More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4867 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4867  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  100 
 
 		 305 aa  610  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3637  band 7 protein  77.73 
 
 		 284 aa  393  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0675354  normal  0.0204914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4118  Membrane protease subunits stomatin/prohibitin  77.78 
 
 		 308 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119159  normal  0.0618424 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1484  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  76.17 
 
 		 296 aa  368  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.762715  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1506  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  76.17 
 
 		 296 aa  368  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1482  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  75.78 
 
 		 310 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1071  band 7 protein  78.28 
 
 		 303 aa  362  6e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3399  band 7 protein  74.3 
 
 		 279 aa  355  3.9999999999999996e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2228  band 7 protein  75.56 
 
 		 351 aa  351  7e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157467  hitchhiker  0.000011879 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2410  band 7 protein  60.77 
 
 		 287 aa  310  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2559  band 7 protein  60.57 
 
 		 285 aa  300  3e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166484 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1279  band 7 protein  52.57 
 
 		 261 aa  268  7e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1699  band 7 protein  52.63 
 
 		 258 aa  267  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000129402 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1014  band 7 protein  52.26 
 
 		 265 aa  266  4e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.855115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0767  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  53.33 
 
 		 267 aa  263  2e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.351425  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0464  band 7 protein  50.42 
 
 		 261 aa  263  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000381687  normal  0.0261811 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_752  SPFH domain/band 7 family domain protein  52.89 
 
 		 267 aa  262  4.999999999999999e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.293007  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0848  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  54.59 
 
 		 267 aa  262  6e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00115336  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2430  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.39 
 
 		 261 aa  261  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108458  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1478  band 7 protein  50.81 
 
 		 290 aa  261  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0039  band 7 protein  49.61 
 
 		 251 aa  259  4e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0814  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  52.5 
 
 		 257 aa  259  4e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000120225  hitchhiker  0.0000000481478 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0942  band 7 protein  52.26 
 
 		 259 aa  259  4e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.69232  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2912  band 7 protein  51.6 
 
 		 255 aa  259  4e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0865  band 7 protein  46.59 
 
 		 254 aa  258  6e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301749  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2049  band 7 protein  53.98 
 
 		 249 aa  258  7e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0786  band 7 protein  48.13 
 
 		 295 aa  258  1e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1024  band 7 protein  46.83 
 
 		 274 aa  256  2e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1305  Band 7 protein  48.15 
 
 		 248 aa  256  4e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.316844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0490  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.81 
 
 		 252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2975  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.41 
 
 		 278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1489  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  47.72 
 
 		 265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.648158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1806  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  53.28 
 
 		 256 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.175938  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0697  band 7 protein  51.29 
 
 		 259 aa  252  5.000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1170  band 7 protein  48.33 
 
 		 248 aa  252  7e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.985704  decreased coverage  0.00325794 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0472  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  49.18 
 
 		 249 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2520  band 7 protein  51.65 
 
 		 258 aa  249  5e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0220  band 7 protein  49.37 
 
 		 253 aa  248  7e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.964901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05740  Integral membrane protein, band 7 family  48.37 
 
 		 252 aa  248  8e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.332679  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0818  band 7 protein  53.53 
 
 		 252 aa  248  9e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal  0.529014 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0199  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  49.37 
 
 		 248 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5123  band 7 protein  52.12 
 
 		 259 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.345813 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3653  band 7 protein  52.12 
 
 		 257 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1785  band 7 protein  47.45 
 
 		 267 aa  248  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0748  band 7 protein  53.11 
 
 		 252 aa  247  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.421043 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1081  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  49.41 
 
 		 257 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348982  decreased coverage  0.00598719 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5653  band 7 protein  49.01 
 
 		 257 aa  246  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592895  normal  0.980998 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1624  band 7 protein  47.54 
 
 		 281 aa  246  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.602734 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1337  band 7 protein  47.56 
 
 		 281 aa  245  6e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773345  normal  0.981005 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0852  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.21 
 
 		 257 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198296  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0872  band 7 protein  47.11 
 
 		 253 aa  244  9.999999999999999e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276466  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2175  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  51.69 
 
 		 257 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275738  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0915  SPFH domain-containing protein  51.69 
 
 		 257 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323341  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2128  band 7 protein  49.17 
 
 		 251 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.257106  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1502  band 7 protein  50.43 
 
 		 278 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal  0.763804 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0822  SPFH domain-containing protein  51.69 
 
 		 257 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645625  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2105  band 7 protein  46.33 
 
 		 275 aa  243  3e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.585176 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1024  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  49.79 
 
 		 260 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.584692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4520  band 7 protein  49.15 
 
 		 256 aa  242  7e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.551636 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5320  band 7 protein  51.05 
 
 		 257 aa  242  7e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0030442  normal  0.0109702 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4966  band 7 protein  51.05 
 
 		 257 aa  242  7e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.848801  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0802  putative stomatin-like transmembrane protein  52.42 
 
 		 249 aa  241  7.999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0711  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  52.61 
 
 		 257 aa  241  9e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.948831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1164  band 7 protein  47.39 
 
 		 263 aa  241  1e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00105644  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1591  band 7 protein  49.59 
 
 		 259 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2150  band 7 protein  47.58 
 
 		 259 aa  241  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1660  Fis family transcriptional regulator  51.33 
 
 		 270 aa  241  1e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1571  band 7 protein  48.71 
 
 		 258 aa  241  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  49.33 
 
 		 259 aa  241  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1496  band 7 protein  49.59 
 
 		 259 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1601  band 7 protein  47.13 
 
 		 252 aa  241  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.829525  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3401  band 7 protein  50.63 
 
 		 257 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0526  membrane protease family, stomatin/prohibitin homolog  49.57 
 
 		 249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.712597  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1660  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  49.57 
 
 		 248 aa  239  2.9999999999999997e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.242183  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1958  membrane protease subunits, stomatin/prohibitin-like  49.78 
 
 		 249 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  51.33 
 
 		 259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.843969  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4388  band 7 protein  51.74 
 
 		 257 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06174  hypothetical protein  46.91 
 
 		 263 aa  239  5e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0991  band 7 protein  50.85 
 
 		 257 aa  238  5.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.934291 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4907  band 7 protein  51.79 
 
 		 257 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551483  normal  0.286339 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0267  band 7 protein  49.33 
 
 		 250 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0036  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.15 
 
 		 270 aa  238  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0311937  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2191  band 7 protein  48 
 
 		 266 aa  238  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1233  Band 7 protein  46.86 
 
 		 254 aa  237  2e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0119  band 7 protein  46.4 
 
 		 263 aa  237  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0018  band 7 protein  51.91 
 
 		 251 aa  237  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0223  band 7 protein  49.55 
 
 		 251 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0804  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  49.78 
 
 		 251 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0323  band 7 protein  50.88 
 
 		 250 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1643  band 7 protein  44.71 
 
 		 256 aa  237  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.182156  normal  0.321181 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000358  stomatin family protein  46.5 
 
 		 260 aa  236  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0947  Band 7 protein  46.41 
 
 		 247 aa  236  4e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13935  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28570  SPFH domain, Band 7 family protein  50.83 
 
 		 274 aa  236  4e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2685  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.46 
 
 		 261 aa  235  6e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238135  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0347  band 7 protein  43.72 
 
 		 254 aa  235  7e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4950  band 7 protein  53.74 
 
 		 278 aa  234  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493211  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1635  Band 7 protein  44.94 
 
 		 256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05890  putative stomatin-like protein  48.87 
 
 		 264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.774362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0402  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.13 
 
 		 257 aa  233  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.674809  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2659  band 7 protein  47.7 
 
 		 266 aa  233  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.37049  normal  0.0645118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>