More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0665 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0665  HflK protein  100 
 
 		 322 aa  650    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3822  HflK protein  48.59 
 
 		 311 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0972078  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  38.89 
 
 		 388 aa  226  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  38.93 
 
 		 407 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2262  HflK protein  36 
 
 		 333 aa  216  5e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015812  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  36.68 
 
 		 385 aa  211  9e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  40.07 
 
 		 387 aa  211  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0313  hflK protein, putative  36.28 
 
 		 329 aa  209  4e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  38.77 
 
 		 367 aa  208  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0630  HflK protein  41.67 
 
 		 309 aa  203  3e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  38.64 
 
 		 360 aa  202  4e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  39.54 
 
 		 378 aa  202  7e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1107  HflK protein  40.07 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0999  HflK protein  39.71 
 
 		 308 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  33.9 
 
 		 398 aa  199  6e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0702  HflK protein  39.19 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0184  HflK protein  37.5 
 
 		 350 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.739242 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3678  HflK protein  35.39 
 
 		 350 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3613  HflK protein  35.39 
 
 		 350 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  35.05 
 
 		 359 aa  193  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  33.88 
 
 		 389 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  33.66 
 
 		 386 aa  189  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  35.38 
 
 		 383 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  36.3 
 
 		 361 aa  189  7e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  37.07 
 
 		 379 aa  189  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  36.58 
 
 		 344 aa  187  1e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1321  HflK protein  38.4 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  37.24 
 
 		 383 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3522  HflK protein  35.44 
 
 		 378 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  34.48 
 
 		 405 aa  186  7e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2736  Protein HflK  33 
 
 		 382 aa  182  9.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12799  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  35.59 
 
 		 399 aa  182  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  36.65 
 
 		 389 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1956  HflK protein  32.56 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.733622  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  34.92 
 
 		 385 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2024  HflK protein  35.1 
 
 		 379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  33.77 
 
 		 368 aa  179  7e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0164  HflK protein  33.44 
 
 		 347 aa  178  1e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000564548  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  35.94 
 
 		 390 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2798  HflK protein  34.2 
 
 		 357 aa  176  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  34.71 
 
 		 403 aa  176  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  34.5 
 
 		 382 aa  176  4e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2760  hflK protein  34.47 
 
 		 395 aa  176  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467094  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4527  HflK protein  33.22 
 
 		 394 aa  176  7e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  35.37 
 
 		 357 aa  175  8e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  35.27 
 
 		 355 aa  172  5.999999999999999e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  35.79 
 
 		 399 aa  172  5.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  34.54 
 
 		 379 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1332  hflK protein, putative  35.08 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.683912  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  33.77 
 
 		 384 aa  171  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  33.22 
 
 		 359 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  33.77 
 
 		 382 aa  170  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  33.22 
 
 		 394 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  33.79 
 
 		 407 aa  170  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002261  HflK protein  33.78 
 
 		 401 aa  170  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0330443  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00092  serine protease  33.78 
 
 		 401 aa  169  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4760  FtsH protease regulator HflK  34.53 
 
 		 419 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0885  HflK protein  33 
 
 		 394 aa  168  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4641  FtsH protease regulator HflK  34.53 
 
 		 419 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.641221  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4781  FtsH protease regulator HflK  34.53 
 
 		 419 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.932984  normal  0.393456 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  34.19 
 
 		 362 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0003  HflK protein  36.56 
 
 		 329 aa  168  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4631  FtsH protease regulator HflK  34.53 
 
 		 419 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4724  FtsH protease regulator HflK  34.53 
 
 		 419 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4645  FtsH protease regulator HflK  34.17 
 
 		 419 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.14387 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02636  integral membrane protease subunit  34.81 
 
 		 375 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2001  HflK protein  33 
 
 		 393 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  34.03 
 
 		 418 aa  166  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0357  HflK protein  33 
 
 		 393 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.24266  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04041  modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor  33.81 
 
 		 419 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.298849  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4416  FtsH protease regulator HflK  33.81 
 
 		 419 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.953832  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04003  hypothetical protein  33.81 
 
 		 419 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.317629  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3839  FtsH protease regulator HflK  33.81 
 
 		 419 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.910091  hitchhiker  0.000000232279 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4732  FtsH protease regulator HflK  33.81 
 
 		 419 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.938149  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5690  FtsH protease regulator HflK  33.81 
 
 		 419 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.440871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4705  FtsH protease regulator HflK  33.81 
 
 		 419 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.714132  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  33.33 
 
 		 395 aa  165  8e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  33.01 
 
 		 395 aa  165  9e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0357  FtsH protease regulator HflK  33.69 
 
 		 421 aa  165  9e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398708  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  33.11 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  36.49 
 
 		 386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  31.97 
 
 		 420 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0579  HflK protein  32.3 
 
 		 386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  31.42 
 
 		 393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2818  HFLK protein  32.33 
 
 		 383 aa  162  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3819  HflK protein  33.45 
 
 		 419 aa  162  6e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0613795  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  31.63 
 
 		 433 aa  162  6e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2658  HflK protein  34.19 
 
 		 382 aa  162  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2885  HflK protein  34.19 
 
 		 382 aa  162  6e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3980  HflK protein  32.16 
 
 		 382 aa  162  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.758687  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  30.69 
 
 		 465 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  0.0000076277 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0697  FtsH protease regulator HflK  34.05 
 
 		 419 aa  161  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3651  FtsH protease regulator HflK  34.05 
 
 		 420 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3796  FtsH protease regulator HflK  34.05 
 
 		 420 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  32.8 
 
 		 376 aa  161  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0487  HflK protein  32.47 
 
 		 420 aa  162  1e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  34.02 
 
 		 400 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  33.82 
 
 		 378 aa  160  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3309  HflK protein  32.88 
 
 		 386 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  34.46 
 
 		 393 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>