More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3629 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3629  band 7 protein  100 
 
 		 298 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00841169  hitchhiker  0.00129487 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3236  band 7 protein  92.81 
 
 		 295 aa  553  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0978  band 7 protein  53.06 
 
 		 312 aa  308  5e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3650  band 7 protein  33.44 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0210038  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0445  hflC protein, putative  30.3 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0444  band 7 protein  31.42 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1062  band 7 protein  31.49 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3837  band 7 protein  32.7 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.712498 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0423  band 7 protein  32.7 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4033  band 7 protein  32.7 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3910  band 7 protein  32.7 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3398  band 7 protein  33.08 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3076  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.85 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3042  band 7 protein  30.94 
 
 		 295 aa  146  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2636  SPFH/band 7 family protein  28.71 
 
 		 308 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156489  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2721  band 7 protein  28.71 
 
 		 308 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000149129  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1572  SPFH/band 7 family protein  29.45 
 
 		 295 aa  142  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.915425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0448  band 7 protein  31.18 
 
 		 295 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3581  band 7 protein  31.18 
 
 		 295 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4057  band 7 protein  32.97 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2924  band 7 protein  31.56 
 
 		 318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3604  band 7 protein  30.96 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10521 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2987  band 7 protein  30.39 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0815  band 7 protein  30.53 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000157152  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0825  band 7 protein  34.85 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0292375 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1813  band 7 protein  25.27 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2167  hypothetical protein  29.55 
 
 		 282 aa  96.3  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.772353  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5029  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.1 
 
 		 267 aa  94  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.290689  normal  0.430447 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4401  band 7 protein  27.51 
 
 		 268 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4464  band 7 protein  26.97 
 
 		 268 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0054233  normal  0.226289 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2852  band 7 protein  25.27 
 
 		 284 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0253  band 7 protein  26.22 
 
 		 310 aa  85.9  7e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1876  Band 7 protein  29.3 
 
 		 372 aa  85.9  8e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2373  band 7 protein  28.33 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1405  conserved hypothetical transmembrane protein (SPFH domain / Band 7 family)  27.08 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0179  band 7 protein  26.37 
 
 		 363 aa  84.3  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2467  band 7 protein  27.7 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0849083 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0728  band 7 protein  25.65 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1448  SPFH domain-containing protein  26.3 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.125445  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1708  SPFH domain-containing protein  27.21 
 
 		 362 aa  79.3  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04831  Band 7 protein  31.07 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.297877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  27.76 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0303  SPFH domain-containing protein  26.05 
 
 		 364 aa  75.9  0.0000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.496264  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0235  band 7 protein  28.19 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.144192 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1017  bacteriophage/transposase fusion protein  25.26 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0310816  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0578  FtsH protease regulator HflC  26.85 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0317  SPFH domain-containing protein  26.8 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.134016  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12321  Band 7 protein  30.88 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0295  SPFH domain-containing protein  26.8 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2498  band 7 protein  27.11 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3916  FtsH protease regulator HflC  25.8 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0666  HflC protein  25.21 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  26.01 
 
 		 334 aa  72.8  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  26.01 
 
 		 334 aa  72.8  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3397  band 7 protein  22.46 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  26.01 
 
 		 334 aa  72.8  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1663  hypothetical protein  24.1 
 
 		 341 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0672559  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0854  cation-transporting ATPase, P-type  27.34 
 
 		 364 aa  72.4  0.000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3718  FtsH protease regulator HflC  25.89 
 
 		 331 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0820553  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2811  band 7 protein  28.63 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103679  hitchhiker  0.00246808 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04042  modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor  27.76 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.040502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3818  HflC protein  27.76 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5691  FtsH protease regulator HflC  27.76 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04004  hypothetical protein  27.76 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4733  FtsH protease regulator HflC  27.76 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3838  FtsH protease regulator HflC  27.76 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4706  FtsH protease regulator HflC  27.76 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4646  FtsH protease regulator HflC  27.76 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.175793 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4417  FtsH protease regulator HflC  27.76 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  26.09 
 
 		 335 aa  70.9  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0524  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.33 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.675016 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  25.1 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  25.1 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0512  band 7 protein  22.73 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000338316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0496  band 7 protein  22.73 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3545  band 7 protein  23.3 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.978436  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0538  FtsH protease regulator HflC  24.31 
 
 		 331 aa  69.3  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.255691  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  24.71 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  24.71 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1945  bacteriophage/transposase fusion protein  24.23 
 
 		 462 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2108  SPFH domain-containing protein  25.76 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3569  membrane protease subunit  26.24 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4725  FtsH protease regulator HflC  27.05 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4761  FtsH protease regulator HflC  27.05 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4782  FtsH protease regulator HflC  27.05 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  0.242 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  24.91 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0534  bacteriophage/transposase fusion protein  24.91 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0362  band 7 protein  27.13 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4642  FtsH protease regulator HflC  27.05 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4632  FtsH protease regulator HflC  27.05 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05461  Band 7 protein  26.11 
 
 		 268 aa  67  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.178963  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0525  membrane protease subunit HflC  29.96 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05391  Band 7 protein  28.16 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1815  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.16 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0436  Band 7 protein  26.87 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.155422  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3100  band 7 protein  23.69 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29372  predicted protein  26.25 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0549  membrane protease subunit HflC  29.75 
 
 		 304 aa  67  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0749  band 7 protein  29 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.810157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0495  FtsH protease regulator HflC  25.08 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>