More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3076 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3076  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  100 
 
 
302 aa  609  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3042  band 7 protein  57.19 
 
 
295 aa  329  4e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1062  band 7 protein  56.79 
 
 
299 aa  328  6e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3398  band 7 protein  58.24 
 
 
295 aa  323  3e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0445  hflC protein, putative  54.58 
 
 
296 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3837  band 7 protein  57.14 
 
 
295 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.712498 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4033  band 7 protein  57.14 
 
 
295 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0423  band 7 protein  57.14 
 
 
295 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3910  band 7 protein  57.14 
 
 
295 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0448  band 7 protein  57.14 
 
 
295 aa  319  3e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3581  band 7 protein  57.14 
 
 
295 aa  319  3e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0444  band 7 protein  55.36 
 
 
295 aa  319  3e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2721  band 7 protein  51.72 
 
 
308 aa  313  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000149129  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2636  SPFH/band 7 family protein  51.72 
 
 
308 aa  313  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156489  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1572  SPFH/band 7 family protein  51.93 
 
 
295 aa  313  2.9999999999999996e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.915425  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3650  band 7 protein  51.59 
 
 
305 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0210038  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4057  band 7 protein  48.7 
 
 
287 aa  248  7e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0978  band 7 protein  30.69 
 
 
312 aa  152  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3236  band 7 protein  29.97 
 
 
295 aa  149  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3629  band 7 protein  32.12 
 
 
298 aa  146  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00841169  hitchhiker  0.00129487 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2373  band 7 protein  31.12 
 
 
304 aa  103  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0815  band 7 protein  29.08 
 
 
278 aa  97.1  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000157152  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1813  band 7 protein  27.33 
 
 
263 aa  85.9  8e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2811  band 7 protein  28.41 
 
 
276 aa  84.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103679  hitchhiker  0.00246808 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0825  band 7 protein  28.26 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0292375 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0525  membrane protease subunit HflC  31.93 
 
 
304 aa  83.2  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0549  membrane protease subunit HflC  28.74 
 
 
304 aa  80.9  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2852  band 7 protein  26.57 
 
 
284 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0051  hypothetical protein  40.43 
 
 
276 aa  79.3  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.10901e-82  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2924  band 7 protein  28.14 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839077  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  29.76 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5029  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.09 
 
 
267 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.290689  normal  0.430447 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  29.48 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  26.56 
 
 
288 aa  75.1  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  30.17 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3604  band 7 protein  29.09 
 
 
312 aa  72.8  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10521 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  29.84 
 
 
284 aa  72.4  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2987  band 7 protein  26.87 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2089  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.74 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2167  hypothetical protein  26.22 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.772353  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4464  band 7 protein  25.68 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0054233  normal  0.226289 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5670  protease subunit HflC  28.42 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4943  HflC protein  26.34 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00429597 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  29.27 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65270  protease subunit HflC  28.42 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  25 
 
 
334 aa  68.9  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  25 
 
 
334 aa  68.9  0.00000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  25 
 
 
334 aa  68.9  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4891  HflC protein  25.81 
 
 
289 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191561  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4767  HflC protein  25.81 
 
 
289 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  29.05 
 
 
298 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4401  band 7 protein  25.23 
 
 
268 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3718  FtsH protease regulator HflC  25.57 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0820553  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0565  band 7 protein  27.97 
 
 
357 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  26.72 
 
 
289 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  25.44 
 
 
335 aa  66.6  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  25.91 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  29.15 
 
 
297 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  27.84 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04042  modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor  24.25 
 
 
334 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.040502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3818  HflC protein  24.25 
 
 
334 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4646  FtsH protease regulator HflC  24.25 
 
 
334 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.175793 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4417  FtsH protease regulator HflC  24.25 
 
 
334 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0436  Band 7 protein  26.92 
 
 
249 aa  65.1  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.155422  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3838  FtsH protease regulator HflC  24.25 
 
 
334 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4706  FtsH protease regulator HflC  24.25 
 
 
334 aa  65.1  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04004  hypothetical protein  24.25 
 
 
334 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5691  FtsH protease regulator HflC  24.25 
 
 
334 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  29.55 
 
 
297 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  29.55 
 
 
297 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4733  FtsH protease regulator HflC  24.25 
 
 
334 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2467  band 7 protein  25.08 
 
 
318 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0849083 
 
 
-
 
NC_004310  BR1396  hflC protein  25.33 
 
 
300 aa  64.7  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685975  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0728  band 7 protein  26.67 
 
 
276 aa  64.7  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  29.55 
 
 
318 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  28.63 
 
 
287 aa  64.3  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  26.32 
 
 
283 aa  64.3  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1352  HflC protein  25.33 
 
 
300 aa  64.7  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  26.32 
 
 
283 aa  64.3  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  27.16 
 
 
300 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4642  FtsH protease regulator HflC  24.25 
 
 
334 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4782  FtsH protease regulator HflC  24.25 
 
 
334 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  0.242 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3916  FtsH protease regulator HflC  25.44 
 
 
331 aa  63.9  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4632  FtsH protease regulator HflC  24.25 
 
 
334 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0253  band 7 protein  24.41 
 
 
310 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  29.55 
 
 
311 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4761  FtsH protease regulator HflC  24.25 
 
 
334 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3308  HflC protein  30.3 
 
 
292 aa  63.9  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4725  FtsH protease regulator HflC  24.25 
 
 
334 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1620  band 7 protein  27.95 
 
 
284 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000904409  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0061  band 7 protein  27.13 
 
 
305 aa  63.5  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313093  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  27.69 
 
 
283 aa  63.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  29.44 
 
 
308 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0578  FtsH protease regulator HflC  23.27 
 
 
333 aa  63.2  0.000000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  28.74 
 
 
297 aa  62.8  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  26 
 
 
289 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  27.94 
 
 
293 aa  62.8  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0165  HflC protein  29.84 
 
 
286 aa  62.8  0.000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225021  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0061  band 7 protein  26.74 
 
 
305 aa  62  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0011407  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0538  FtsH protease regulator HflC  24.65 
 
 
331 aa  62.4  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.255691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>