132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2167 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2167  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  569  1e-161  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.772353  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0815  band 7 protein  54.83 
 
 
278 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000157152  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3604  band 7 protein  42.86 
 
 
312 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10521 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2924  band 7 protein  43.08 
 
 
318 aa  188  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839077  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4401  band 7 protein  41.63 
 
 
268 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4464  band 7 protein  41.63 
 
 
268 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0054233  normal  0.226289 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2987  band 7 protein  40.29 
 
 
315 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2852  band 7 protein  41.89 
 
 
284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0825  band 7 protein  41.6 
 
 
287 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0292375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5029  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.94 
 
 
267 aa  177  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.290689  normal  0.430447 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1813  band 7 protein  37.31 
 
 
263 aa  168  8e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2402  hypothetical protein  42.76 
 
 
210 aa  145  7.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0727327  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0496  band 7 protein  33.33 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0512  band 7 protein  33.33 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000338316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3018  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.86 
 
 
261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.126407  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3397  band 7 protein  32.69 
 
 
279 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_54960  predicted protein  34.8 
 
 
269 aa  112  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1873  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.33 
 
 
280 aa  112  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0154028  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1845  band 7 protein  33.97 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3545  band 7 protein  32.32 
 
 
291 aa  109  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.978436  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_54958  prohibitin-like protein  33.82 
 
 
284 aa  107  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29372  predicted protein  29.28 
 
 
278 aa  106  4e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41824  predicted protein  35 
 
 
282 aa  104  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.699109  normal  0.209561 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0728  band 7 protein  29.1 
 
 
276 aa  103  3e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3236  band 7 protein  29.12 
 
 
295 aa  102  8e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2811  band 7 protein  31.03 
 
 
276 aa  101  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103679  hitchhiker  0.00246808 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00686  prohibitin complex subunit Phb1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13470)  32.84 
 
 
280 aa  100  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06073  putative prohibitin (Eurofung)  29.06 
 
 
307 aa  99.8  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.453994  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00780  prohibitin PHB1, putative  30.62 
 
 
274 aa  100  4e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49447  predicted protein  32.98 
 
 
275 aa  100  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0166572  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12799  prohibitin-like protein  31.63 
 
 
244 aa  98.6  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.15456  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05381  Band 7 protein  26.52 
 
 
267 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05091  Band 7 protein  26.52 
 
 
267 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4360  band 7 protein  32.95 
 
 
307 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04831  Band 7 protein  29.37 
 
 
267 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.297877  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1448  SPFH domain-containing protein  25.71 
 
 
359 aa  97.1  3e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.125445  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2498  band 7 protein  29.13 
 
 
316 aa  96.7  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3629  band 7 protein  30.24 
 
 
298 aa  95.9  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00841169  hitchhiker  0.00129487 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0978  band 7 protein  26.52 
 
 
312 aa  94.7  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4422  band 7 protein  33.2 
 
 
307 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0850578 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2089  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.9 
 
 
259 aa  94  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0483  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.76 
 
 
267 aa  93.2  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12321  Band 7 protein  27.17 
 
 
266 aa  92.4  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1810  Band 7 protein  29.52 
 
 
264 aa  91.3  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76983  predicted protein  30.34 
 
 
302 aa  90.1  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0436  Band 7 protein  26.88 
 
 
249 aa  87.4  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.155422  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05461  Band 7 protein  25.38 
 
 
268 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.178963  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1405  conserved hypothetical transmembrane protein (SPFH domain / Band 7 family)  24.61 
 
 
356 aa  87.8  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0362  band 7 protein  27.17 
 
 
321 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1708  SPFH domain-containing protein  24.61 
 
 
362 aa  85.9  7e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1815  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.14 
 
 
267 aa  85.9  8e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05391  Band 7 protein  27.14 
 
 
267 aa  85.9  8e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00070  proteolysis and peptidolysis-related protein, putative  28.9 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0637663  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0524  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.15 
 
 
264 aa  85.1  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.675016 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0179  band 7 protein  24.07 
 
 
363 aa  83.6  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2467  band 7 protein  27.54 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0849083 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0253  band 7 protein  25.52 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4200  band 7 protein  28.03 
 
 
268 aa  79.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525075  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1062  band 7 protein  24.21 
 
 
299 aa  79  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0303  SPFH domain-containing protein  25.86 
 
 
364 aa  78.2  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.496264  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2636  SPFH/band 7 family protein  24.14 
 
 
308 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156489  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0854  cation-transporting ATPase, P-type  26.76 
 
 
364 aa  78.2  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1572  SPFH/band 7 family protein  24.14 
 
 
295 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.915425  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2721  band 7 protein  24.14 
 
 
308 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000149129  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0317  SPFH domain-containing protein  24.23 
 
 
362 aa  75.9  0.0000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.134016  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0295  SPFH domain-containing protein  24.57 
 
 
362 aa  75.9  0.0000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3569  membrane protease subunit  25 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4917  band 7 protein  25.96 
 
 
301 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149772  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3650  band 7 protein  24.75 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0210038  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3076  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.58 
 
 
302 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0444  band 7 protein  24.13 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1185  membrane protease  29.01 
 
 
316 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0445  hflC protein, putative  24.13 
 
 
296 aa  72  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3042  band 7 protein  24.01 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2108  SPFH domain-containing protein  23.81 
 
 
370 aa  70.1  0.00000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4057  band 7 protein  25.38 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3837  band 7 protein  25.57 
 
 
295 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.712498 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0423  band 7 protein  25.57 
 
 
295 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3910  band 7 protein  25.57 
 
 
295 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4033  band 7 protein  25.57 
 
 
295 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0145  putative transmembrane protein  25.27 
 
 
302 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.943019  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3709  hypothetical protein  26.03 
 
 
436 aa  63.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731081  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0448  band 7 protein  23.77 
 
 
295 aa  62.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3581  band 7 protein  23.77 
 
 
295 aa  62.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1830  band 7 protein  27.02 
 
 
303 aa  62.8  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1876  Band 7 protein  24.79 
 
 
372 aa  61.2  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3398  band 7 protein  23.4 
 
 
295 aa  60.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3100  band 7 protein  26.32 
 
 
318 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1017  bacteriophage/transposase fusion protein  24.55 
 
 
270 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0310816  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1663  hypothetical protein  25.09 
 
 
341 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0672559  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1957  band 7 protein  24.38 
 
 
360 aa  57.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0790596  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5610  band 7 protein  23.18 
 
 
265 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.606547  normal  0.386273 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2032  band 7 protein  25.4 
 
 
303 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08236  hypothetical protein  24.07 
 
 
271 aa  56.6  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0359  band 7 protein  25.45 
 
 
268 aa  54.7  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.741854  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0038  band 7 protein  22.1 
 
 
302 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2990  band 7 protein  25.55 
 
 
384 aa  53.5  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1182  membrane protease  24.12 
 
 
299 aa  52.8  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1478  band 7 protein  22.27 
 
 
290 aa  52.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1945  bacteriophage/transposase fusion protein  23.96 
 
 
462 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>