64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2402 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2402  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  429  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0727327  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2167  hypothetical protein  41.61 
 
 
282 aa  138  7e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.772353  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0815  band 7 protein  31.82 
 
 
278 aa  116  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000157152  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5029  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.35 
 
 
267 aa  97.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.290689  normal  0.430447 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4464  band 7 protein  30.72 
 
 
268 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0054233  normal  0.226289 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2852  band 7 protein  32.52 
 
 
284 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4401  band 7 protein  30.72 
 
 
268 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3604  band 7 protein  28.49 
 
 
312 aa  90.9  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10521 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2987  band 7 protein  25.82 
 
 
315 aa  85.1  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2924  band 7 protein  27.44 
 
 
318 aa  85.1  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839077  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0825  band 7 protein  31.08 
 
 
287 aa  84.7  9e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0292375 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12799  prohibitin-like protein  30.3 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.15456  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29372  predicted protein  26.72 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1813  band 7 protein  27.75 
 
 
263 aa  67  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1845  band 7 protein  24.06 
 
 
280 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41824  predicted protein  27.4 
 
 
282 aa  65.5  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.699109  normal  0.209561 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_54960  predicted protein  28.36 
 
 
269 aa  63.2  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_54958  prohibitin-like protein  27.61 
 
 
284 aa  63.5  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76983  predicted protein  24.26 
 
 
302 aa  62.4  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00780  prohibitin PHB1, putative  24.66 
 
 
274 aa  62.4  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4422  band 7 protein  28.47 
 
 
307 aa  62  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0850578 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12321  Band 7 protein  28.49 
 
 
266 aa  59.7  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04831  Band 7 protein  23.84 
 
 
267 aa  59.3  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.297877  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3545  band 7 protein  25.6 
 
 
291 aa  59.3  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.978436  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4360  band 7 protein  27.78 
 
 
307 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0978  band 7 protein  25.99 
 
 
312 aa  58.2  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3397  band 7 protein  23.31 
 
 
279 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06073  putative prohibitin (Eurofung)  24.63 
 
 
307 aa  57.4  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.453994  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0512  band 7 protein  23.12 
 
 
282 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000338316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0496  band 7 protein  23.12 
 
 
282 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1873  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.89 
 
 
280 aa  57  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0154028  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0179  band 7 protein  25.68 
 
 
363 aa  55.8  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3018  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.83 
 
 
261 aa  56.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.126407  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05461  Band 7 protein  27.78 
 
 
268 aa  55.5  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.178963  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00686  prohibitin complex subunit Phb1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13470)  24.43 
 
 
280 aa  55.5  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00070  proteolysis and peptidolysis-related protein, putative  24.24 
 
 
318 aa  55.5  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0637663  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49447  predicted protein  27.56 
 
 
275 aa  55.5  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0166572  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0524  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.92 
 
 
264 aa  52.8  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.675016 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2498  band 7 protein  23.68 
 
 
316 aa  52.8  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1957  band 7 protein  25.42 
 
 
360 aa  52.8  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0790596  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2089  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.53 
 
 
259 aa  52.8  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1810  Band 7 protein  31.36 
 
 
264 aa  52.4  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05391  Band 7 protein  26.37 
 
 
267 aa  51.6  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1815  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.37 
 
 
267 aa  51.6  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0436  Band 7 protein  28.57 
 
 
249 aa  51.2  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.155422  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0483  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.11 
 
 
267 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4200  band 7 protein  25.32 
 
 
268 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525075  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05381  Band 7 protein  25.69 
 
 
267 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05091  Band 7 protein  25.69 
 
 
267 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3076  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.6 
 
 
302 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3236  band 7 protein  22.3 
 
 
295 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2467  band 7 protein  23.63 
 
 
318 aa  46.2  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0849083 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3629  band 7 protein  21.62 
 
 
298 aa  46.2  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00841169  hitchhiker  0.00129487 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0303  SPFH domain-containing protein  27.41 
 
 
364 aa  46.2  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.496264  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1405  conserved hypothetical transmembrane protein (SPFH domain / Band 7 family)  22.49 
 
 
356 aa  44.7  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3569  membrane protease subunit  25 
 
 
258 aa  44.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1708  SPFH domain-containing protein  19.48 
 
 
362 aa  44.7  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  30.88 
 
 
290 aa  43.5  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0444  band 7 protein  29.03 
 
 
295 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  32.31 
 
 
289 aa  43.5  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1062  band 7 protein  28.07 
 
 
299 aa  42.7  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0362  band 7 protein  23.13 
 
 
321 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3172  HflC protein  26.32 
 
 
300 aa  41.6  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2032  band 7 protein  26.51 
 
 
303 aa  41.6  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.953686 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>