0599  HflK protein  32.89 
 
 		 381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0263631  hitchhiker  0.00000131875 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  33.56 
 
 		 457 aa  164  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  34 
 
 		 383 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  31.49 
 
 		 418 aa  163  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>