More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1321 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1321  HflK protein  100 
 
 
331 aa  672    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0630  HflK protein  59.03 
 
 
309 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1107  HflK protein  55.92 
 
 
308 aa  361  1e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0999  HflK protein  55.59 
 
 
308 aa  359  3e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0702  HflK protein  50.17 
 
 
306 aa  298  6e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  43.06 
 
 
413 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  37.12 
 
 
405 aa  220  3e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  37.98 
 
 
359 aa  216  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  38.21 
 
 
407 aa  216  5e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  37.02 
 
 
360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  37.93 
 
 
503 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  38.71 
 
 
367 aa  213  3.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  39.93 
 
 
447 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  39.24 
 
 
436 aa  209  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  36.9 
 
 
378 aa  209  5e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  37.34 
 
 
368 aa  209  7e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  38.79 
 
 
361 aa  208  8e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  39.53 
 
 
386 aa  207  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  39.39 
 
 
464 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  40.34 
 
 
451 aa  206  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  40.34 
 
 
451 aa  206  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  37.79 
 
 
498 aa  205  8e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  36.71 
 
 
389 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  36.33 
 
 
388 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  40.2 
 
 
452 aa  203  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  35.67 
 
 
387 aa  202  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  37.37 
 
 
386 aa  202  7e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  40 
 
 
464 aa  202  9e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  39.27 
 
 
471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  37.12 
 
 
393 aa  200  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  38.36 
 
 
457 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  39.32 
 
 
471 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  38.98 
 
 
474 aa  199  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  35.35 
 
 
395 aa  198  9e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  37.25 
 
 
433 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  36.57 
 
 
477 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3613  HflK protein  36.48 
 
 
350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  36.63 
 
 
475 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0164  HflK protein  35.18 
 
 
347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000564548  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3678  HflK protein  36.48 
 
 
350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  37.33 
 
 
395 aa  196  3e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  38 
 
 
355 aa  195  7e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  37 
 
 
435 aa  195  7e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  35.42 
 
 
385 aa  195  8.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  37.79 
 
 
393 aa  195  9e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  38.38 
 
 
344 aa  194  2e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  36.95 
 
 
400 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0665  HflK protein  36.95 
 
 
322 aa  194  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  33.87 
 
 
465 aa  193  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  0.0000076277 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  37.12 
 
 
393 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  35.76 
 
 
379 aa  192  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  37.12 
 
 
393 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  37.12 
 
 
405 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  34.59 
 
 
385 aa  192  8e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  34.54 
 
 
359 aa  192  9e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  36 
 
 
351 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  36.27 
 
 
395 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2262  HflK protein  36.54 
 
 
333 aa  191  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015812  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  38.79 
 
 
389 aa  191  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2241  ftsH protease activity modulator HflK  35.12 
 
 
445 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.753349  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  37.3 
 
 
357 aa  191  2e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  34.77 
 
 
459 aa  191  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  0.000000000363385 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  37.85 
 
 
399 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3522  HflK protein  37.55 
 
 
378 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1332  hflK protein, putative  36.6 
 
 
318 aa  189  4e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.683912  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  33.33 
 
 
382 aa  189  4e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  36.75 
 
 
406 aa  190  4e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4527  HflK protein  36.7 
 
 
394 aa  189  5e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0184  HflK protein  35.83 
 
 
350 aa  188  9e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.739242 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2798  HflK protein  35.71 
 
 
357 aa  188  9e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  37.72 
 
 
447 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  35.59 
 
 
383 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  36.96 
 
 
398 aa  186  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2182  HflK protein  34.45 
 
 
454 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  36.67 
 
 
456 aa  186  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2347  ftsH protease activity modulator HflK  34.45 
 
 
442 aa  185  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0069  ftsH protease activity modulator HflK  34.45 
 
 
449 aa  185  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255254  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2220  HflK protein  34.45 
 
 
454 aa  185  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1338  ftsH protease activity modulator HflK  34.45 
 
 
437 aa  185  9e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.123813  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1827  HflK protein  34.45 
 
 
437 aa  185  9e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1099  HflK protein  34.45 
 
 
437 aa  185  9e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  37.24 
 
 
389 aa  183  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2658  HflK protein  36.98 
 
 
382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2885  HflK protein  36.98 
 
 
382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0003  HflK protein  36.82 
 
 
329 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  35.61 
 
 
389 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  36.68 
 
 
391 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  35.35 
 
 
403 aa  181  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  34.9 
 
 
399 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  34.56 
 
 
400 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  36.62 
 
 
378 aa  181  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  36.01 
 
 
389 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2861  HflK protein  36.79 
 
 
393 aa  181  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  35.61 
 
 
390 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2534  HflK protein  33.11 
 
 
466 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0683686  hitchhiker  0.0000321559 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1601  FtsH protease activity modulator HflK  31.94 
 
 
460 aa  179  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.13244 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  34.54 
 
 
383 aa  179  8e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  35.12 
 
 
394 aa  177  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  33.56 
 
 
379 aa  176  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2024  HflK protein  33.89 
 
 
379 aa  176  7e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>