More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2924 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2924  band 7 protein  100 
 
 
318 aa  624  1e-178  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839077  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2987  band 7 protein  93.31 
 
 
315 aa  528  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3604  band 7 protein  78.3 
 
 
312 aa  455  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10521 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0815  band 7 protein  42.34 
 
 
278 aa  220  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000157152  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0825  band 7 protein  44.84 
 
 
287 aa  207  3e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0292375 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2167  hypothetical protein  45.15 
 
 
282 aa  188  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.772353  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1813  band 7 protein  36.36 
 
 
263 aa  171  1e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2852  band 7 protein  37.23 
 
 
284 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4464  band 7 protein  33.47 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0054233  normal  0.226289 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4401  band 7 protein  33.47 
 
 
268 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5029  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.68 
 
 
267 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.290689  normal  0.430447 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3397  band 7 protein  39.41 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3018  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.72 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.126407  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3545  band 7 protein  35.47 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.978436  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1873  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.71 
 
 
280 aa  140  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0154028  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0496  band 7 protein  38.98 
 
 
282 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0512  band 7 protein  38.98 
 
 
282 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000338316 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41824  predicted protein  36.41 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.699109  normal  0.209561 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00686  prohibitin complex subunit Phb1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13470)  37.62 
 
 
280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0728  band 7 protein  29.66 
 
 
276 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49447  predicted protein  34.25 
 
 
275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0166572  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29372  predicted protein  35.71 
 
 
278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76983  predicted protein  35.35 
 
 
302 aa  125  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12799  prohibitin-like protein  36.36 
 
 
244 aa  125  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.15456  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3236  band 7 protein  30.74 
 
 
295 aa  123  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_54960  predicted protein  35.81 
 
 
269 aa  122  7e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1845  band 7 protein  37.87 
 
 
280 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3629  band 7 protein  31.3 
 
 
298 aa  120  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00841169  hitchhiker  0.00129487 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06073  putative prohibitin (Eurofung)  34.11 
 
 
307 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.453994  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00780  prohibitin PHB1, putative  35.41 
 
 
274 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_54958  prohibitin-like protein  34.4 
 
 
284 aa  119  6e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00070  proteolysis and peptidolysis-related protein, putative  32.12 
 
 
318 aa  117  3e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0637663  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0978  band 7 protein  29.83 
 
 
312 aa  113  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2811  band 7 protein  32.02 
 
 
276 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103679  hitchhiker  0.00246808 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04831  Band 7 protein  26.6 
 
 
267 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.297877  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3650  band 7 protein  30.1 
 
 
305 aa  99.4  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0210038  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4057  band 7 protein  32.97 
 
 
287 aa  99  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2089  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.63 
 
 
259 aa  95.5  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0444  band 7 protein  26.51 
 
 
295 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1810  Band 7 protein  26.76 
 
 
264 aa  92.8  6e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05381  Band 7 protein  26.83 
 
 
267 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05091  Band 7 protein  26.83 
 
 
267 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0179  band 7 protein  27.76 
 
 
363 aa  91.3  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0445  hflC protein, putative  25.84 
 
 
296 aa  90.9  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1062  band 7 protein  27.15 
 
 
299 aa  91.3  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1815  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.83 
 
 
267 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05391  Band 7 protein  24.83 
 
 
267 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0524  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.01 
 
 
264 aa  89.7  5e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.675016 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0448  band 7 protein  26.94 
 
 
295 aa  90.1  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3581  band 7 protein  26.94 
 
 
295 aa  90.1  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3042  band 7 protein  27.48 
 
 
295 aa  89.7  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1708  SPFH domain-containing protein  25.18 
 
 
362 aa  89.4  8e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0483  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.52 
 
 
267 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12321  Band 7 protein  26.5 
 
 
266 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1405  conserved hypothetical transmembrane protein (SPFH domain / Band 7 family)  25.91 
 
 
356 aa  88.6  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05461  Band 7 protein  25.52 
 
 
268 aa  86.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.178963  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3398  band 7 protein  26.2 
 
 
295 aa  86.7  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0423  band 7 protein  25.82 
 
 
295 aa  85.9  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3837  band 7 protein  25.82 
 
 
295 aa  85.9  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.712498 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4033  band 7 protein  25.82 
 
 
295 aa  85.9  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3910  band 7 protein  25.82 
 
 
295 aa  85.9  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0317  SPFH domain-containing protein  26.77 
 
 
362 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.134016  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0436  Band 7 protein  25.2 
 
 
249 aa  84.3  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.155422  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2402  hypothetical protein  30.07 
 
 
210 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0727327  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2467  band 7 protein  29.55 
 
 
318 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0849083 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0295  SPFH domain-containing protein  26.77 
 
 
362 aa  84.3  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2636  SPFH/band 7 family protein  23.65 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156489  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2721  band 7 protein  23.65 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000149129  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1572  SPFH/band 7 family protein  24.05 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.915425  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5185  band 7 protein  23.9 
 
 
277 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.133466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3855  band 7 protein  25.74 
 
 
366 aa  79.7  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00173128  unclonable  0.00000981253 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1185  membrane protease  28.19 
 
 
316 aa  79.7  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1448  SPFH domain-containing protein  26.04 
 
 
359 aa  79.3  0.00000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.125445  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2498  band 7 protein  29.57 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0565  band 7 protein  27.02 
 
 
357 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4200  band 7 protein  27.85 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525075  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0303  SPFH domain-containing protein  27.24 
 
 
364 aa  76.6  0.0000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.496264  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0362  band 7 protein  27.18 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2373  band 7 protein  27.24 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4917  band 7 protein  29.51 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149772  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3076  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.89 
 
 
302 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1876  Band 7 protein  26.67 
 
 
372 aa  74.3  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1957  band 7 protein  25.56 
 
 
360 aa  72.8  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0790596  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2108  SPFH domain-containing protein  25.58 
 
 
370 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3100  band 7 protein  25.16 
 
 
318 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1938  band 7 protein  29.46 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2990  band 7 protein  27.39 
 
 
384 aa  69.7  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0657  band 7 protein  30.66 
 
 
386 aa  69.3  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398051  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06060  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  26.59 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0253  band 7 protein  24.28 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1730  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.71 
 
 
437 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0854  cation-transporting ATPase, P-type  26.54 
 
 
364 aa  67  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08236  hypothetical protein  30.39 
 
 
271 aa  67  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5610  band 7 protein  25 
 
 
265 aa  63.5  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.606547  normal  0.386273 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2911  band 7 protein  26.41 
 
 
376 aa  62.4  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.484171  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  24.86 
 
 
405 aa  62  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0841  band 7 protein  25.7 
 
 
399 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0235  band 7 protein  30.06 
 
 
331 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.144192 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1830  band 7 protein  28.11 
 
 
303 aa  61.6  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  27.04 
 
 
283 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>