More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2430 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2430  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  100 
 
 		 261 aa  528  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108458  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0814  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  91.7 
 
 		 257 aa  483  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000120225  hitchhiker  0.0000000481478 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2912  band 7 protein  85.66 
 
 		 255 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1699  band 7 protein  77.25 
 
 		 258 aa  412  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000129402 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2520  band 7 protein  76.65 
 
 		 258 aa  403  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1958  membrane protease subunits, stomatin/prohibitin-like  68.56 
 
 		 249 aa  342  4e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0464  band 7 protein  67.65 
 
 		 261 aa  341  5e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000381687  normal  0.0261811 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1305  Band 7 protein  64.46 
 
 		 248 aa  341  5.999999999999999e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.316844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0865  band 7 protein  63.05 
 
 		 254 aa  341  5.999999999999999e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301749  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1624  band 7 protein  67.21 
 
 		 281 aa  341  9e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.602734 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1337  band 7 protein  67.36 
 
 		 281 aa  338  7e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773345  normal  0.981005 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1014  band 7 protein  60.77 
 
 		 265 aa  335  5e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.855115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1478  band 7 protein  61.54 
 
 		 290 aa  334  7e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1170  band 7 protein  64.14 
 
 		 248 aa  332  3e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.985704  decreased coverage  0.00325794 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2150  band 7 protein  63.1 
 
 		 259 aa  330  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0872  band 7 protein  64.53 
 
 		 253 aa  329  3e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276466  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1496  band 7 protein  61.69 
 
 		 259 aa  325  6e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1591  band 7 protein  61.69 
 
 		 259 aa  325  6e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0767  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  63.45 
 
 		 267 aa  324  7e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.351425  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_752  SPFH domain/band 7 family domain protein  63.87 
 
 		 267 aa  324  8.000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.293007  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0848  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  63.87 
 
 		 267 aa  323  1e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00115336  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0220  band 7 protein  61.29 
 
 		 253 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.964901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  65.37 
 
 		 259 aa  322  3e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.843969  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0697  band 7 protein  63.79 
 
 		 259 aa  322  3e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1279  band 7 protein  60.64 
 
 		 261 aa  322  4e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1024  band 7 protein  62.66 
 
 		 274 aa  321  6e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0199  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  61.89 
 
 		 248 aa  321  8e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1164  band 7 protein  66.94 
 
 		 263 aa  318  7e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00105644  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1502  band 7 protein  62.45 
 
 		 278 aa  317  7.999999999999999e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal  0.763804 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0802  putative stomatin-like transmembrane protein  59.02 
 
 		 249 aa  317  9e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0852  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  60.66 
 
 		 257 aa  317  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198296  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1806  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  59.84 
 
 		 256 aa  316  3e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.175938  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0267  band 7 protein  64.19 
 
 		 250 aa  315  4e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0036  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  62.25 
 
 		 270 aa  315  6e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0311937  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0818  band 7 protein  58.78 
 
 		 252 aa  315  6e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal  0.529014 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0942  band 7 protein  58.82 
 
 		 259 aa  314  7e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.69232  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05740  Integral membrane protein, band 7 family  59.43 
 
 		 252 aa  314  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.332679  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0748  band 7 protein  58.37 
 
 		 252 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.421043 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4907  band 7 protein  61.86 
 
 		 257 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551483  normal  0.286339 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0119  band 7 protein  54.37 
 
 		 263 aa  311  5.999999999999999e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3653  band 7 protein  59.59 
 
 		 257 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1233  Band 7 protein  64.29 
 
 		 254 aa  311  7.999999999999999e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5653  band 7 protein  58.63 
 
 		 257 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592895  normal  0.980998 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1489  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  59 
 
 		 265 aa  311  9e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.648158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4388  band 7 protein  61.44 
 
 		 257 aa  310  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2128  band 7 protein  59.09 
 
 		 251 aa  311  1e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.257106  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5123  band 7 protein  61.21 
 
 		 259 aa  310  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.345813 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1785  band 7 protein  59.2 
 
 		 267 aa  310  2e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1161  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  64.71 
 
 		 248 aa  310  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0328749  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0804  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  64.57 
 
 		 251 aa  309  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0223  band 7 protein  62.45 
 
 		 251 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1081  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  57.83 
 
 		 257 aa  308  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348982  decreased coverage  0.00598719 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0822  SPFH domain-containing protein  58.63 
 
 		 257 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645625  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2175  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  58.63 
 
 		 257 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275738  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0915  SPFH domain-containing protein  58.63 
 
 		 257 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323341  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0039  band 7 protein  60.41 
 
 		 251 aa  308  6.999999999999999e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5320  band 7 protein  61.02 
 
 		 257 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0030442  normal  0.0109702 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0347  band 7 protein  56.45 
 
 		 254 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3401  band 7 protein  61.02 
 
 		 257 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4966  band 7 protein  61.02 
 
 		 257 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.848801  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2685  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  66.07 
 
 		 261 aa  306  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238135  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0711  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  60.34 
 
 		 257 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.948831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2975  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  62.08 
 
 		 278 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1601  band 7 protein  60.43 
 
 		 252 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.829525  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0786  band 7 protein  55.78 
 
 		 295 aa  306  3e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2191  band 7 protein  64.73 
 
 		 266 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1571  band 7 protein  62.55 
 
 		 258 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2530  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  60.17 
 
 		 257 aa  305  5.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  0.845056 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0472  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  57.32 
 
 		 249 aa  305  6e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0490  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  57.31 
 
 		 252 aa  305  7e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4520  band 7 protein  58.02 
 
 		 256 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.551636 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1643  band 7 protein  62.23 
 
 		 256 aa  302  3.0000000000000004e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.182156  normal  0.321181 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05890  putative stomatin-like protein  63.01 
 
 		 264 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.774362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0554  putative stomatin-like protein  62.56 
 
 		 264 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1024  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  63.27 
 
 		 260 aa  300  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.584692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2766  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  61.06 
 
 		 286 aa  299  3e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0402  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  57.44 
 
 		 257 aa  298  5e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.674809  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2659  band 7 protein  60.39 
 
 		 266 aa  298  7e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.37049  normal  0.0645118 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2049  band 7 protein  61.06 
 
 		 249 aa  297  1e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0526  membrane protease family, stomatin/prohibitin homolog  60.17 
 
 		 249 aa  297  1e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.712597  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0323  band 7 protein  60.26 
 
 		 250 aa  297  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  60.99 
 
 		 259 aa  297  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0991  band 7 protein  62.01 
 
 		 257 aa  297  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.934291 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1660  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  60.17 
 
 		 248 aa  296  2e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.242183  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000358  stomatin family protein  59.24 
 
 		 260 aa  296  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1635  Band 7 protein  56.78 
 
 		 256 aa  296  2e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2105  band 7 protein  54.8 
 
 		 275 aa  296  3e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.585176 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06174  hypothetical protein  59.24 
 
 		 263 aa  295  4e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3547  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  61.83 
 
 		 261 aa  295  4e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.105292  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1660  Fis family transcriptional regulator  62.11 
 
 		 270 aa  295  5e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3381  band 7 protein  56.73 
 
 		 252 aa  295  5e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.889341  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0947  Band 7 protein  57.63 
 
 		 247 aa  293  2e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13935  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4389  band 7 protein  59.15 
 
 		 253 aa  292  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2886  hypothetical protein  57.26 
 
 		 251 aa  291  8e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0018  band 7 protein  59.17 
 
 		 251 aa  289  4e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3028  hypothetical protein  56.85 
 
 		 251 aa  287  1e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0620  band 7 protein  62.87 
 
 		 261 aa  285  5e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1038  Band 7 protein  61.64 
 
 		 277 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3200  band 7 protein  57.78 
 
 		 278 aa  281  8.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173573  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1741  SPFH domain, Band 7 family protein  54.12 
 
 		 291 aa  278  6e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.011683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>