More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_19780 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_19780  SPFH domain, Band 7 family protein  100 
 
 
456 aa  899    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.295891  hitchhiker  0.000474854 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3421  band 7 protein  83.06 
 
 
402 aa  573  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11517  hypothetical protein  76.32 
 
 
381 aa  542  1e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.18068 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2312  band 7 protein  76.97 
 
 
473 aa  541  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00180673  hitchhiker  0.000141748 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2759  band 7 protein  71.14 
 
 
406 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.84305  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3653  band 7 protein  75 
 
 
403 aa  528  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3137  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  76.72 
 
 
392 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3126  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  77.01 
 
 
392 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3187  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  77.01 
 
 
392 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2414  band 7 protein  64.44 
 
 
446 aa  496  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2091  band 7 protein  63.86 
 
 
401 aa  490  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0259831  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2111  band 7 protein  67.59 
 
 
395 aa  432  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2578  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  63.18 
 
 
376 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3087  band 7 protein  59.88 
 
 
360 aa  377  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.681726  hitchhiker  0.00992897 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1156  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  63.73 
 
 
318 aa  377  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.149138  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2189  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  63.05 
 
 
328 aa  365  1e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0577591  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1429  band 7 protein  56.23 
 
 
394 aa  363  3e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3264  band 7 protein  61.81 
 
 
359 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0364403  normal  0.314741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2501  band 7 protein  61.22 
 
 
406 aa  362  9e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  62.03 
 
 
403 aa  361  2e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18370  SPFH domain, Band 7 family protein  49.44 
 
 
416 aa  360  2e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.848038  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1932  band 7 protein  62.63 
 
 
315 aa  359  5e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000138273 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21690  SPFH domain, Band 7 family protein  60.88 
 
 
429 aa  359  5e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.389538  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  59.52 
 
 
369 aa  359  6e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12020  SPFH domain, Band 7 family protein  50.48 
 
 
396 aa  358  9e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0191878  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2315  band 7 protein  60.81 
 
 
345 aa  358  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  59.52 
 
 
369 aa  358  9.999999999999999e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2313  band 7 protein  60.48 
 
 
398 aa  356  5.999999999999999e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8850  SPFH/band 7 domain protein  58.36 
 
 
356 aa  352  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1352  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  64.75 
 
 
314 aa  352  1e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4807  band 7 protein  55.73 
 
 
336 aa  348  1e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2051  band 7 protein  58.59 
 
 
439 aa  345  7e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.471473 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3684  band 7 protein  56.95 
 
 
327 aa  340  4e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2227  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  53.9 
 
 
359 aa  330  3e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491741  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3439  band 7 protein  55.44 
 
 
361 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717632  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5341  band 7 protein  49.01 
 
 
307 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.207546  normal  0.117184 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0702  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.18 
 
 
314 aa  286  8e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1863  stomatin like protein  50.35 
 
 
312 aa  278  1e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.510549  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  44.77 
 
 
326 aa  263  4e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000590764  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1330  band 7 protein  46.52 
 
 
304 aa  262  1e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.373996  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1714  band 7 protein  47.46 
 
 
314 aa  258  1e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0061  band 7 protein  44.6 
 
 
305 aa  256  5e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313093  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0061  band 7 protein  44.6 
 
 
305 aa  256  8e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0011407  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1560  band 7 protein  42.68 
 
 
322 aa  256  9e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.140523  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1632  band 7 protein  44.11 
 
 
315 aa  250  3e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1890  stomatin-like protein  41.05 
 
 
322 aa  249  6e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1880  stomatin-like protein  41.05 
 
 
322 aa  249  6e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2106  SPFH domain/Band 7 family protein  41.18 
 
 
321 aa  249  8e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1924  band 7 protein  40.06 
 
 
322 aa  249  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0729  band 7 protein  45.32 
 
 
310 aa  247  3e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3243  SPFH domain/Band 7 family protein  41.01 
 
 
322 aa  247  4e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000635475  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2146  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.05 
 
 
322 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1928  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.87 
 
 
321 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.87 
 
 
321 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2174  SPFH domain/Band 7 family protein  40.43 
 
 
322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1334  band 7/Mec-2 family protein  43.58 
 
 
326 aa  244  3e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2310  band 7 protein  43.67 
 
 
356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2064  SPFH domain/Band 7 family protein  40.69 
 
 
322 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101789  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0564  band 7 protein  41.37 
 
 
309 aa  239  6.999999999999999e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.396207  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2939  band 7 protein  43.9 
 
 
312 aa  239  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0124635  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0360  band 7 protein  41.2 
 
 
327 aa  235  9e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.259397 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1226  band 7 protein  44.44 
 
 
293 aa  233  7.000000000000001e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  42.86 
 
 
311 aa  232  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1316  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.59 
 
 
316 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0215756  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1132  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.59 
 
 
316 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0531  band 7 protein  41.13 
 
 
317 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.768423 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1572  band 7 protein  39.19 
 
 
307 aa  212  1e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4837  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.21 
 
 
325 aa  211  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2247  band 7 protein  39.39 
 
 
324 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0154537 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1952  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.36 
 
 
321 aa  210  4e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.664065  normal  0.0256055 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0565  band 7 protein  40.15 
 
 
305 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0555  band 7 protein  40.15 
 
 
305 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.857194  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0550  band 7 protein  40.15 
 
 
305 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0548  band 7 protein  40.15 
 
 
305 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.78 
 
 
304 aa  208  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0970  band 7 protein  38.27 
 
 
356 aa  208  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196355  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0609  band 7 protein  39.78 
 
 
305 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1446  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.39 
 
 
305 aa  207  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0162555  normal  0.124024 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0504  band 7 protein  38.83 
 
 
361 aa  207  4e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0842  band 7 protein  41.96 
 
 
290 aa  206  7e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.360301 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00440  predicted protease, membrane anchored  40.07 
 
 
305 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3121  band 7 protein  40.07 
 
 
305 aa  205  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0538  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.07 
 
 
305 aa  205  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00445  hypothetical protein  40.07 
 
 
305 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.16 
 
 
328 aa  205  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0593  SPFH domain/band 7 family protein  40.07 
 
 
305 aa  205  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.554445 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3127  band 7 protein  40.07 
 
 
305 aa  205  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0424  SPFH domain/band 7 family protein  40.07 
 
 
305 aa  205  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0568  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.07 
 
 
305 aa  205  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0929  Band 7 protein  47.12 
 
 
332 aa  204  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0466  band 7 protein  38.83 
 
 
321 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4541  band 7 protein  42.12 
 
 
329 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0462  band 7 protein  37.06 
 
 
304 aa  204  3e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  40.14 
 
 
336 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4267  band 7 protein  41.03 
 
 
329 aa  204  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0528  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.71 
 
 
305 aa  204  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0480  band 7 protein  38.83 
 
 
321 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.58 
 
 
309 aa  204  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1880  band 7 protein  41.49 
 
 
334 aa  203  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.126513  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2215  band 7 protein  49.24 
 
 
304 aa  203  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00993156  normal  0.0579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>