More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4033 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_3910  band 7 protein  100 
 
 
295 aa  597  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4033  band 7 protein  100 
 
 
295 aa  597  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3837  band 7 protein  100 
 
 
295 aa  597  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.712498 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0423  band 7 protein  100 
 
 
295 aa  597  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0444  band 7 protein  94.92 
 
 
295 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0445  hflC protein, putative  92.2 
 
 
296 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0448  band 7 protein  93.9 
 
 
295 aa  542  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3581  band 7 protein  94.24 
 
 
295 aa  542  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3398  band 7 protein  95.25 
 
 
295 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1062  band 7 protein  86.01 
 
 
299 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3042  band 7 protein  84.93 
 
 
295 aa  513  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3650  band 7 protein  53.06 
 
 
305 aa  322  5e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0210038  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3076  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  55.36 
 
 
302 aa  315  8e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2721  band 7 protein  50.35 
 
 
308 aa  284  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000149129  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2636  SPFH/band 7 family protein  50.35 
 
 
308 aa  284  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156489  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1572  SPFH/band 7 family protein  50.35 
 
 
295 aa  283  2.0000000000000002e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.915425  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4057  band 7 protein  50 
 
 
287 aa  253  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3236  band 7 protein  31.45 
 
 
295 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3629  band 7 protein  32.08 
 
 
298 aa  150  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00841169  hitchhiker  0.00129487 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0978  band 7 protein  29.54 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2373  band 7 protein  30.74 
 
 
304 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  28.29 
 
 
283 aa  90.9  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  28.29 
 
 
283 aa  90.9  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0815  band 7 protein  27.96 
 
 
278 aa  88.6  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000157152  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0825  band 7 protein  30.71 
 
 
287 aa  87.8  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0292375 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2852  band 7 protein  25.63 
 
 
284 aa  86.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2811  band 7 protein  27.87 
 
 
276 aa  84.3  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103679  hitchhiker  0.00246808 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2924  band 7 protein  26.16 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839077  normal