128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08236 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_08236  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  542  1e-153  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4200  band 7 protein  44.4 
 
 
268 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525075  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1957  band 7 protein  42.29 
 
 
360 aa  209  3e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0790596  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3709  hypothetical protein  39.59 
 
 
436 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731081  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4360  band 7 protein  32.71 
 
 
307 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4917  band 7 protein  30.88 
 
 
301 aa  142  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149772  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3569  membrane protease subunit  31.66 
 
 
258 aa  129  7.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1185  membrane protease  33.2 
 
 
316 aa  126  5e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2032  band 7 protein  32.25 
 
 
303 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4422  band 7 protein  32.95 
 
 
307 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0850578 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1830  band 7 protein  31.95 
 
 
303 aa  123  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0253  band 7 protein  29.82 
 
 
310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2498  band 7 protein  28.82 
 
 
316 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0362  band 7 protein  26.95 
 
 
321 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2467  band 7 protein  27.9 
 
 
318 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0849083 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1813  band 7 protein  30.64 
 
 
263 aa  87  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2728  hypothetical protein  27.46 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000677949 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0825  band 7 protein  27.71 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0292375 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_54960  predicted protein  28.29 
 
 
269 aa  79  0.00000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00780  prohibitin PHB1, putative  25.93 
 
 
274 aa  78.6  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0179  band 7 protein  26.4 
 
 
363 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41824  predicted protein  26.3 
 
 
282 aa  76.3  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.699109  normal  0.209561 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_54958  prohibitin-like protein  27.27 
 
 
284 aa  76.3  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4464  band 7 protein  25.57 
 
 
268 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0054233  normal  0.226289 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4401  band 7 protein  25.57 
 
 
268 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0815  band 7 protein  26.95 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000157152  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5029  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.22 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.290689  normal  0.430447 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3100  band 7 protein  24.09 
 
 
318 aa  72.4  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49447  predicted protein  25.91 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0166572  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3604  band 7 protein  29.49 
 
 
312 aa  70.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10521 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2987  band 7 protein  29.81 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00686  prohibitin complex subunit Phb1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13470)  24.06 
 
 
280 aa  70.1  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1708  SPFH domain-containing protein  26.73 
 
 
362 aa  69.3  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2924  band 7 protein  29.13 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839077  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0303  SPFH domain-containing protein  25.09 
 
 
364 aa  65.9  0.0000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.496264  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2852  band 7 protein  26.25 
 
 
284 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12799  prohibitin-like protein  25.24 
 
 
244 aa  64.3  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.15456  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00070  proteolysis and peptidolysis-related protein, putative  26.34 
 
 
318 aa  63.9  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0637663  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06073  putative prohibitin (Eurofung)  25.46 
 
 
307 aa  63.2  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.453994  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1405  conserved hypothetical transmembrane protein (SPFH domain / Band 7 family)  23.76 
 
 
356 aa  63.2  0.000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29372  predicted protein  26.27 
 
 
278 aa  63.2  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76983  predicted protein  24.42 
 
 
302 aa  62  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2198  band 7 protein  25.65 
 
 
333 aa  61.6  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0854  cation-transporting ATPase, P-type  24.57 
 
 
364 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1182  membrane protease  23.59 
 
 
299 aa  60.8  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0235  band 7 protein  22.91 
 
 
331 aa  60.1  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.144192 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0317  SPFH domain-containing protein  26.04 
 
 
362 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.134016  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1876  Band 7 protein  25.25 
 
 
372 aa  58.2  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0295  SPFH domain-containing protein  26.04 
 
 
362 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0978  band 7 protein  25 
 
 
312 aa  58.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1448  SPFH domain-containing protein  23.93 
 
 
359 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.125445  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  23.44 
 
 
311 aa  57.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2167  hypothetical protein  23.97 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.772353  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2108  SPFH domain-containing protein  24.56 
 
 
370 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2811  band 7 protein  25.46 
 
 
276 aa  56.2  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103679  hitchhiker  0.00246808 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  25 
 
 
282 aa  55.8  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3018  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.62 
 
 
261 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.126407  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0749  band 7 protein  25.37 
 
 
340 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.810157  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3545  band 7 protein  27.04 
 
 
291 aa  53.9  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.978436  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1029  band 7 protein  22.75 
 
 
340 aa  53.5  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3075  band 7 protein  21.43 
 
 
319 aa  52.4  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0686773 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0051  band 7 protein  24.5 
 
 
317 aa  52  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5185  band 7 protein  24.14 
 
 
277 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.133466 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1730  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.98 
 
 
437 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1173  band 7 protein  27.78 
 
 
279 aa  51.6  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.438016  normal  0.450996 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0768  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.22 
 
 
295 aa  50.8  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.441934 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0867  HflC protein  26.67 
 
 
282 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00264104  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2578  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.27 
 
 
376 aa  49.7  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  21.15 
 
 
336 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  25 
 
 
297 aa  48.9  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  25 
 
 
297 aa  48.9  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  25 
 
 
297 aa  48.9  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  25 
 
 
297 aa  48.9  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6548  band 7 protein  23.79 
 
 
326 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  25.82 
 
 
289 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0929  Band 7 protein  24.19 
 
 
332 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4541  band 7 protein  22.98 
 
 
329 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3236  band 7 protein  21.99 
 
 
295 aa  48.5  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2127  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.78 
 
 
286 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.458205  normal  0.678014 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2451  band 7 protein  24.78 
 
 
286 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  24.22 
 
 
297 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  24.22 
 
 
297 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5109  band 7 protein  22.98 
 
 
326 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000505876  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  29.7 
 
 
298 aa  47  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  29.7 
 
 
297 aa  47  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0728  band 7 protein  26.67 
 
 
276 aa  46.2  0.0005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  29.7 
 
 
297 aa  46.2  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0038  band 7 protein  21.24 
 
 
302 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3397  band 7 protein  26.74 
 
 
279 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0145  putative transmembrane protein  21.24 
 
 
302 aa  45.8  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.943019  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  24.08 
 
 
283 aa  45.8  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0944  band 7 protein  22.18 
 
 
331 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188485  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2315  band 7 protein  23.46 
 
 
345 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1845  band 7 protein  26.28 
 
 
280 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1320  HflC protein  23.04 
 
 
286 aa  45.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.422043  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2774  HflC protein  21.05 
 
 
294 aa  45.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0862  band 7 protein  20.97 
 
 
336 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  23.96 
 
 
292 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  24.66 
 
 
292 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3885  band 7 protein  26.51 
 
 
290 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282263  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>