More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL03990 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006681  CNL03990  stomatin-like protein, putative  100 
 
 
379 aa  783    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03163  stomatin family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13440)  55.81 
 
 
344 aa  338  8e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000111166  normal  0.837259 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61642  Stomatin-like protein 3  44.93 
 
 
340 aa  246  6e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2049  band 7 protein  33.81 
 
 
249 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1660  Fis family transcriptional regulator  32.27 
 
 
270 aa  126  5e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0472  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.9 
 
 
249 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2766  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.23 
 
 
286 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0119  band 7 protein  33.18 
 
 
263 aa  124  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2128  band 7 protein  32.11 
 
 
251 aa  124  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.257106  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1489  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.56 
 
 
265 aa  124  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.648158  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0014  band 7 protein  31.39 
 
 
267 aa  124  4e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0852  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.25 
 
 
257 aa  124  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198296  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0036  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.29 
 
 
270 aa  124  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0311937  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1502  band 7 protein  35.07 
 
 
278 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal  0.763804 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.07 
 
 
259 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.843969  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4599  band 7 protein  30.73 
 
 
315 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.235432  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0039  band 7 protein  32.86 
 
 
251 aa  122  9e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1496  band 7 protein  35.07 
 
 
259 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1591  band 7 protein  35.07 
 
 
259 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1478  band 7 protein  32.7 
 
 
290 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0220  band 7 protein  29.36 
 
 
253 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.964901  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0199  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.36 
 
 
248 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2886  hypothetical protein  30.49 
 
 
251 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5123  band 7 protein  33.33 
 
 
259 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.345813 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0942  band 7 protein  33.65 
 
 
259 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.69232  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0347  band 7 protein  33.18 
 
 
254 aa  120  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1660  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.77 
 
 
248 aa  120  3e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.242183  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0526  membrane protease family, stomatin/prohibitin homolog  30.77 
 
 
249 aa  120  3e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.712597  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0804  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.53 
 
 
251 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0267  band 7 protein  30.74 
 
 
250 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3381  band 7 protein  30.77 
 
 
252 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.889341  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5320  band 7 protein  32.56 
 
 
257 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0030442  normal  0.0109702 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4966  band 7 protein  32.56 
 
 
257 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.848801  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1785  band 7 protein  30.04 
 
 
267 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0711  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.56 
 
 
257 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.948831  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3200  band 7 protein  33.17 
 
 
278 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173573  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3028  hypothetical protein  30.49 
 
 
251 aa  118  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0490  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.65 
 
 
252 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1806  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.13 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.175938  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3401  band 7 protein  32.09 
 
 
257 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1024  band 7 protein  32.7 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0223  band 7 protein  29.54 
 
 
251 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3637  band 7 protein  31.25 
 
 
284 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0675354  normal  0.0204914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2228  band 7 protein  31.22 
 
 
351 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157467  hitchhiker  0.000011879 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1170  band 7 protein  32.23 
 
 
248 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.985704  decreased coverage  0.00325794 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4388  band 7 protein  31.63 
 
 
257 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05890  putative stomatin-like protein  30.04 
 
 
264 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.774362  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4907  band 7 protein  31.63 
 
 
257 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551483  normal  0.286339 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1014  band 7 protein  29.71 
 
 
265 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.855115  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1635  Band 7 protein  31.92 
 
 
256 aa  116  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.26 
 
 
259 aa  116  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05740  Integral membrane protein, band 7 family  28.81 
 
 
252 aa  116  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.332679  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0991  band 7 protein  32.86 
 
 
257 aa  116  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.934291 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0818  band 7 protein  28.99 
 
 
252 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal  0.529014 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2105  band 7 protein  30 
 
 
275 aa  116  6e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.585176 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0748  band 7 protein  28.99 
 
 
252 aa  116  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.421043 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0865  band 7 protein  31.28 
 
 
254 aa  116  6e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301749  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1571  band 7 protein  29.75 
 
 
258 aa  116  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3653  band 7 protein  32.7 
 
 
257 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467369  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0802  putative stomatin-like transmembrane protein  28.99 
 
 
249 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1815  band 7 protein  30.29 
 
 
254 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.142899 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2175  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.83 
 
 
257 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275738  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0822  SPFH domain-containing protein  30.83 
 
 
257 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645625  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0915  SPFH domain-containing protein  30.83 
 
 
257 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323341  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0872  band 7 protein  30.33 
 
 
253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276466  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0814  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.13 
 
 
257 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000120225  hitchhiker  0.0000000481478 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2659  band 7 protein  29.61 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.37049  normal  0.0645118 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0554  putative stomatin-like protein  29.18 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2685  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.82 
 
 
261 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238135  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2975  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.86 
 
 
278 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0697  band 7 protein  31.28 
 
 
259 aa  114  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0464  band 7 protein  31.28 
 
 
261 aa  114  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000381687  normal  0.0261811 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1305  Band 7 protein  30.84 
 
 
248 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.316844  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1279  band 7 protein  31.75 
 
 
261 aa  113  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1643  band 7 protein  28.21 
 
 
256 aa  113  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.182156  normal  0.321181 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0947  Band 7 protein  30.48 
 
 
247 aa  112  7.000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13935  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5653  band 7 protein  31.28 
 
 
257 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592895  normal  0.980998 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1624  band 7 protein  29.41 
 
 
281 aa  112  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.602734 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4520  band 7 protein  31.02 
 
 
256 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.551636 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1337  band 7 protein  29.55 
 
 
281 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773345  normal  0.981005 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0402  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.89 
 
 
257 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.674809  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3547  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.86 
 
 
261 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.105292  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1081  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.28 
 
 
257 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348982  decreased coverage  0.00598719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4118  Membrane protease subunits stomatin/prohibitin  30.25 
 
 
308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119159  normal  0.0618424 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0695  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.17 
 
 
270 aa  112  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.323887  hitchhiker  0.000167798 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4867  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.02 
 
 
305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4950  band 7 protein  32.38 
 
 
278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493211  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2191  band 7 protein  30 
 
 
266 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0786  band 7 protein  32.99 
 
 
295 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1958  membrane protease subunits, stomatin/prohibitin-like  30.81 
 
 
249 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000358  stomatin family protein  27.97 
 
 
260 aa  110  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3243  SPFH domain/Band 7 family protein  30.47 
 
 
322 aa  111  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000635475  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1924  band 7 protein  30.5 
 
 
322 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0323  band 7 protein  32.23 
 
 
250 aa  111  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06174  hypothetical protein  27.54 
 
 
263 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2146  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.82 
 
 
322 aa  110  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1890  stomatin-like protein  30.82 
 
 
322 aa  110  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1880  stomatin-like protein  30.82 
 
 
322 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2106  SPFH domain/Band 7 family protein  30.82 
 
 
321 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1482  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.1 
 
 
310 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>