More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3016 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3016  HflK protein  100 
 
 		 377 aa  751    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.579125  normal  0.214835 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02636  integral membrane protease subunit  74.79 
 
 		 375 aa  507  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1722  HflK protein  68.24 
 
 		 379 aa  483  1e-135  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1787  HflK protein  68.06 
 
 		 379 aa  481  1e-134  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  42.81 
 
 		 393 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  38.98 
 
 		 395 aa  229  5e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  38.14 
 
 		 394 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  37.12 
 
 		 386 aa  219  8.999999999999998e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  39.33 
 
 		 400 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  37.47 
 
 		 405 aa  218  1e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  40.34 
 
 		 447 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  42.07 
 
 		 406 aa  216  5e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  38.8 
 
 		 395 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  39.53 
 
 		 378 aa  212  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  37.14 
 
 		 405 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  39.86 
 
 		 457 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  37.14 
 
 		 393 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  37.97 
 
 		 498 aa  211  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  39.76 
 
 		 475 aa  210  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  37.46 
 
 		 399 aa  209  6e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  37.7 
 
 		 435 aa  209  6e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  36.81 
 
 		 389 aa  209  8e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  36.21 
 
 		 418 aa  209  9e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  39.28 
 
 		 447 aa  208  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0605  hflK protein  35.25 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  40.65 
 
 		 436 aa  208  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  36.63 
 
 		 393 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  37.98 
 
 		 477 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  41.76 
 
 		 399 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  38.03 
 
 		 503 aa  207  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  36.97 
 
 		 393 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  41.39 
 
 		 400 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  35.56 
 
 		 420 aa  206  7e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  37.98 
 
 		 379 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000508673  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0579  HflK protein  36 
 
 		 386 aa  205  1e-51  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  38.57 
 
 		 413 aa  204  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  40.14 
 
 		 351 aa  204  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  35.73 
 
 		 387 aa  203  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  35.38 
 
 		 389 aa  203  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  40.13 
 
 		 433 aa  203  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0600  HflK protein  37.98 
 
 		 381 aa  202  7e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0138092  hitchhiker  0.00143389 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3430  HflK protein  37.98 
 
 		 381 aa  202  7e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0909026  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  37.58 
 
 		 407 aa  202  8e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3980  HflK protein  34.52 
 
 		 382 aa  202  9e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.758687  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3023  hflK protein  35.03 
 
 		 377 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000561401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0599  HflK protein  35 
 
 		 381 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0263631  hitchhiker  0.00000131875 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2760  hflK protein  38.32 
 
 		 395 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467094  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3278  HflK protein  35.29 
 
 		 380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010392  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3891  HflK protein  36.05 
 
 		 379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000465537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3765  HflK protein  36.05 
 
 		 379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000022736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3708  HflK protein  36.05 
 
 		 379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000788714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0357  FtsH protease regulator HflK  39.92 
 
 		 421 aa  200  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398708  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00651  HflK complex with HflC  34.57 
 
 		 383 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.763897  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4645  FtsH protease regulator HflK  34.04 
 
 		 419 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.14387 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4641  FtsH protease regulator HflK  37.92 
 
 		 419 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.641221  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4724  FtsH protease regulator HflK  39.69 
 
 		 419 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4781  FtsH protease regulator HflK  39.69 
 
 		 419 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.932984  normal  0.393456 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3719  FtsH protease regulator HflK  40.08 
 
 		 420 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0503077  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4631  FtsH protease regulator HflK  39.69 
 
 		 419 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4760  FtsH protease regulator HflK  39.69 
 
 		 419 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3917  FtsH protease regulator HflK  40.08 
 
 		 415 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.357327  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04041  modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor  33.78 
 
 		 419 aa  196  7e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.298849  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4732  FtsH protease regulator HflK  33.78 
 
 		 419 aa  196  7e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.938149  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04003  hypothetical protein  33.78 
 
 		 419 aa  196  7e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.317629  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4416  FtsH protease regulator HflK  33.78 
 
 		 419 aa  196  7e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.953832  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4705  FtsH protease regulator HflK  33.78 
 
 		 419 aa  196  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.714132  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5690  FtsH protease regulator HflK  33.78 
 
 		 419 aa  196  7e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.440871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3839  FtsH protease regulator HflK  33.78 
 
 		 419 aa  196  7e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.910091  hitchhiker  0.000000232279 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  39.48 
 
 		 383 aa  195  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  36.09 
 
 		 456 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  38.54 
 
 		 471 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  35.88 
 
 		 471 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  37.5 
 
 		 474 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00092  serine protease  36.13 
 
 		 401 aa  194  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  38.19 
 
 		 378 aa  193  4e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  34.96 
 
 		 451 aa  193  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  34.96 
 
 		 451 aa  193  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3819  HflK protein  33.51 
 
 		 419 aa  193  5e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0613795  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3203  HflK protein  34.25 
 
 		 386 aa  192  8e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.143701  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  36.25 
 
 		 395 aa  192  9e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  38.41 
 
 		 391 aa  192  9e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  34.91 
 
 		 414 aa  192  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  0.00000000000633953 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002261  HflK protein  36.13 
 
 		 401 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0330443  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  35.74 
 
 		 452 aa  190  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0487  HflK protein  37.05 
 
 		 420 aa  189  7e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  34.67 
 
 		 464 aa  189  8e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  37.63 
 
 		 464 aa  189  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  37.83 
 
 		 382 aa  187  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  38.87 
 
 		 362 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0799  HflK protein  32.55 
 
 		 381 aa  187  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  37.54 
 
 		 388 aa  186  4e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3538  HflK protein  31.28 
 
 		 383 aa  186  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107822  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2861  HflK protein  37.06 
 
 		 393 aa  187  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4168  HflK protein  34.2 
 
 		 379 aa  186  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000320742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3309  HflK protein  34.5 
 
 		 386 aa  186  6e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2241  ftsH protease activity modulator HflK  39.02 
 
 		 445 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.753349  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  32.99 
 
 		 403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  35.66 
 
 		 465 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  0.0000076277 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3796  FtsH protease regulator HflK  38.55 
 
 		 420 aa  184  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3651  FtsH protease regulator HflK  38.55 
 
 		 420 aa  184  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>