More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4033 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_3910  band 7 protein  100 
 
 
295 aa  597  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4033  band 7 protein  100 
 
 
295 aa  597  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3837  band 7 protein  100 
 
 
295 aa  597  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.712498 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0423  band 7 protein  100 
 
 
295 aa  597  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0444  band 7 protein  94.92 
 
 
295 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0445  hflC protein, putative  92.2 
 
 
296 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0448  band 7 protein  93.9 
 
 
295 aa  542  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3581  band 7 protein  94.24 
 
 
295 aa  542  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3398  band 7 protein  95.25 
 
 
295 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1062  band 7 protein  86.01 
 
 
299 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3042  band 7 protein  84.93 
 
 
295 aa  513  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3650  band 7 protein  53.06 
 
 
305 aa  322  5e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0210038  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3076  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  55.36 
 
 
302 aa  315  8e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2721  band 7 protein  50.35 
 
 
308 aa  284  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000149129  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2636  SPFH/band 7 family protein  50.35 
 
 
308 aa  284  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156489  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1572  SPFH/band 7 family protein  50.35 
 
 
295 aa  283  2.0000000000000002e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.915425  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4057  band 7 protein  50 
 
 
287 aa  253  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3236  band 7 protein  31.45 
 
 
295 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3629  band 7 protein  32.08 
 
 
298 aa  150  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00841169  hitchhiker  0.00129487 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0978  band 7 protein  29.54 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2373  band 7 protein  30.74 
 
 
304 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  28.29 
 
 
283 aa  90.9  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  28.29 
 
 
283 aa  90.9  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0815  band 7 protein  27.96 
 
 
278 aa  88.6  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000157152  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0825  band 7 protein  30.71 
 
 
287 aa  87.8  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0292375 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2852  band 7 protein  25.63 
 
 
284 aa  86.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2811  band 7 protein  27.87 
 
 
276 aa  84.3  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103679  hitchhiker  0.00246808 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2924  band 7 protein  26.16 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839077  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3604  band 7 protein  27.64 
 
 
312 aa  81.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10521 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1813  band 7 protein  25.63 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0525  membrane protease subunit HflC  27.91 
 
 
304 aa  80.9  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2987  band 7 protein  25.83 
 
 
315 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  26.82 
 
 
289 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0549  membrane protease subunit HflC  26.74 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4464  band 7 protein  25.17 
 
 
268 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0054233  normal  0.226289 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  27.13 
 
 
287 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5029  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.33 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.290689  normal  0.430447 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4401  band 7 protein  25.17 
 
 
268 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2498  band 7 protein  23.39 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  26.05 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  27.57 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0253  band 7 protein  25.1 
 
 
310 aa  73.2  0.000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0703  HflC protein  25.88 
 
 
281 aa  72  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4891  HflC protein  27.97 
 
 
289 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191561  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4943  HflC protein  27.97 
 
 
289 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00429597 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4767  HflC protein  27.97 
 
 
289 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  25.67 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1320  HflC protein  25.77 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.422043  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3100  band 7 protein  22.61 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  27.02 
 
 
283 aa  69.3  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  26.85 
 
 
283 aa  69.3  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  27.57 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4682  HflC protein  27.59 
 
 
289 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  39.77 
 
 
394 aa  68.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1405  conserved hypothetical transmembrane protein (SPFH domain / Band 7 family)  23.16 
 
 
356 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0666  HflC protein  25.96 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5670  protease subunit HflC  26.03 
 
 
289 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2410  band 7 protein  28.96 
 
 
287 aa  67  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183043  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65270  protease subunit HflC  26.03 
 
 
289 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1708  SPFH domain-containing protein  22.47 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2167  hypothetical protein  25.57 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.772353  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  27 
 
 
284 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  23.15 
 
 
334 aa  65.9  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  23.15 
 
 
334 aa  65.9  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  23.15 
 
 
334 aa  65.9  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  27.72 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0051  hypothetical protein  44.87 
 
 
276 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.10901e-82  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  25.37 
 
 
292 aa  65.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0728  band 7 protein  25.18 
 
 
276 aa  65.1  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0359  band 7 protein  25.1 
 
 
268 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.741854  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  26.83 
 
 
311 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  25.22 
 
 
300 aa  64.3  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0638  HflC protein  26.44 
 
 
289 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0112821 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0557  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.09 
 
 
268 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0867  HflC protein  29.87 
 
 
282 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00264104  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0565  band 7 protein  24.49 
 
 
357 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0290  band 7 protein  26.09 
 
 
268 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0917443  normal  0.201175 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1955  HflC protein  25.66 
 
 
294 aa  63.5  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.905613  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  22.67 
 
 
335 aa  63.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  23.81 
 
 
292 aa  63.2  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0039  band 7 protein  25 
 
 
251 aa  63.2  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  26.91 
 
 
292 aa  63.2  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  26.14 
 
 
308 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  24.71 
 
 
293 aa  62.4  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1623  band 7 protein  25.93 
 
 
268 aa  62.4  0.000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2911  band 7 protein  23.26 
 
 
376 aa  62.4  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.484171  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  26.59 
 
 
282 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1620  band 7 protein  27.95 
 
 
284 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000904409  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0769  band 7 protein  27.46 
 
 
266 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.953295  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1663  hypothetical protein  23.05 
 
 
341 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0672559  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0402  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.04 
 
 
257 aa  61.6  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.674809  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3718  FtsH protease regulator HflC  22.11 
 
 
331 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0820553  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  28.39 
 
 
386 aa  60.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  22.43 
 
 
298 aa  60.8  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3916  FtsH protease regulator HflC  21.77 
 
 
331 aa  60.8  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0767  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.87 
 
 
267 aa  60.1  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.351425  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3855  band 7 protein  23.26 
 
 
366 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00173128  unclonable  0.00000981253 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  24.16 
 
 
300 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4599  band 7 protein  22.68 
 
 
315 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.235432  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2089  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24 
 
 
259 aa  59.3  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>