More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4890 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4890  band 7 protein  100 
 
 		 284 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152851  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4834  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  97.53 
 
 		 284 aa  560  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.220458  normal  0.54169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4712  band 7 protein  97.53 
 
 		 284 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.21194 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4626  band 7 protein  95.77 
 
 		 284 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.137042 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0260  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  67.74 
 
 		 286 aa  392  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0139  band 7 protein  68.86 
 
 		 289 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.889576  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2364  band 7 protein  59.79 
 
 		 286 aa  358  7e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3437  band 7 protein  58.27 
 
 		 283 aa  347  1e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.462208  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0321  band 7 protein  58.63 
 
 		 284 aa  342  4e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0297  band 7 protein  58.63 
 
 		 284 aa  342  5e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0324  band 7 protein  58.27 
 
 		 284 aa  341  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2127  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  57.63 
 
 		 286 aa  333  1e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.458205  normal  0.678014 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2451  band 7 protein  57.63 
 
 		 286 aa  334  1e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3110  band 7 protein  53.55 
 
 		 282 aa  333  2e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00709216  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1620  band 7 protein  54.06 
 
 		 284 aa  330  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000904409  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0649  putative membrane protease subunit-like protein  52.94 
 
 		 291 aa  323  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.384803  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0608  band 7 protein  58.84 
 
 		 286 aa  322  4e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0086  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  53.74 
 
 		 281 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0462  band 7 protein  48.34 
 
 		 304 aa  280  2e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.86 
 
 		 304 aa  229  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0609  band 7 protein  39.78 
 
 		 305 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4267  band 7 protein  42.28 
 
 		 329 aa  226  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0565  band 7 protein  39.78 
 
 		 305 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0550  band 7 protein  39.78 
 
 		 305 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0555  band 7 protein  39.78 
 
 		 305 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.857194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0944  band 7 protein  43.07 
 
 		 331 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188485  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0548  band 7 protein  39.78 
 
 		 305 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0416  band 7 protein  42.31 
 
 		 304 aa  226  4e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1153  band 7 protein  42.54 
 
 		 301 aa  226  5.0000000000000005e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.294255  hitchhiker  0.000000366449 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3216  band 7 protein  40.43 
 
 		 304 aa  225  7e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1100  band 7 protein  41.01 
 
 		 304 aa  225  8e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3720  hypothetical protein  42.01 
 
 		 344 aa  224  9e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00440  predicted protease, membrane anchored  39.71 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3121  band 7 protein  39.71 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.29 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0538  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.71 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00445  hypothetical protein  39.71 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0593  SPFH domain/band 7 family protein  39.71 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.554445 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0424  SPFH domain/band 7 family protein  39.71 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0568  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.71 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3127  band 7 protein  39.71 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.33 
 
 		 328 aa  223  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0528  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.35 
 
 		 305 aa  223  4e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6548  band 7 protein  41.72 
 
 		 326 aa  222  6e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0862  band 7 protein  41.97 
 
 		 336 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1268  hypothetical protein  40.73 
 
 		 304 aa  222  7e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.169836 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4541  band 7 protein  41.97 
 
 		 329 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3162  band 7 protein  40.73 
 
 		 304 aa  222  7e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3024  SPFH/band 7 family protein  40.73 
 
 		 304 aa  222  7e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  40.85 
 
 		 336 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0070  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.96 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1359  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.55 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198882 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3075  band 7 protein  41.7 
 
 		 319 aa  219  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0686773 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01652  inner membrane protein  41.45 
 
 		 321 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1034  band 7 protein  41.67 
 
 		 307 aa  218  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2221  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.83 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4419  band 7 protein  44.68 
 
 		 319 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0929  Band 7 protein  39.02 
 
 		 332 aa  215  7e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1091  band 7 protein  40.84 
 
 		 282 aa  215  7e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0497  hypothetical protein  39.31 
 
 		 306 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.988378  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2704  band 7 protein  40.81 
 
 		 332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3024  band 7 protein  40 
 
 		 304 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3305  band 7 protein  40.44 
 
 		 345 aa  211  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3607  band 7 protein  40.44 
 
 		 346 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0138  band 7 protein  39.21 
 
 		 318 aa  209  3e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0157  inner membrane protein  39.21 
 
 		 318 aa  209  5e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.131876  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  37.22 
 
 		 326 aa  208  7e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000590764  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1446  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.05 
 
 		 305 aa  208  8e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0162555  normal  0.124024 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0280  integral membrane protein  38.97 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0038  hypothetical protein  39.02 
 
 		 300 aa  206  3e-52  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01317  hypothetical protein  37.59 
 
 		 304 aa  206  4e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4303  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.19 
 
 		 311 aa  205  6e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004150  stomatin family protein  36.9 
 
 		 305 aa  205  6e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2735  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.53 
 
 		 319 aa  204  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2310  band 7 protein  37.91 
 
 		 356 aa  203  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5109  band 7 protein  40.65 
 
 		 326 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000505876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  38.77 
 
 		 369 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1902  band 7 protein  38.97 
 
 		 311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2033  band 7 protein  38.97 
 
 		 311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295777  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1334  band 7/Mec-2 family protein  37.76 
 
 		 326 aa  199  3e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  38.77 
 
 		 369 aa  199  5e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0571  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.79 
 
 		 306 aa  199  5e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3684  band 7 protein  38.65 
 
 		 327 aa  197  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1880  band 7 protein  40 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.126513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8850  SPFH/band 7 domain protein  39.22 
 
 		 356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  39.15 
 
 		 403 aa  196  5.000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1276  band 7 protein  38.28 
 
 		 317 aa  192  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.887258 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2227  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.49 
 
 		 359 aa  192  7e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491741  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21690  SPFH domain, Band 7 family protein  38.97 
 
 		 429 aa  191  9e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.389538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1429  band 7 protein  38.75 
 
 		 394 aa  191  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.59 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32562  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2559  membrane protein GNA1220  37.59 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1304  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.59 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2468  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.59 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6077  band 7 protein  37.59 
 
 		 311 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3279  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.59 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.571401  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.59 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764976  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2189  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.85 
 
 		 328 aa  190  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0577591  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2000  band 7 protein  37.59 
 
 		 311 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.882585  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2033  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.59 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.30035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>