More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0347 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0347  band 7 protein  100 
 
 
254 aa  513  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3381  band 7 protein  86.06 
 
 
252 aa  441  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.889341  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0402  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  71.26 
 
 
257 aa  367  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.674809  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1514  band 7 protein  76.25 
 
 
273 aa  362  4e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503082  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  75.34 
 
 
259 aa  359  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0852  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  70.49 
 
 
257 aa  357  9.999999999999999e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198296  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4520  band 7 protein  66.4 
 
 
256 aa  352  2.9999999999999997e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.551636 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0802  putative stomatin-like transmembrane protein  68.31 
 
 
249 aa  347  8e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2150  band 7 protein  66.53 
 
 
259 aa  347  8e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1601  band 7 protein  68.29 
 
 
252 aa  347  9e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.829525  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1635  Band 7 protein  69.17 
 
 
256 aa  347  1e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4389  band 7 protein  68.13 
 
 
253 aa  347  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0947  Band 7 protein  69.46 
 
 
247 aa  346  2e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13935  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0804  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  72.57 
 
 
251 aa  346  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0748  band 7 protein  67.62 
 
 
252 aa  345  4e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.421043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0220  band 7 protein  70.17 
 
 
253 aa  345  5e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.964901  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0199  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  70.17 
 
 
248 aa  344  6e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1489  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  65.55 
 
 
265 aa  343  1e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.648158  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0818  band 7 protein  67.21 
 
 
252 aa  344  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal  0.529014 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0223  band 7 protein  71.68 
 
 
251 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0267  band 7 protein  69.87 
 
 
250 aa  340  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0472  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  67.65 
 
 
249 aa  340  1e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0119  band 7 protein  66 
 
 
263 aa  338  4e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3653  band 7 protein  67.49 
 
 
257 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467369  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05740  Integral membrane protein, band 7 family  65.57 
 
 
252 aa  337  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.332679  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1660  Fis family transcriptional regulator  71.88 
 
 
270 aa  335  2.9999999999999997e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0490  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  67.51 
 
 
252 aa  335  2.9999999999999997e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1785  band 7 protein  66.53 
 
 
267 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2128  band 7 protein  68.07 
 
 
251 aa  332  2e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.257106  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1024  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  69.16 
 
 
260 aa  333  2e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.584692  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2685  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  69.91 
 
 
261 aa  332  3e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238135  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1081  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  65 
 
 
257 aa  332  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348982  decreased coverage  0.00598719 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05890  putative stomatin-like protein  70.59 
 
 
264 aa  332  4e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.774362  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5653  band 7 protein  65.96 
 
 
257 aa  331  5e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592895  normal  0.980998 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5123  band 7 protein  67.56 
 
 
259 aa  331  5e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.345813 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4388  band 7 protein  69.13 
 
 
257 aa  331  6e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0554  putative stomatin-like protein  69.33 
 
 
264 aa  330  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1571  band 7 protein  65.7 
 
 
258 aa  330  1e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2191  band 7 protein  71.3 
 
 
266 aa  330  1e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4907  band 7 protein  69.13 
 
 
257 aa  330  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551483  normal  0.286339 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0711  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  67.81 
 
 
257 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.948831  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1643  band 7 protein  61.13 
 
 
256 aa  328  6e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.182156  normal  0.321181 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5320  band 7 protein  68.26 
 
 
257 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0030442  normal  0.0109702 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4966  band 7 protein  68.26 
 
 
257 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.848801  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1806  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  65.98 
 
 
256 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.175938  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3401  band 7 protein  68.26 
 
 
257 aa  324  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2175  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  64.17 
 
 
257 aa  322  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275738  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0822  SPFH domain-containing protein  64.17 
 
 
257 aa  322  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645625  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0915  SPFH domain-containing protein  64.17 
 
 
257 aa  322  4e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323341  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0323  band 7 protein  66.96 
 
 
250 aa  320  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0991  band 7 protein  67.41 
 
 
257 aa  318  5e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.934291 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0526  membrane protease family, stomatin/prohibitin homolog  71.3 
 
 
249 aa  317  1e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.712597  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2659  band 7 protein  69.92 
 
 
266 aa  317  1e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.37049  normal  0.0645118 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2766  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  65.64 
 
 
286 aa  317  1e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1660  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  71.3 
 
 
248 aa  317  1e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.242183  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2105  band 7 protein  62.81 
 
 
275 aa  315  4e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.585176 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2886  hypothetical protein  64.53 
 
 
251 aa  311  5.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06174  hypothetical protein  59.67 
 
 
263 aa  310  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000358  stomatin family protein  58.85 
 
 
260 aa  310  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1038  Band 7 protein  69.47 
 
 
277 aa  308  5e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3547  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  65.81 
 
 
261 aa  308  8e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.105292  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2430  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  56.45 
 
 
261 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108458  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1305  Band 7 protein  60.08 
 
 
248 aa  307  1.0000000000000001e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.316844  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2912  band 7 protein  57.02 
 
 
255 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0865  band 7 protein  60.43 
 
 
254 aa  303  1.0000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301749  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3028  hypothetical protein  64.53 
 
 
251 aa  303  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0814  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  56.38 
 
 
257 aa  301  7.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000120225  hitchhiker  0.0000000481478 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1170  band 7 protein  60.85 
 
 
248 aa  298  6e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.985704  decreased coverage  0.00325794 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3200  band 7 protein  62.73 
 
 
278 aa  298  7e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173573  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1958  membrane protease subunits, stomatin/prohibitin-like  60.71 
 
 
249 aa  296  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0464  band 7 protein  60.17 
 
 
261 aa  294  9e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000381687  normal  0.0261811 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1699  band 7 protein  52.59 
 
 
258 aa  290  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000129402 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0036  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  59.51 
 
 
270 aa  289  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0311937  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0786  band 7 protein  56.07 
 
 
295 aa  287  9e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0767  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  55.74 
 
 
267 aa  287  1e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.351425  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0872  band 7 protein  59.64 
 
 
253 aa  286  2.9999999999999996e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276466  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1279  band 7 protein  54.58 
 
 
261 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0942  band 7 protein  57.2 
 
 
259 aa  284  8e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.69232  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_752  SPFH domain/band 7 family domain protein  54.47 
 
 
267 aa  284  8e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.293007  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0848  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  54.94 
 
 
267 aa  284  9e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00115336  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1164  band 7 protein  58.66 
 
 
263 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00105644  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0039  band 7 protein  55.92 
 
 
251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1024  band 7 protein  55.56 
 
 
274 aa  281  7.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1014  band 7 protein  54.77 
 
 
265 aa  279  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.855115  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1478  band 7 protein  53.78 
 
 
290 aa  277  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0697  band 7 protein  53.09 
 
 
259 aa  277  1e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1337  band 7 protein  54.24 
 
 
281 aa  276  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773345  normal  0.981005 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1591  band 7 protein  55.79 
 
 
259 aa  276  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1496  band 7 protein  55.79 
 
 
259 aa  276  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1161  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  59.58 
 
 
248 aa  275  4e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0328749  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2520  band 7 protein  52.99 
 
 
258 aa  275  5e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1624  band 7 protein  53.81 
 
 
281 aa  273  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.602734 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1233  Band 7 protein  59.15 
 
 
254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  55.31 
 
 
259 aa  272  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.843969  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1502  band 7 protein  54.89 
 
 
278 aa  271  6e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal  0.763804 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2049  band 7 protein  57.02 
 
 
249 aa  268  7e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0620  band 7 protein  56.85 
 
 
261 aa  265  5e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1741  SPFH domain, Band 7 family protein  51.65 
 
 
291 aa  261  8e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.011683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2530  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  51.95 
 
 
257 aa  259  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  0.845056 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2975  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  53.12 
 
 
278 aa  256  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>