65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1957 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1957  band 7 protein  100 
 
 
360 aa  723    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0790596  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08236  hypothetical protein  44.03 
 
 
271 aa  195  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4200  band 7 protein  41.32 
 
 
268 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525075  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3709  hypothetical protein  37.46 
 
 
436 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731081  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4917  band 7 protein  32.37 
 
 
301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149772  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4360  band 7 protein  30 
 
 
307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2032  band 7 protein  30.83 
 
 
303 aa  122  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1185  membrane protease  34.04 
 
 
316 aa  119  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1830  band 7 protein  30.04 
 
 
303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4422  band 7 protein  30.69 
 
 
307 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0850578 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2467  band 7 protein  28.1 
 
 
318 aa  105  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0849083 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2498  band 7 protein  29.82 
 
 
316 aa  98.6  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3569  membrane protease subunit  25.74 
 
 
258 aa  97.4  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0362  band 7 protein  23.79 
 
 
321 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29372  predicted protein  27.35 
 
 
278 aa  79.7  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00780  prohibitin PHB1, putative  26.24 
 
 
274 aa  78.6  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5029  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.37 
 
 
267 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.290689  normal  0.430447 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00070  proteolysis and peptidolysis-related protein, putative  24.35 
 
 
318 aa  75.9  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0637663  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0253  band 7 protein  25.7 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2924  band 7 protein  27.31 
 
 
318 aa  73.2  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839077  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49447  predicted protein  24.9 
 
 
275 aa  72.8  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0166572  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76983  predicted protein  25.43 
 
 
302 aa  72.4  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0978  band 7 protein  25.2 
 
 
312 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2987  band 7 protein  26.01 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41824  predicted protein  25.94 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.699109  normal  0.209561 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06073  putative prohibitin (Eurofung)  25.19 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.453994  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2852  band 7 protein  27.14 
 
 
284 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4464  band 7 protein  26.87 
 
 
268 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0054233  normal  0.226289 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4401  band 7 protein  26.43 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0815  band 7 protein  23.62 
 
 
278 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000157152  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_54960  predicted protein  24.61 
 
 
269 aa  65.1  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00686  prohibitin complex subunit Phb1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13470)  24.41 
 
 
280 aa  65.1  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3604  band 7 protein  25.84 
 
 
312 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10521 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0825  band 7 protein  24.21 
 
 
287 aa  63.9  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0292375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3100  band 7 protein  25.45 
 
 
318 aa  63.5  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_54958  prohibitin-like protein  23.58 
 
 
284 aa  63.5  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2728  hypothetical protein  23.36 
 
 
293 aa  58.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000677949 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12799  prohibitin-like protein  23.08 
 
 
244 aa  57  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.15456  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1813  band 7 protein  25.78 
 
 
263 aa  56.6  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1876  Band 7 protein  23.28 
 
 
372 aa  56.2  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2167  hypothetical protein  25.12 
 
 
282 aa  54.3  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.772353  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1405  conserved hypothetical transmembrane protein (SPFH domain / Band 7 family)  23.5 
 
 
356 aa  51.2  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3397  band 7 protein  27.64 
 
 
279 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1448  SPFH domain-containing protein  22.18 
 
 
359 aa  49.7  0.00008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.125445  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0317  SPFH domain-containing protein  22.79 
 
 
362 aa  48.9  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.134016  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1708  SPFH domain-containing protein  23.4 
 
 
362 aa  49.3  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0295  SPFH domain-containing protein  22.79 
 
 
362 aa  49.3  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0496  band 7 protein  27.65 
 
 
282 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0179  band 7 protein  20.96 
 
 
363 aa  48.1  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  28.5 
 
 
300 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0512  band 7 protein  27.65 
 
 
282 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000338316 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1029  band 7 protein  27.91 
 
 
340 aa  47.8  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2402  hypothetical protein  24.84 
 
 
210 aa  47.8  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0727327  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3545  band 7 protein  26.67 
 
 
291 aa  47  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.978436  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0303  SPFH domain-containing protein  24.84 
 
 
364 aa  47  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.496264  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0235  band 7 protein  26.63 
 
 
331 aa  46.6  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.144192 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2198  band 7 protein  25.21 
 
 
333 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1730  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  19.86 
 
 
437 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0749  band 7 protein  27.01 
 
 
340 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.810157  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5610  band 7 protein  25.71 
 
 
265 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.606547  normal  0.386273 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  24.07 
 
 
292 aa  44.3  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3018  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.79 
 
 
261 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.126407  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2774  HflC protein  22.89 
 
 
294 aa  44.3  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2089  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  21.63 
 
 
259 aa  43.1  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05461  Band 7 protein  22.27 
 
 
268 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.178963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>