More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3042 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_3042  band 7 protein  100 
 
 
295 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0444  band 7 protein  82.31 
 
 
295 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0445  hflC protein, putative  82.19 
 
 
296 aa  501  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1062  band 7 protein  84.51 
 
 
299 aa  498  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4033  band 7 protein  84.93 
 
 
295 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3837  band 7 protein  84.93 
 
 
295 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.712498 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0423  band 7 protein  84.93 
 
 
295 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3910  band 7 protein  84.93 
 
 
295 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3398  band 7 protein  88.17 
 
 
295 aa  483  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0448  band 7 protein  82.31 
 
 
295 aa  481  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3581  band 7 protein  82.31 
 
 
295 aa  481  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3076  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  56.83 
 
 
302 aa  323  2e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3650  band 7 protein  52.56 
 
 
305 aa  315  5e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0210038  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2636  SPFH/band 7 family protein  48.58 
 
 
308 aa  278  6e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156489  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2721  band 7 protein  48.58 
 
 
308 aa  278  6e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000149129  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1572  SPFH/band 7 family protein  48.58 
 
 
295 aa  278  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.915425  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4057  band 7 protein  52.33 
 
 
287 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3236  band 7 protein  31.65 
 
 
295 aa  149  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0978  band 7 protein  30.56 
 
 
312 aa  147  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3629  band 7 protein  30.42 
 
 
298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00841169  hitchhiker  0.00129487 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2373  band 7 protein  31.96 
 
 
304 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  29.03 
 
 
283 aa  88.2  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  29.03 
 
 
283 aa  88.2  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0825  band 7 protein  29.89 
 
 
287 aa  86.3  5e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0292375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2987  band 7 protein  28.75 
 
 
315 aa  79.7  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0815  band 7 protein  24.91 
 
 
278 aa  79  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000157152  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2811  band 7 protein  26.23 
 
 
276 aa  78.6  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103679  hitchhiker  0.00246808 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2924  band 7 protein  27.48 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839077  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1813  band 7 protein  23.86 
 
 
263 aa  77  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3604  band 7 protein  28.73 
 
 
312 aa  76.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10521 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2852  band 7 protein  25.64 
 
 
284 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0525  membrane protease subunit HflC  26.38 
 
 
304 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  27.84 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0666  HflC protein  26.67 
 
 
289 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0549  membrane protease subunit HflC  25.59 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0253  band 7 protein  26.45 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0703  HflC protein  25.46 
 
 
281 aa  68.9  0.00000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  25.91 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  22.74 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  22.74 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  22.74 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3100  band 7 protein  22.18 
 
 
318 aa  66.6  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5029  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.35 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.290689  normal  0.430447 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1320  HflC protein  25.45 
 
 
286 aa  65.5  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.422043  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  26.4 
 
 
283 aa  64.3  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2498  band 7 protein  22.97 
 
 
316 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  26.29 
 
 
300 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4401  band 7 protein  22.48 
 
 
268 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  23.26 
 
 
335 aa  63.5  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0051  hypothetical protein  42.31 
 
 
276 aa  63.5  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.10901e-82  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  24.71 
 
 
289 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3916  FtsH protease regulator HflC  22.71 
 
 
331 aa  62.8  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4464  band 7 protein  22.09 
 
 
268 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0054233  normal  0.226289 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2167  hypothetical protein  23.92 
 
 
282 aa  62.4  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.772353  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  25.86 
 
 
293 aa  62  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3718  FtsH protease regulator HflC  22.37 
 
 
331 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0820553  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  39.33 
 
 
394 aa  61.2  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  23.95 
 
 
289 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2410  band 7 protein  27.04 
 
 
287 aa  60.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183043  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  23.02 
 
 
292 aa  60.5  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  22.89 
 
 
292 aa  60.5  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  24.29 
 
 
289 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  27.12 
 
 
386 aa  59.7  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04042  modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor  23.29 
 
 
334 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.040502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3818  HflC protein  23.29 
 
 
334 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4646  FtsH protease regulator HflC  23.29 
 
 
334 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.175793 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5691  FtsH protease regulator HflC  23.29 
 
 
334 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4706  FtsH protease regulator HflC  23.29 
 
 
334 aa  59.7  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4733  FtsH protease regulator HflC  23.29 
 
 
334 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4417  FtsH protease regulator HflC  23.29 
 
 
334 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3838  FtsH protease regulator HflC  23.29 
 
 
334 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04004  hypothetical protein  23.29 
 
 
334 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1405  conserved hypothetical transmembrane protein (SPFH domain / Band 7 family)  23.19 
 
 
356 aa  59.3  0.00000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0359  band 7 protein  23.65 
 
 
268 aa  59.3  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.741854  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4943  HflC protein  27.04 
 
 
289 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00429597 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4682  HflC protein  24.7 
 
 
289 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4725  FtsH protease regulator HflC  22.95 
 
 
334 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4642  FtsH protease regulator HflC  22.95 
 
 
334 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4632  FtsH protease regulator HflC  22.95 
 
 
334 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4782  FtsH protease regulator HflC  22.95 
 
 
334 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  0.242 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  22.18 
 
 
292 aa  57.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0565  band 7 protein  23.76 
 
 
357 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0557  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.24 
 
 
268 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0290  band 7 protein  24.07 
 
 
268 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0917443  normal  0.201175 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4761  FtsH protease regulator HflC  22.95 
 
 
334 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1620  band 7 protein  25.64 
 
 
284 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000904409  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4891  HflC protein  26.61 
 
 
289 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191561  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4767  HflC protein  26.61 
 
 
289 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2774  HflC protein  24.34 
 
 
294 aa  57.4  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  25.35 
 
 
284 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1623  band 7 protein  23.65 
 
 
268 aa  57  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0260  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.21 
 
 
286 aa  56.6  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  24.61 
 
 
293 aa  55.8  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5670  protease subunit HflC  24.47 
 
 
289 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  23.9 
 
 
298 aa  55.8  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65270  protease subunit HflC  24.47 
 
 
289 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  25.51 
 
 
298 aa  55.8  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  22.74 
 
 
292 aa  55.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  24.62 
 
 
292 aa  55.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3545  band 7 protein  25.42 
 
 
291 aa  55.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.978436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>