28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2728 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2728  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  600  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000677949 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1175  band 7 protein  32.38 
 
 		 350 aa  103  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4200  band 7 protein  25.67 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4917  band 7 protein  27.56 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149772  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08236  hypothetical protein  27.46 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2032  band 7 protein  26.7 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4360  band 7 protein  25.65 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3569  membrane protease subunit  24.88 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1830  band 7 protein  26.42 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1957  band 7 protein  23.36 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0790596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4422  band 7 protein  25 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0850578 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3709  hypothetical protein  26.36 
 
 		 436 aa  55.8  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1182  membrane protease  22.87 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2636  SPFH/band 7 family protein  25.45 
 
 		 308 aa  52.4  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156489  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1572  SPFH/band 7 family protein  25.45 
 
 		 295 aa  52.4  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.915425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2721  band 7 protein  25.45 
 
 		 308 aa  52.4  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000149129  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0253  band 7 protein  27.08 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0362  band 7 protein  22.77 
 
 		 321 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2467  band 7 protein  24.22 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0849083 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2498  band 7 protein  25.86 
 
 		 316 aa  48.5  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2852  band 7 protein  28.03 
 
 		 284 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1185  membrane protease  22.89 
 
 		 316 aa  46.6  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4464  band 7 protein  25.16 
 
 		 268 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0054233  normal  0.226289 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4401  band 7 protein  25.16 
 
 		 268 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0278  hypothetical protein  33.77 
 
 		 116 aa  43.1  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0728  band 7 protein  25.58 
 
 		 276 aa  43.1  0.006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1093  band 7 protein  24.1 
 
 		 650 aa  42.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.807858  normal  0.192088 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0825  band 7 protein  22.18 
 
 		 287 aa  42.7  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0292375 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>