More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2987 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2987  band 7 protein  100 
 
 		 315 aa  614  1e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2924  band 7 protein  91.19 
 
 		 318 aa  545  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3604  band 7 protein  80.06 
 
 		 312 aa  465  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10521 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0815  band 7 protein  42.55 
 
 		 278 aa  222  8e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000157152  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0825  band 7 protein  44.62 
 
 		 287 aa  204  2e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0292375 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2167  hypothetical protein  42.69 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.772353  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1813  band 7 protein  34.73 
 
 		 263 aa  166  5e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2852  band 7 protein  36.86 
 
 		 284 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4464  band 7 protein  31.65 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0054233  normal  0.226289 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4401  band 7 protein  31.65 
 
 		 268 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5029  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.68 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.290689  normal  0.430447 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3545  band 7 protein  37.4 
 
 		 291 aa  139  6e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.978436  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3018  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.45 
 
 		 261 aa  139  8.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.126407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3397  band 7 protein  35.84 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1873  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.56 
 
 		 280 aa  135  8e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0154028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0512  band 7 protein  37.77 
 
 		 282 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000338316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0496  band 7 protein  37.77 
 
 		 282 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49447  predicted protein  34.92 
 
 		 275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0166572  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00686  prohibitin complex subunit Phb1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13470)  36.97 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0728  band 7 protein  28.57 
 
 		 276 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41824  predicted protein  36.53 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.699109  normal  0.209561 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29372  predicted protein  33.95 
 
 		 278 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76983  predicted protein  35.35 
 
 		 302 aa  126  5e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_54960  predicted protein  35.09 
 
 		 269 aa  125  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12799  prohibitin-like protein  36.22 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.15456  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06073  putative prohibitin (Eurofung)  33.64 
 
 		 307 aa  122  8e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.453994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3236  band 7 protein  29.93 
 
 		 295 aa  122  9e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00780  prohibitin PHB1, putative  35.38 
 
 		 274 aa  120  3e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_54958  prohibitin-like protein  33.94 
 
 		 284 aa  120  3.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3629  band 7 protein  30.27 
 
 		 298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00841169  hitchhiker  0.00129487 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1845  band 7 protein  38.46 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0978  band 7 protein  30.58 
 
 		 312 aa  116  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00070  proteolysis and peptidolysis-related protein, putative  32.63 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0637663  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2811  band 7 protein  32.56 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103679  hitchhiker  0.00246808 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04831  Band 7 protein  26.35 
 
 		 267 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.297877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4057  band 7 protein  34.05 
 
 		 287 aa  102  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3650  band 7 protein  30.17 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0210038  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1810  Band 7 protein  27.11 
 
 		 264 aa  94.7  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2089  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.06 
 
 		 259 aa  92  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3042  band 7 protein  28.75 
 
 		 295 aa  92  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0444  band 7 protein  26.85 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12321  Band 7 protein  26.5 
 
 		 266 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0524  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.11 
 
 		 264 aa  90.9  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.675016 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0448  band 7 protein  27.61 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3581  band 7 protein  27.61 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1405  conserved hypothetical transmembrane protein (SPFH domain / Band 7 family)  26.2 
 
 		 356 aa  89.7  5e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0179  band 7 protein  27.74 
 
 		 363 aa  90.1  5e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1815  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.13 
 
 		 267 aa  89.7  6e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05391  Band 7 protein  24.13 
 
 		 267 aa  89.7  6e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1708  SPFH domain-containing protein  26.2 
 
 		 362 aa  88.2  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05091  Band 7 protein  25.44 
 
 		 267 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05381  Band 7 protein  25.44 
 
 		 267 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0445  hflC protein, putative  26.41 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1062  band 7 protein  27.12 
 
 		 299 aa  86.7  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3398  band 7 protein  26.87 
 
 		 295 aa  86.7  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3910  band 7 protein  26.47 
 
 		 295 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3837  band 7 protein  26.47 
 
 		 295 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.712498 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4033  band 7 protein  26.47 
 
 		 295 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0423  band 7 protein  26.47 
 
 		 295 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0436  Band 7 protein  24.33 
 
 		 249 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.155422  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0483  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.13 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2467  band 7 protein  29.11 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0849083 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0317  SPFH domain-containing protein  26.77 
 
 		 362 aa  83.6  0.000000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.134016  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0295  SPFH domain-containing protein  26.77 
 
 		 362 aa  83.6  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0362  band 7 protein  28.62 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2402  hypothetical protein  29.37 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0727327  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05461  Band 7 protein  24.13 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.178963  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2636  SPFH/band 7 family protein  23.47 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156489  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2721  band 7 protein  23.47 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000149129  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1572  SPFH/band 7 family protein  23.43 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.915425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2498  band 7 protein  29.28 
 
 		 316 aa  79  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1876  Band 7 protein  26.83 
 
 		 372 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2373  band 7 protein  27.48 
 
 		 304 aa  79  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1448  SPFH domain-containing protein  24.91 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.125445  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1185  membrane protease  27.34 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0303  SPFH domain-containing protein  27.34 
 
 		 364 aa  76.6  0.0000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.496264  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5185  band 7 protein  24.26 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.133466 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4200  band 7 protein  27.09 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4917  band 7 protein  29.54 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1957  band 7 protein  26.38 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0790596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3100  band 7 protein  25.48 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3855  band 7 protein  27.57 
 
 		 366 aa  72.8  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00173128  unclonable  0.00000981253 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0565  band 7 protein  26.36 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2108  SPFH domain-containing protein  25.97 
 
 		 370 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3076  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.62 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1730  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.71 
 
 		 437 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08236  hypothetical protein  29.95 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2990  band 7 protein  27.83 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0854  cation-transporting ATPase, P-type  26.54 
 
 		 364 aa  66.6  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0657  band 7 protein  29.05 
 
 		 386 aa  66.2  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398051  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1938  band 7 protein  29.2 
 
 		 381 aa  65.9  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2911  band 7 protein  26.69 
 
 		 376 aa  65.9  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.484171  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5610  band 7 protein  25 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.606547  normal  0.386273 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0253  band 7 protein  23.98 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2641  band 7 protein  25.55 
 
 		 409 aa  62  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06060  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  26.22 
 
 		 378 aa  62  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1830  band 7 protein  27.56 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0235  band 7 protein  30.06 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.144192 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0841  band 7 protein  25.7 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0145  putative transmembrane protein  27.5 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.943019  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>