More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1880 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1880  band 7 protein  100 
 
 		 334 aa  670    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.126513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  69.09 
 
 		 336 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4541  band 7 protein  69.66 
 
 		 329 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0862  band 7 protein  67.88 
 
 		 336 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0944  band 7 protein  73.15 
 
 		 331 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188485  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1359  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  71.62 
 
 		 334 aa  442  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198882 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3720  hypothetical protein  65 
 
 		 344 aa  434  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0929  Band 7 protein  66.87 
 
 		 332 aa  437  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2704  band 7 protein  68.09 
 
 		 332 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0416  band 7 protein  68.24 
 
 		 304 aa  422  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3607  band 7 protein  68.62 
 
 		 346 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3305  band 7 protein  68.88 
 
 		 345 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5109  band 7 protein  66.99 
 
 		 326 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000505876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6548  band 7 protein  66.04 
 
 		 326 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4267  band 7 protein  67.75 
 
 		 329 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0070  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  70.11 
 
 		 328 aa  408  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  70.46 
 
 		 328 aa  410  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  66.9 
 
 		 309 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00440  predicted protease, membrane anchored  62.24 
 
 		 305 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3121  band 7 protein  62.24 
 
 		 305 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0593  SPFH domain/band 7 family protein  62.24 
 
 		 305 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.554445 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0528  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  61.9 
 
 		 305 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00445  hypothetical protein  62.24 
 
 		 305 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0538  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  62.24 
 
 		 305 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0568  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  62.24 
 
 		 305 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0424  SPFH domain/band 7 family protein  62.24 
 
 		 305 aa  400  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3127  band 7 protein  62.24 
 
 		 305 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0550  band 7 protein  61.22 
 
 		 305 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0609  band 7 protein  61.22 
 
 		 305 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3075  band 7 protein  60.52 
 
 		 319 aa  397  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0686773 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0565  band 7 protein  61.22 
 
 		 305 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0548  band 7 protein  61.22 
 
 		 305 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0555  band 7 protein  61.22 
 
 		 305 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.857194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  60.88 
 
 		 304 aa  393  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01652  inner membrane protein  62.08 
 
 		 321 aa  390  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2215  band 7 protein  69.26 
 
 		 304 aa  381  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00993156  normal  0.0579 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0157  inner membrane protein  57.53 
 
 		 318 aa  371  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.131876  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1446  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  60.2 
 
 		 305 aa  372  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0162555  normal  0.124024 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0138  band 7 protein  57.19 
 
 		 318 aa  369  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1100  band 7 protein  59.93 
 
 		 304 aa  365  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1153  band 7 protein  61.38 
 
 		 301 aa  363  2e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.294255  hitchhiker  0.000000366449 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2735  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  66.78 
 
 		 319 aa  363  2e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3216  band 7 protein  59.26 
 
 		 304 aa  362  4e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3162  band 7 protein  60.07 
 
 		 304 aa  357  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3024  SPFH/band 7 family protein  60.07 
 
 		 304 aa  357  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0497  hypothetical protein  59.73 
 
 		 306 aa  357  9.999999999999999e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.988378  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1268  hypothetical protein  60.07 
 
 		 304 aa  357  9.999999999999999e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.169836 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1034  band 7 protein  62.5 
 
 		 307 aa  357  9.999999999999999e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0280  integral membrane protein  61.19 
 
 		 307 aa  353  2e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3024  band 7 protein  60.99 
 
 		 304 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4303  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  60.98 
 
 		 311 aa  351  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0571  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  61.43 
 
 		 306 aa  350  2e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01317  hypothetical protein  60 
 
 		 304 aa  348  6e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004150  stomatin family protein  59.66 
 
 		 305 aa  348  8e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2221  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  57.76 
 
 		 312 aa  347  2e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4419  band 7 protein  56.96 
 
 		 319 aa  340  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0038  hypothetical protein  59.29 
 
 		 300 aa  337  9.999999999999999e-92  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1316  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.55 
 
 		 316 aa  236  3e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0215756  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1132  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.55 
 
 		 316 aa  236  3e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  42.95 
 
 		 311 aa  236  4e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1429  band 7 protein  42.99 
 
 		 394 aa  236  5.0000000000000005e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1330  band 7 protein  46.21 
 
 		 304 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.373996  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  42.63 
 
 		 369 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  37.81 
 
 		 326 aa  229  3e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000590764  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2310  band 7 protein  40.06 
 
 		 356 aa  229  5e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  40.91 
 
 		 369 aa  228  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1620  band 7 protein  42.76 
 
 		 284 aa  227  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000904409  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2227  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.25 
 
 		 359 aa  226  4e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491741  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0729  band 7 protein  44.3 
 
 		 310 aa  226  4e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1902  band 7 protein  41.29 
 
 		 311 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2033  band 7 protein  41.29 
 
 		 311 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295777  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0061  band 7 protein  41.78 
 
 		 305 aa  224  2e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313093  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0061  band 7 protein  41.78 
 
 		 305 aa  223  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0011407  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  42.05 
 
 		 403 aa  222  6e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1091  band 7 protein  43.3 
 
 		 282 aa  222  9e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1863  stomatin like protein  40.8 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.510549  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0360  band 7 protein  38.06 
 
 		 327 aa  220  1.9999999999999999e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.259397 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5310  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.97 
 
 		 311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0621487  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21690  SPFH domain, Band 7 family protein  42.23 
 
 		 429 aa  220  3e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.389538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3110  band 7 protein  40.89 
 
 		 282 aa  220  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00709216  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0564  band 7 protein  40.67 
 
 		 309 aa  219  3.9999999999999997e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.396207  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2020  band 7 protein  40.26 
 
 		 311 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2315  band 7 protein  40.26 
 
 		 345 aa  219  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6077  band 7 protein  40.32 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2000  band 7 protein  40.32 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.882585  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1276  band 7 protein  40.88 
 
 		 317 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.887258 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0466  band 7 protein  41.28 
 
 		 321 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3684  band 7 protein  39.75 
 
 		 327 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2578  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.93 
 
 		 376 aa  218  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0480  band 7 protein  41.28 
 
 		 321 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3087  band 7 protein  42.31 
 
 		 360 aa  216  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.681726  hitchhiker  0.00992897 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1156  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.19 
 
 		 318 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.149138  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1226  band 7 protein  39.27 
 
 		 293 aa  215  7e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2313  band 7 protein  40.57 
 
 		 398 aa  215  7e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3439  band 7 protein  41.03 
 
 		 361 aa  215  8e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717632  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1304  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.37 
 
 		 315 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26064  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.37 
 
 		 315 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32562  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.37 
 
 		 315 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764976  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2559  membrane protein GNA1220  39.37 
 
 		 315 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2033  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.37 
 
 		 315 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.30035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>