48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0565 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3855  band 7 protein  88.24 
 
 		 366 aa  637    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00173128  unclonable  0.00000981253 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0565  band 7 protein  100 
 
 		 357 aa  717    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3593  band 7 protein  63.69 
 
 		 322 aa  427  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000669188 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2924  band 7 protein  27.31 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3650  band 7 protein  25.56 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0210038  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0815  band 7 protein  26.48 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000157152  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2987  band 7 protein  26.58 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2721  band 7 protein  23 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000149129  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2636  SPFH/band 7 family protein  23 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156489  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1572  SPFH/band 7 family protein  23.05 
 
 		 295 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.915425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3604  band 7 protein  26.16 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10521 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0825  band 7 protein  25.1 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0292375 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3076  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.97 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3398  band 7 protein  24.54 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0444  band 7 protein  23.39 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4033  band 7 protein  24.29 
 
 		 295 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3837  band 7 protein  24.29 
 
 		 295 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.712498 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3910  band 7 protein  24.29 
 
 		 295 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0423  band 7 protein  24.29 
 
 		 295 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1062  band 7 protein  23.29 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0445  hflC protein, putative  23.73 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3042  band 7 protein  23.76 
 
 		 295 aa  57  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3581  band 7 protein  23.81 
 
 		 295 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0448  band 7 protein  23.81 
 
 		 295 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7190  membrane protease  25.08 
 
 		 367 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.996167  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  24.66 
 
 		 418 aa  50.4  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00686  prohibitin complex subunit Phb1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13470)  26.98 
 
 		 280 aa  50.4  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3236  band 7 protein  23.31 
 
 		 295 aa  50.1  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4599  band 7 protein  26 
 
 		 315 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.235432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  28.89 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49447  predicted protein  23.59 
 
 		 275 aa  49.3  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0166572  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3629  band 7 protein  22.71 
 
 		 298 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00841169  hitchhiker  0.00129487 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1873  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.92 
 
 		 280 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0154028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3397  band 7 protein  23.83 
 
 		 279 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0814  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.6 
 
 		 257 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000120225  hitchhiker  0.0000000481478 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_54960  predicted protein  21.74 
 
 		 269 aa  46.6  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5029  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.62 
 
 		 267 aa  46.2  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.290689  normal  0.430447 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  24.9 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4057  band 7 protein  24.1 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_54958  prohibitin-like protein  21.03 
 
 		 284 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  25.74 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0014  band 7 protein  23.7 
 
 		 267 aa  44.3  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0579  HflK protein  26.24 
 
 		 386 aa  44.7  0.003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0549  membrane protease subunit HflC  25.29 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00780  prohibitin PHB1, putative  24.08 
 
 		 274 aa  43.9  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0496  band 7 protein  23.83 
 
 		 282 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0512  band 7 protein  23.83 
 
 		 282 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000338316 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3545  band 7 protein  21.28 
 
 		 291 aa  43.1  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.978436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>