66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1017 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1017  bacteriophage/transposase fusion protein  100 
 
 
270 aa  554  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0310816  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1663  hypothetical protein  93.7 
 
 
341 aa  523  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0672559  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0534  bacteriophage/transposase fusion protein  94.57 
 
 
399 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1945  bacteriophage/transposase fusion protein  94.19 
 
 
462 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0051  hypothetical protein  37.32 
 
 
276 aa  186  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.10901e-82  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0145  putative transmembrane protein  31.88 
 
 
302 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.943019  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0044  band 7 protein  31.33 
 
 
302 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.179688 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0038  band 7 protein  31.45 
 
 
302 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5610  band 7 protein  29.8 
 
 
265 aa  113  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.606547  normal  0.386273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5185  band 7 protein  27.57 
 
 
277 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.133466 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3100  band 7 protein  22.81 
 
 
318 aa  85.5  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0253  band 7 protein  30.63 
 
 
310 aa  75.5  0.0000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3629  band 7 protein  24.63 
 
 
298 aa  72  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00841169  hitchhiker  0.00129487 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3236  band 7 protein  23.63 
 
 
295 aa  72  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2032  band 7 protein  28.87 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1813  band 7 protein  23.05 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2467  band 7 protein  26.77 
 
 
318 aa  68.9  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0849083 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2811  band 7 protein  29.21 
 
 
276 aa  62.8  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103679  hitchhiker  0.00246808 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0362  band 7 protein  24.07 
 
 
321 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0825  band 7 protein  26.56 
 
 
287 aa  61.2  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0292375 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1185  membrane protease  26.54 
 
 
316 aa  60.1  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2498  band 7 protein  26.1 
 
 
316 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4360  band 7 protein  24.58 
 
 
307 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0423  band 7 protein  22.35 
 
 
295 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3910  band 7 protein  22.35 
 
 
295 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4033  band 7 protein  22.35 
 
 
295 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3837  band 7 protein  22.35 
 
 
295 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.712498 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4917  band 7 protein  23.08 
 
 
301 aa  57  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149772  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3398  band 7 protein  22.62 
 
 
295 aa  55.8  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4422  band 7 protein  23.78 
 
 
307 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0850578 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2636  SPFH/band 7 family protein  30.2 
 
 
308 aa  55.5  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156489  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2721  band 7 protein  30.2 
 
 
308 aa  55.5  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000149129  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1572  SPFH/band 7 family protein  30.2 
 
 
295 aa  55.5  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.915425  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0728  band 7 protein  24.24 
 
 
276 aa  55.1  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0978  band 7 protein  24.75 
 
 
312 aa  55.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2167  hypothetical protein  24.42 
 
 
282 aa  55.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.772353  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1830  band 7 protein  24.47 
 
 
303 aa  53.9  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3042  band 7 protein  22.06 
 
 
295 aa  54.3  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0815  band 7 protein  24.3 
 
 
278 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000157152  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1062  band 7 protein  22.51 
 
 
299 aa  53.1  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0445  hflC protein, putative  23.38 
 
 
296 aa  52.8  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0444  band 7 protein  23.38 
 
 
295 aa  52.4  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2924  band 7 protein  27.27 
 
 
318 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839077  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0448  band 7 protein  22.89 
 
 
295 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3581  band 7 protein  22.89 
 
 
295 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2987  band 7 protein  25.35 
 
 
315 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4464  band 7 protein  23.31 
 
 
268 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0054233  normal  0.226289 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2852  band 7 protein  26.74 
 
 
284 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4401  band 7 protein  23.31 
 
 
268 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3604  band 7 protein  25.72 
 
 
312 aa  49.3  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10521 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3569  membrane protease subunit  21.76 
 
 
258 aa  46.6  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04831  Band 7 protein  26.36 
 
 
267 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.297877  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5029  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.68 
 
 
267 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.290689  normal  0.430447 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3076  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.71 
 
 
302 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3650  band 7 protein  22.3 
 
 
305 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0210038  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0605  hflK protein  25.48 
 
 
381 aa  44.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0083  Band 7 protein  25.68 
 
 
830 aa  43.5  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.148744  hitchhiker  0.00195276 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0599  HflK protein  25.1 
 
 
381 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0263631  hitchhiker  0.00000131875 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00651  HflK complex with HflC  28.8 
 
 
383 aa  43.5  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.763897  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3980  HflK protein  28.8 
 
 
382 aa  43.5  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.758687  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3708  HflK protein  24.71 
 
 
379 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000788714  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3891  HflK protein  24.71 
 
 
379 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000465537  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3765  HflK protein  24.71 
 
 
379 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000022736  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06520  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  23.4 
 
 
311 aa  42.4  0.008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000843271  normal  0.35726 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  24.71 
 
 
379 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000508673  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0600  HflK protein  24.71 
 
 
381 aa  42  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0138092  hitchhiker  0.00143389 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>