More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0554 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0554  putative stomatin-like protein  100 
 
 
264 aa  531  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05890  putative stomatin-like protein  98.11 
 
 
264 aa  524  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.774362  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0220  band 7 protein  83.61 
 
 
253 aa  424  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.964901  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05740  Integral membrane protein, band 7 family  85.25 
 
 
252 aa  425  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.332679  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0199  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  85.36 
 
 
248 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0472  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  84.02 
 
 
249 aa  419  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0267  band 7 protein  88 
 
 
250 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0223  band 7 protein  88 
 
 
251 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0852  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  79.45 
 
 
257 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198296  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0818  band 7 protein  80.85 
 
 
252 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal  0.529014 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0804  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  81.39 
 
 
251 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0748  band 7 protein  80.43 
 
 
252 aa  394  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.421043 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0802  putative stomatin-like transmembrane protein  78.3 
 
 
249 aa  391  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0490  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  79.83 
 
 
252 aa  389  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3653  band 7 protein  75.92 
 
 
257 aa  388  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467369  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1081  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  73.98 
 
 
257 aa  384  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348982  decreased coverage  0.00598719 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1806  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  75.2 
 
 
256 aa  383  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.175938  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5653  band 7 protein  73.98 
 
 
257 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592895  normal  0.980998 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0915  SPFH domain-containing protein  74.8 
 
 
257 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323341  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2175  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  74.8 
 
 
257 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275738  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5123  band 7 protein  74.18 
 
 
259 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.345813 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4388  band 7 protein  74.8 
 
 
257 aa  377  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0822  SPFH domain-containing protein  74.8 
 
 
257 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645625  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4907  band 7 protein  74.8 
 
 
257 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551483  normal  0.286339 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0711  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  74.39 
 
 
257 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.948831  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2150  band 7 protein  71.43 
 
 
259 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3401  band 7 protein  76.17 
 
 
257 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4966  band 7 protein  76.6 
 
 
257 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.848801  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5320  band 7 protein  76.6 
 
 
257 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0030442  normal  0.0109702 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1038  Band 7 protein  76.57 
 
 
277 aa  369  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0947  Band 7 protein  72.03 
 
 
247 aa  363  1e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13935  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  73.31 
 
 
259 aa  363  1e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1489  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  68.91 
 
 
265 aa  362  3e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.648158  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1601  band 7 protein  71.55 
 
 
252 aa  362  3e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.829525  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0402  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  75.43 
 
 
257 aa  359  3e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.674809  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2685  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  71.49 
 
 
261 aa  355  2.9999999999999997e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238135  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1785  band 7 protein  66.4 
 
 
267 aa  354  7.999999999999999e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0119  band 7 protein  73.68 
 
 
263 aa  354  7.999999999999999e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2886  hypothetical protein  72.34 
 
 
251 aa  354  8.999999999999999e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1024  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  72.57 
 
 
260 aa  353  2e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.584692  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0991  band 7 protein  75.34 
 
 
257 aa  353  2e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.934291 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1571  band 7 protein  69.29 
 
 
258 aa  351  5.9999999999999994e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1643  band 7 protein  71.19 
 
 
256 aa  351  5.9999999999999994e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.182156  normal  0.321181 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4520  band 7 protein  70.64 
 
 
256 aa  351  8e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.551636 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1660  Fis family transcriptional regulator  69.71 
 
 
270 aa  349  2e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2191  band 7 protein  72.25 
 
 
266 aa  348  4e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3028  hypothetical protein  72.34 
 
 
251 aa  347  1e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3547  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  76.11 
 
 
261 aa  347  1e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.105292  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1660  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  75.45 
 
 
248 aa  347  1e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.242183  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0526  membrane protease family, stomatin/prohibitin homolog  75.45 
 
 
249 aa  347  1e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.712597  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2128  band 7 protein  71.55 
 
 
251 aa  347  2e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.257106  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000358  stomatin family protein  68.35 
 
 
260 aa  347  2e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0323  band 7 protein  71.68 
 
 
250 aa  345  4e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1635  Band 7 protein  65.22 
 
 
256 aa  344  7e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06174  hypothetical protein  68.35 
 
 
263 aa  344  7e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2659  band 7 protein  71.19 
 
 
266 aa  344  8.999999999999999e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.37049  normal  0.0645118 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4389  band 7 protein  69.83 
 
 
253 aa  341  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2766  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  64.45 
 
 
286 aa  339  2.9999999999999998e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0347  band 7 protein  65.32 
 
 
254 aa  337  9.999999999999999e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2105  band 7 protein  63.32 
 
 
275 aa  336  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.585176 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3381  band 7 protein  66.39 
 
 
252 aa  325  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.889341  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1514  band 7 protein  69.83 
 
 
273 aa  324  1e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503082  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2912  band 7 protein  60.66 
 
 
255 aa  314  9e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3200  band 7 protein  65.91 
 
 
278 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173573  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1958  membrane protease subunits, stomatin/prohibitin-like  63.06 
 
 
249 aa  308  6.999999999999999e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2430  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  60.52 
 
 
261 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108458  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0865  band 7 protein  58.75 
 
 
254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301749  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0814  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  58.2 
 
 
257 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000120225  hitchhiker  0.0000000481478 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1305  Band 7 protein  58.09 
 
 
248 aa  302  4.0000000000000003e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.316844  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1699  band 7 protein  59.66 
 
 
258 aa  301  7.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000129402 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1024  band 7 protein  54.51 
 
 
274 aa  296  2e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1279  band 7 protein  55.88 
 
 
261 aa  293  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2520  band 7 protein  58.85 
 
 
258 aa  290  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1170  band 7 protein  58.58 
 
 
248 aa  288  4e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.985704  decreased coverage  0.00325794 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0464  band 7 protein  56.12 
 
 
261 aa  289  4e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000381687  normal  0.0261811 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0872  band 7 protein  58.3 
 
 
253 aa  287  1e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276466  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1478  band 7 protein  56.33 
 
 
290 aa  285  4e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1014  band 7 protein  51.7 
 
 
265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.855115  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2975  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  55.28 
 
 
278 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0786  band 7 protein  54.39 
 
 
295 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0039  band 7 protein  54.58 
 
 
251 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1161  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  56.25 
 
 
248 aa  278  5e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0328749  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0036  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  59.75 
 
 
270 aa  277  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0311937  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0697  band 7 protein  55.61 
 
 
259 aa  277  1e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2049  band 7 protein  58.15 
 
 
249 aa  276  3e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0767  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  54.32 
 
 
267 aa  275  6e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.351425  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0942  band 7 protein  55.51 
 
 
259 aa  275  6e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.69232  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2530  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  53.95 
 
 
257 aa  274  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  0.845056 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_752  SPFH domain/band 7 family domain protein  53.5 
 
 
267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.293007  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1502  band 7 protein  54.03 
 
 
278 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal  0.763804 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1164  band 7 protein  57.08 
 
 
263 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00105644  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0848  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  53.5 
 
 
267 aa  272  3e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00115336  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1591  band 7 protein  52.16 
 
 
259 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1496  band 7 protein  52.16 
 
 
259 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1337  band 7 protein  54.7 
 
 
281 aa  272  3e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773345  normal  0.981005 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1624  band 7 protein  54.7 
 
 
281 aa  272  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.602734 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1233  Band 7 protein  57.38 
 
 
254 aa  272  4.0000000000000004e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0018  band 7 protein  59.32 
 
 
251 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  53.56 
 
 
259 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.843969  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1741  SPFH domain, Band 7 family protein  54.27 
 
 
291 aa  264  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.011683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>