70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5185 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5185  band 7 protein  100 
 
 		 277 aa  568  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.133466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5610  band 7 protein  44.59 
 
 		 265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.606547  normal  0.386273 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0038  band 7 protein  28.22 
 
 		 302 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0145  putative transmembrane protein  28.73 
 
 		 302 aa  105  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.943019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1017  bacteriophage/transposase fusion protein  27.57 
 
 		 270 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0310816  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0044  band 7 protein  27.87 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.179688 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0534  bacteriophage/transposase fusion protein  27.57 
 
 		 399 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1663  hypothetical protein  27.38 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0672559  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1945  bacteriophage/transposase fusion protein  27.21 
 
 		 462 aa  99  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0051  hypothetical protein  26.5 
 
 		 276 aa  93.6  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.10901e-82  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3100  band 7 protein  24.65 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4464  band 7 protein  26.12 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0054233  normal  0.226289 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2467  band 7 protein  27.04 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0849083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4401  band 7 protein  25.75 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2924  band 7 protein  23.9 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3604  band 7 protein  25.66 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10521 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2987  band 7 protein  24.26 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0815  band 7 protein  23.72 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000157152  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0362  band 7 protein  25.87 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3569  membrane protease subunit  25.67 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2498  band 7 protein  25.41 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1182  membrane protease  23.6 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3545  band 7 protein  25.78 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.978436  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1813  band 7 protein  35.29 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2852  band 7 protein  24.82 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2811  band 7 protein  23.58 
 
 		 276 aa  53.9  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103679  hitchhiker  0.00246808 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0445  hflC protein, putative  22.53 
 
 		 296 aa  53.5  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0448  band 7 protein  24.77 
 
 		 295 aa  53.1  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3581  band 7 protein  24.77 
 
 		 295 aa  53.1  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3629  band 7 protein  22.52 
 
 		 298 aa  52.4  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00841169  hitchhiker  0.00129487 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3398  band 7 protein  24.77 
 
 		 295 aa  52.4  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0444  band 7 protein  23.57 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0825  band 7 protein  25 
 
 		 287 aa  52  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0292375 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1062  band 7 protein  22.06 
 
 		 299 aa  50.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3397  band 7 protein  22.69 
 
 		 279 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3042  band 7 protein  22.97 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5029  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.18 
 
 		 267 aa  50.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.290689  normal  0.430447 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3236  band 7 protein  22.78 
 
 		 295 aa  50.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1730  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.08 
 
 		 437 aa  49.7  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1226  band 7 protein  24.89 
 
 		 293 aa  49.7  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0253  band 7 protein  26.06 
 
 		 310 aa  49.3  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2032  band 7 protein  22.77 
 
 		 303 aa  49.3  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4917  band 7 protein  25.95 
 
 		 301 aa  48.9  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3018  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.46 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.126407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3837  band 7 protein  23.01 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.712498 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0423  band 7 protein  23.01 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3910  band 7 protein  23.01 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4033  band 7 protein  23.01 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2636  SPFH/band 7 family protein  23.15 
 
 		 308 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156489  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1572  SPFH/band 7 family protein  22.57 
 
 		 295 aa  47  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.915425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2721  band 7 protein  23.15 
 
 		 308 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000149129  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3076  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.82 
 
 		 302 aa  47  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4360  band 7 protein  27.89 
 
 		 307 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08236  hypothetical protein  24.04 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1614  band 7 protein  23.47 
 
 		 361 aa  47  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1185  membrane protease  25.27 
 
 		 316 aa  46.6  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4422  band 7 protein  25.58 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0850578 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0102  membrane protease-like protein  23.61 
 
 		 299 aa  45.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1703  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  20.87 
 
 		 345 aa  45.4  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1830  band 7 protein  23.42 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0728  band 7 protein  22.39 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2167  hypothetical protein  20.47 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.772353  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  27.68 
 
 		 369 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2313  band 7 protein  29.46 
 
 		 398 aa  43.5  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4057  band 7 protein  19.74 
 
 		 287 aa  42.7  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  25.97 
 
 		 403 aa  42.7  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3650  band 7 protein  22.37 
 
 		 305 aa  42.7  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0210038  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8850  SPFH/band 7 domain protein  26.79 
 
 		 356 aa  42.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3439  band 7 protein  28.18 
 
 		 361 aa  42.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717632  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1863  stomatin like protein  23.32 
 
 		 312 aa  42.4  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.510549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>