More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0978 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_0978  band 7 protein  100 
 
 
312 aa  638    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3236  band 7 protein  53.76 
 
 
295 aa  306  3e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3629  band 7 protein  57.09 
 
 
298 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00841169  hitchhiker  0.00129487 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3650  band 7 protein  33.45 
 
 
305 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0210038  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3076  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.69 
 
 
302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3042  band 7 protein  30.56 
 
 
295 aa  147  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1062  band 7 protein  29.6 
 
 
299 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2721  band 7 protein  29.51 
 
 
308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000149129  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2636  SPFH/band 7 family protein  29.51 
 
 
308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156489  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1572  SPFH/band 7 family protein  30.28 
 
 
295 aa  140  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.915425  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3837  band 7 protein  30.5 
 
 
295 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.712498 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0423  band 7 protein  30.5 
 
 
295 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3910  band 7 protein  30.5 
 
 
295 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0444  band 7 protein  28.83 
 
 
295 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4033  band 7 protein  30.5 
 
 
295 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0445  hflC protein, putative  29.89 
 
 
296 aa  135  8e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3398  band 7 protein  30.5 
 
 
295 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0448  band 7 protein  30.12 
 
 
295 aa  132  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3581  band 7 protein  30.12 
 
 
295 aa  132  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4057  band 7 protein  34.08 
 
 
287 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2987  band 7 protein  30.24 
 
 
315 aa  112  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3604  band 7 protein  29.17 
 
 
312 aa  109  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10521 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2924  band 7 protein  29.15 
 
 
318 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839077  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4464  band 7 protein  24.91 
 
 
268 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0054233  normal  0.226289 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4401  band 7 protein  25.95 
 
 
268 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1813  band 7 protein  22.92 
 
 
263 aa  95.9  7e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0815  band 7 protein  28.21 
 
 
278 aa  95.5  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000157152  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2373  band 7 protein  27.36 
 
 
304 aa  92.4  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0825  band 7 protein  28.85 
 
 
287 aa  91.3  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0292375 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1708  SPFH domain-containing protein  27 
 
 
362 aa  91.3  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5029  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.44 
 
 
267 aa  90.9  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.290689  normal  0.430447 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2852  band 7 protein  27.62 
 
 
284 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2498  band 7 protein  25.08 
 
 
316 aa  90.1  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0317  SPFH domain-containing protein  27.39 
 
 
362 aa  89.7  6e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.134016  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0295  SPFH domain-containing protein  27.39 
 
 
362 aa  89.7  6e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2467  band 7 protein  26.64 
 
 
318 aa  88.6  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0849083 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2167  hypothetical protein  26.64 
 
 
282 aa  87.8  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.772353  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0179  band 7 protein  26.37 
 
 
363 aa  84.3  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1405  conserved hypothetical transmembrane protein (SPFH domain / Band 7 family)  26.88 
 
 
356 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0303  SPFH domain-containing protein  27.85 
 
 
364 aa  82.8  0.000000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.496264  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1448  SPFH domain-containing protein  26.24 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.125445  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0854  cation-transporting ATPase, P-type  29.03 
 
 
364 aa  80.1  0.00000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0253  band 7 protein  26.99 
 
 
310 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3397  band 7 protein  25.41 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0728  band 7 protein  23.55 
 
 
276 aa  75.9  0.0000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04831  Band 7 protein  26.91 
 
 
267 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.297877  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4200  band 7 protein  28.57 
 
 
268 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525075  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3545  band 7 protein  26.18 
 
 
291 aa  75.5  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.978436  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12321  Band 7 protein  26.73 
 
 
266 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26530  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  26.78 
 
 
304 aa  74.3  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.149484  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3100  band 7 protein  23.49 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1957  band 7 protein  25.2 
 
 
360 aa  73.9  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0790596  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0524  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.57 
 
 
264 aa  73.2  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.675016 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1810  Band 7 protein  26.44 
 
 
264 aa  72  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2811  band 7 protein  26.59 
 
 
276 aa  71.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103679  hitchhiker  0.00246808 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3018  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.66 
 
 
261 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.126407  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2108  SPFH domain-containing protein  28.4 
 
 
370 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1815  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.89 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  26.04 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05391  Band 7 protein  26.89 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0703  HflC protein  26.98 
 
 
281 aa  70.5  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0362  band 7 protein  25.42 
 
 
321 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  27.4 
 
 
283 aa  69.7  0.00000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  24.9 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  26.67 
 
 
283 aa  69.3  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3569  membrane protease subunit  25.76 
 
 
258 aa  68.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05461  Band 7 protein  25.6 
 
 
268 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.178963  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  23.76 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  23.48 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_54960  predicted protein  24.55 
 
 
269 aa  67.4  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  25.9 
 
 
283 aa  67  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  25.9 
 
 
283 aa  67  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  21.38 
 
 
288 aa  67  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0549  membrane protease subunit HflC  27.05 
 
 
304 aa  66.2  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05381  Band 7 protein  24.53 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0483  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.53 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05091  Band 7 protein  24.53 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0525  membrane protease subunit HflC  26.64 
 
 
304 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0666  HflC protein  24.02 
 
 
289 aa  65.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  25.71 
 
 
293 aa  65.1  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4360  band 7 protein  25.95 
 
 
307 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06520  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  22.96 
 
 
311 aa  64.3  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000843271  normal  0.35726 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0512  band 7 protein  23.08 
 
 
282 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000338316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1845  band 7 protein  25.32 
 
 
280 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0496  band 7 protein  23.08 
 
 
282 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1902  band 7 protein  25 
 
 
311 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1357  protease  27.92 
 
 
307 aa  63.5  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.605362  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2033  band 7 protein  25 
 
 
311 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295777  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.7 
 
 
315 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764976  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  25.38 
 
 
297 aa  63.2  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.7 
 
 
315 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32562  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2559  membrane protein GNA1220  25.7 
 
 
315 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_54958  prohibitin-like protein  23.55 
 
 
284 aa  63.2  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2033  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.7 
 
 
315 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.30035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3279  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.7 
 
 
315 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.571401  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1304  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.7 
 
 
315 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2468  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.7 
 
 
315 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  23.84 
 
 
298 aa  62.8  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1185  membrane protease  23.62 
 
 
316 aa  62.8  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  23.2 
 
 
297 aa  62.8  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>