More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2228 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2228  band 7 protein  100 
 
 		 351 aa  694    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157467  hitchhiker  0.000011879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4118  Membrane protease subunits stomatin/prohibitin  71.31 
 
 		 308 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119159  normal  0.0618424 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3637  band 7 protein  71.19 
 
 		 284 aa  358  9.999999999999999e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0675354  normal  0.0204914 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3399  band 7 protein  73.93 
 
 		 279 aa  347  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1071  band 7 protein  75.11 
 
 		 303 aa  334  1e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1484  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  69.88 
 
 		 296 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.762715  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1506  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  69.88 
 
 		 296 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4867  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  75.33 
 
 		 305 aa  332  7.000000000000001e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1482  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  69.88 
 
 		 310 aa  332  8e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2410  band 7 protein  59.07 
 
 		 287 aa  301  1e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2559  band 7 protein  58.14 
 
 		 285 aa  297  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166484 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1279  band 7 protein  55.46 
 
 		 261 aa  258  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0942  band 7 protein  54.63 
 
 		 259 aa  256  3e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.69232  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0865  band 7 protein  50 
 
 		 254 aa  256  5e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301749  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1478  band 7 protein  51.06 
 
 		 290 aa  255  8e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0814  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.63 
 
 		 257 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000120225  hitchhiker  0.0000000481478 
 
 
-
 
NC_002936  DET0848  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  52.16 
 
 		 267 aa  250  2e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00115336  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_752  SPFH domain/band 7 family domain protein  52.16 
 
 		 267 aa  250  2e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.293007  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0767  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  51.29 
 
 		 267 aa  250  3e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.351425  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2975  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  49.8 
 
 		 278 aa  250  3e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1699  band 7 protein  49.79 
 
 		 258 aa  249  7e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000129402 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1305  Band 7 protein  50.22 
 
 		 248 aa  248  1e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.316844  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2430  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.21 
 
 		 261 aa  247  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108458  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0464  band 7 protein  51.08 
 
 		 261 aa  247  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000381687  normal  0.0261811 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1958  membrane protease subunits, stomatin/prohibitin-like  50.85 
 
 		 249 aa  246  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2912  band 7 protein  52.79 
 
 		 255 aa  246  4e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2049  band 7 protein  52.61 
 
 		 249 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0039  band 7 protein  49.18 
 
 		 251 aa  243  3e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1014  band 7 protein  49.78 
 
 		 265 aa  242  6e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.855115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1170  band 7 protein  48.48 
 
 		 248 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.985704  decreased coverage  0.00325794 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0697  band 7 protein  48.07 
 
 		 259 aa  239  5e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1164  band 7 protein  49.79 
 
 		 263 aa  238  9e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00105644  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0818  band 7 protein  50.21 
 
 		 252 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal  0.529014 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2766  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  47.72 
 
 		 286 aa  237  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0786  band 7 protein  46.15 
 
 		 295 aa  237  3e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0748  band 7 protein  49.79 
 
 		 252 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.421043 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0872  band 7 protein  47.11 
 
 		 253 aa  236  5.0000000000000005e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276466  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2150  band 7 protein  50.45 
 
 		 259 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1337  band 7 protein  49.57 
 
 		 281 aa  235  7e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773345  normal  0.981005 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1502  band 7 protein  47.64 
 
 		 278 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal  0.763804 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1233  Band 7 protein  48.25 
 
 		 254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1624  band 7 protein  49.35 
 
 		 281 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.602734 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1024  band 7 protein  45.41 
 
 		 274 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0852  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  49.15 
 
 		 257 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198296  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1489  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.53 
 
 		 265 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.648158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2520  band 7 protein  49.79 
 
 		 258 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.28 
 
 		 259 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.843969  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1496  band 7 protein  45.53 
 
 		 259 aa  232  6e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1591  band 7 protein  45.53 
 
 		 259 aa  232  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1571  band 7 protein  49.13 
 
 		 258 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2191  band 7 protein  47.11 
 
 		 266 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0220  band 7 protein  47.93 
 
 		 253 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.964901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0472  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.46 
 
 		 249 aa  232  9e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0490  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.46 
 
 		 252 aa  232  9e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1601  band 7 protein  47.84 
 
 		 252 aa  232  9e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.829525  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0199  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  47.93 
 
 		 248 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0119  band 7 protein  47.41 
 
 		 263 aa  231  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3653  band 7 protein  50 
 
 		 257 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05740  Integral membrane protein, band 7 family  48.02 
 
 		 252 aa  231  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.332679  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0804  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.29 
 
 		 251 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2105  band 7 protein  46.55 
 
 		 275 aa  230  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.585176 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5123  band 7 protein  50.89 
 
 		 259 aa  230  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.345813 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1660  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.72 
 
 		 248 aa  229  4e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.242183  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2128  band 7 protein  47.86 
 
 		 251 aa  229  4e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.257106  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0526  membrane protease family, stomatin/prohibitin homolog  46.72 
 
 		 249 aa  229  5e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.712597  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0802  putative stomatin-like transmembrane protein  49.11 
 
 		 249 aa  229  7e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0267  band 7 protein  47.08 
 
 		 250 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2685  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  47.6 
 
 		 261 aa  228  9e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238135  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1660  Fis family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 270 aa  228  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0711  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.64 
 
 		 257 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.948831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  47.98 
 
 		 259 aa  228  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5653  band 7 protein  47.95 
 
 		 257 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592895  normal  0.980998 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1635  Band 7 protein  47.09 
 
 		 256 aa  227  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0036  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  49.78 
 
 		 270 aa  228  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0311937  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1024  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  47.66 
 
 		 260 aa  226  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.584692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1081  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  47.95 
 
 		 257 aa  226  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348982  decreased coverage  0.00598719 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1785  band 7 protein  46.67 
 
 		 267 aa  226  4e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0947  Band 7 protein  47.35 
 
 		 247 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13935  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0223  band 7 protein  46.86 
 
 		 251 aa  225  7e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06174  hypothetical protein  46.12 
 
 		 263 aa  225  8e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5320  band 7 protein  50.67 
 
 		 257 aa  225  9e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0030442  normal  0.0109702 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1806  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.73 
 
 		 256 aa  225  9e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.175938  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000358  stomatin family protein  46.53 
 
 		 260 aa  225  9e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4966  band 7 protein  50.67 
 
 		 257 aa  225  9e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.848801  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0822  SPFH domain-containing protein  48.32 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645625  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2175  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.32 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275738  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0915  SPFH domain-containing protein  48.32 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323341  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3401  band 7 protein  50.67 
 
 		 257 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0991  band 7 protein  48.47 
 
 		 257 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.934291 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4388  band 7 protein  49.36 
 
 		 257 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4520  band 7 protein  45.92 
 
 		 256 aa  223  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.551636 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0323  band 7 protein  49.08 
 
 		 250 aa  224  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2530  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.46 
 
 		 257 aa  223  4e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  0.845056 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05890  putative stomatin-like protein  46.55 
 
 		 264 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.774362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28570  SPFH domain, Band 7 family protein  50.22 
 
 		 274 aa  223  6e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4907  band 7 protein  49.78 
 
 		 257 aa  222  9e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551483  normal  0.286339 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2659  band 7 protein  47.77 
 
 		 266 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.37049  normal  0.0645118 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4950  band 7 protein  50.66 
 
 		 278 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493211  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0018  band 7 protein  48.02 
 
 		 251 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1161  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.09 
 
 		 248 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0328749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>