More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1062 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1062  band 7 protein  100 
 
 		 299 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0444  band 7 protein  87.76 
 
 		 295 aa  523  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0445  hflC protein, putative  86.36 
 
 		 296 aa  518  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3398  band 7 protein  92.4 
 
 		 295 aa  507  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0448  band 7 protein  87.06 
 
 		 295 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3581  band 7 protein  87.06 
 
 		 295 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3910  band 7 protein  90.49 
 
 		 295 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3837  band 7 protein  90.49 
 
 		 295 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.712498 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4033  band 7 protein  90.49 
 
 		 295 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3042  band 7 protein  84.51 
 
 		 295 aa  498  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0423  band 7 protein  90.49 
 
 		 295 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3076  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  56.1 
 
 		 302 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3650  band 7 protein  53.17 
 
 		 305 aa  319  3e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0210038  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2721  band 7 protein  46.86 
 
 		 308 aa  286  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000149129  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2636  SPFH/band 7 family protein  46.86 
 
 		 308 aa  286  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156489  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1572  SPFH/band 7 family protein  48.6 
 
 		 295 aa  285  5e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.915425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4057  band 7 protein  51.92 
 
 		 287 aa  265  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3236  band 7 protein  29.86 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0978  band 7 protein  29.6 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3629  band 7 protein  31.42 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00841169  hitchhiker  0.00129487 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2373  band 7 protein  31.8 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  27.84 
 
 		 283 aa  94.4  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  27.84 
 
 		 283 aa  94.4  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0815  band 7 protein  28.77 
 
 		 278 aa  90.1  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000157152  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2811  band 7 protein  29.1 
 
 		 276 aa  85.5  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103679  hitchhiker  0.00246808 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0825  band 7 protein  30.19 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0292375 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2924  band 7 protein  27.15 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2498  band 7 protein  24.56 
 
 		 316 aa  79  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3604  band 7 protein  27.9 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10521 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1813  band 7 protein  24.66 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0253  band 7 protein  25.48 
 
 		 310 aa  75.5  0.0000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0525  membrane protease subunit HflC  27.69 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0666  HflC protein  30.42 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2987  band 7 protein  27.12 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2852  band 7 protein  24.2 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0703  HflC protein  26.59 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2167  hypothetical protein  24.53 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.772353  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0549  membrane protease subunit HflC  26.36 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  27.16 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1320  HflC protein  24.03 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.422043  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  26.99 
 
 		 300 aa  67  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  22.59 
 
 		 334 aa  67  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  22.59 
 
 		 334 aa  67  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  22.59 
 
 		 334 aa  67  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  26.64 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4401  band 7 protein  23.84 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4464  band 7 protein  24.46 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0054233  normal  0.226289 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  27.85 
 
 		 386 aa  65.1  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  25.66 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4891  HflC protein  26.58 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3718  FtsH protease regulator HflC  23.57 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0820553  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4767  HflC protein  26.58 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  26.17 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  25.28 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0051  hypothetical protein  44.87 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.10901e-82  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  24.44 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3100  band 7 protein  21.91 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  23.02 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0728  band 7 protein  24.51 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2410  band 7 protein  28.04 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1405  conserved hypothetical transmembrane protein (SPFH domain / Band 7 family)  22.06 
 
 		 356 aa  62.4  0.000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0402  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.49 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.674809  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3916  FtsH protease regulator HflC  23.23 
 
 		 331 aa  62.4  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  25.1 
 
 		 292 aa  62.4  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4943  HflC protein  25.74 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429597 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  26.56 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2089  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  22.93 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1620  band 7 protein  26.84 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000904409  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  22.47 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2774  HflC protein  25.32 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0565  band 7 protein  23.37 
 
 		 357 aa  58.9  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  24.42 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  31.82 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4682  HflC protein  25.43 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1708  SPFH domain-containing protein  23.25 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3855  band 7 protein  23.92 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00173128  unclonable  0.00000981253 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0729  band 7 protein  24.8 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  21.45 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2912  band 7 protein  24.62 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4599  band 7 protein  21.18 
 
 		 315 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.235432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5029  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.78 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.290689  normal  0.430447 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7190  membrane protease  24.45 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.996167  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  23.83 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5670  protease subunit HflC  24.59 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65270  protease subunit HflC  24.59 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0313  hflK protein, putative  27.99 
 
 		 329 aa  57  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002262  HflC protein  22.79 
 
 		 326 aa  57  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00114995  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1330  band 7 protein  25 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.373996  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4200  band 7 protein  27.49 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2657  HflC protein  23.86 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.267381 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.29 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2884  HflC protein  23.86 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0179  band 7 protein  21.25 
 
 		 363 aa  56.2  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  23.68 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1178  HflC protein  25.83 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0578  FtsH protease regulator HflC  22.15 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  27.12 
 
 		 298 aa  55.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1161  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.37 
 
 		 248 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0328749  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0546  band 7 protein  26.67 
 
 		 321 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.141475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>