152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0235 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0235  band 7 protein  100 
 
 		 331 aa  652    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.144192 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0749  band 7 protein  77.84 
 
 		 340 aa  489  1e-137  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.810157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1029  band 7 protein  79.94 
 
 		 340 aa  461  1e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2198  band 7 protein  75 
 
 		 333 aa  425  1e-118  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0179  band 7 protein  32.6 
 
 		 363 aa  80.9  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3236  band 7 protein  26.88 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1185  membrane protease  29.5 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2032  band 7 protein  27.5 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3629  band 7 protein  27.05 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00841169  hitchhiker  0.00129487 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1830  band 7 protein  32.08 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0253  band 7 protein  28.12 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1708  SPFH domain-containing protein  26.72 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0317  SPFH domain-containing protein  30 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.134016  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0295  SPFH domain-containing protein  30 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1405  conserved hypothetical transmembrane protein (SPFH domain / Band 7 family)  30 
 
 		 356 aa  69.3  0.00000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0303  SPFH domain-containing protein  29.03 
 
 		 364 aa  66.2  0.0000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.496264  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2108  SPFH domain-containing protein  27.31 
 
 		 370 aa  66.2  0.0000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3709  hypothetical protein  23.53 
 
 		 436 aa  65.9  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2467  band 7 protein  26.55 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0849083 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0362  band 7 protein  23.97 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08236  hypothetical protein  25.11 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4917  band 7 protein  26.54 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0825  band 7 protein  26.02 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0292375 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0978  band 7 protein  26.36 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1188  band 7 protein  24.12 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.283944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41824  predicted protein  24.42 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.699109  normal  0.209561 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2498  band 7 protein  23.87 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4360  band 7 protein  24.41 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0854  cation-transporting ATPase, P-type  25.97 
 
 		 364 aa  60.1  0.00000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  26.57 
 
 		 398 aa  59.3  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12799  prohibitin-like protein  24.27 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.15456  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1334  band 7/Mec-2 family protein  25.55 
 
 		 326 aa  59.3  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2987  band 7 protein  25.11 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3604  band 7 protein  25.46 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10521 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2924  band 7 protein  24.68 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2756  band 7 protein  27.78 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00780  prohibitin PHB1, putative  25.2 
 
 		 274 aa  57  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4422  band 7 protein  23.99 
 
 		 307 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0850578 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4200  band 7 protein  26.27 
 
 		 268 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1055  band 7 protein  25.54 
 
 		 312 aa  53.9  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  28.06 
 
 		 311 aa  53.9  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3569  membrane protease subunit  26.83 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06060  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  24.84 
 
 		 378 aa  50.8  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04041  modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor  28.57 
 
 		 419 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.298849  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3819  HflK protein  28.57 
 
 		 419 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0613795  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0327  HflK protein  27.27 
 
 		 382 aa  50.8  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1813  band 7 protein  26.49 
 
 		 263 aa  50.8  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0548  protease subunit HflK  28.25 
 
 		 380 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0524  protease subunit HflK  28.25 
 
 		 380 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04003  hypothetical protein  28.57 
 
 		 419 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.317629  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1316  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.27 
 
 		 316 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0215756  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1132  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.27 
 
 		 316 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4705  FtsH protease regulator HflK  28.57 
 
 		 419 aa  50.8  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.714132  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5690  FtsH protease regulator HflK  28.57 
 
 		 419 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.440871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4416  FtsH protease regulator HflK  28.57 
 
 		 419 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.953832  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4732  FtsH protease regulator HflK  28.57 
 
 		 419 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.938149  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3839  FtsH protease regulator HflK  28.57 
 
 		 419 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.910091  hitchhiker  0.000000232279 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  28.21 
 
 		 395 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  27.69 
 
 		 400 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0815  band 7 protein  24.9 
 
 		 278 aa  50.4  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000157152  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1815  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.61 
 
 		 267 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0579  HflK protein  32.94 
 
 		 386 aa  50.1  0.00005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05391  Band 7 protein  23.61 
 
 		 267 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0728  band 7 protein  26.69 
 
 		 276 aa  49.7  0.00007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  30.46 
 
 		 418 aa  49.3  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1714  band 7 protein  25.6 
 
 		 314 aa  48.5  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1052  band 7 protein  25.57 
 
 		 298 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4645  FtsH protease regulator HflK  28.16 
 
 		 419 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.14387 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1663  hypothetical protein  25.46 
 
 		 341 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0672559  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1945  bacteriophage/transposase fusion protein  26.2 
 
 		 462 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  28.21 
 
 		 389 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0600  HflK protein  29.58 
 
 		 381 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0138092  hitchhiker  0.00143389 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3430  HflK protein  29.58 
 
 		 381 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0909026  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2811  band 7 protein  23.89 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103679  hitchhiker  0.00246808 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0599  HflK protein  28.38 
 
 		 381 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0263631  hitchhiker  0.00000131875 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1730  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.39 
 
 		 437 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  25.58 
 
 		 435 aa  47.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1448  SPFH domain-containing protein  23.53 
 
 		 359 aa  47.8  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.125445  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2939  band 7 protein  24.75 
 
 		 312 aa  47.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0124635  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00686  prohibitin complex subunit Phb1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13470)  21.76 
 
 		 280 aa  47  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0524  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.15 
 
 		 264 aa  47.4  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.675016 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5610  band 7 protein  29.63 
 
 		 265 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.606547  normal  0.386273 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1957  band 7 protein  26.04 
 
 		 360 aa  47  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0790596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  28.51 
 
 		 420 aa  47.4  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0444  band 7 protein  24.91 
 
 		 295 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1878  band 7 protein  25.37 
 
 		 311 aa  47.4  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292524  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4641  FtsH protease regulator HflK  29.59 
 
 		 419 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.641221  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  25 
 
 		 351 aa  47.4  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4724  FtsH protease regulator HflK  29.59 
 
 		 419 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4760  FtsH protease regulator HflK  29.59 
 
 		 419 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4781  FtsH protease regulator HflK  29.59 
 
 		 419 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.932984  normal  0.393456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4631  FtsH protease regulator HflK  29.59 
 
 		 419 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49447  predicted protein  23.39 
 
 		 275 aa  46.6  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0166572  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0014  band 7 protein  27.78 
 
 		 267 aa  46.6  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0445  hflC protein, putative  23.53 
 
 		 296 aa  46.6  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77854  stomatin family protein  22.67 
 
 		 367 aa  46.2  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3023  hflK protein  30.05 
 
 		 377 aa  46.2  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000561401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2736  Protein HflK  28 
 
 		 382 aa  46.2  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12799  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  24.56 
 
 		 447 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0534  bacteriophage/transposase fusion protein  27.09 
 
 		 399 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>