More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2215 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2215  band 7 protein  100 
 
 		 304 aa  616  1e-175  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00993156  normal  0.0579 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  68.4 
 
 		 309 aa  421  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  68.58 
 
 		 336 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3075  band 7 protein  67.45 
 
 		 319 aa  412  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0686773 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0416  band 7 protein  66.33 
 
 		 304 aa  409  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4541  band 7 protein  70.4 
 
 		 329 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01652  inner membrane protein  68.46 
 
 		 321 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00440  predicted protease, membrane anchored  61.54 
 
 		 305 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3121  band 7 protein  61.54 
 
 		 305 aa  402  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4267  band 7 protein  68.59 
 
 		 329 aa  401  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0550  band 7 protein  63.18 
 
 		 305 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0538  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  61.54 
 
 		 305 aa  402  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00445  hypothetical protein  61.54 
 
 		 305 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0609  band 7 protein  63.18 
 
 		 305 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0548  band 7 protein  63.18 
 
 		 305 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1880  band 7 protein  69.26 
 
 		 334 aa  402  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.126513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0424  SPFH domain/band 7 family protein  61.54 
 
 		 305 aa  402  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0593  SPFH domain/band 7 family protein  61.54 
 
 		 305 aa  402  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.554445 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0862  band 7 protein  70.04 
 
 		 336 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0568  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  61.54 
 
 		 305 aa  402  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0555  band 7 protein  63.18 
 
 		 305 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.857194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  63.18 
 
 		 304 aa  402  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3127  band 7 protein  61.54 
 
 		 305 aa  402  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0565  band 7 protein  63.18 
 
 		 305 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  67.62 
 
 		 328 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0070  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  67.26 
 
 		 328 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0528  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  61.2 
 
 		 305 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2704  band 7 protein  67.15 
 
 		 332 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3607  band 7 protein  66.19 
 
 		 346 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0944  band 7 protein  68.23 
 
 		 331 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188485  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3720  hypothetical protein  62.84 
 
 		 344 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1359  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  66.22 
 
 		 334 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198882 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3305  band 7 protein  64.77 
 
 		 345 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1153  band 7 protein  64.14 
 
 		 301 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.294255  hitchhiker  0.000000366449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5109  band 7 protein  62.84 
 
 		 326 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000505876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3216  band 7 protein  63.85 
 
 		 304 aa  378  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0157  inner membrane protein  59.12 
 
 		 318 aa  380  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.131876  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0138  band 7 protein  58.78 
 
 		 318 aa  378  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0929  Band 7 protein  65.2 
 
 		 332 aa  377  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1100  band 7 protein  63.18 
 
 		 304 aa  377  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6548  band 7 protein  60.54 
 
 		 326 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3162  band 7 protein  62.84 
 
 		 304 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1268  hypothetical protein  62.84 
 
 		 304 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.169836 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3024  SPFH/band 7 family protein  62.84 
 
 		 304 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1446  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  61.68 
 
 		 305 aa  365  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0162555  normal  0.124024 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1034  band 7 protein  64.86 
 
 		 307 aa  365  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3024  band 7 protein  64.86 
 
 		 304 aa  363  1e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0571  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  65.34 
 
 		 306 aa  359  4e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0497  hypothetical protein  61.82 
 
 		 306 aa  358  5e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.988378  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01317  hypothetical protein  62.2 
 
 		 304 aa  357  9.999999999999999e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4303  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  62.63 
 
 		 311 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004150  stomatin family protein  62.28 
 
 		 305 aa  356  2.9999999999999997e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2221  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  61.06 
 
 		 312 aa  353  2e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674457 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2735  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  66.06 
 
 		 319 aa  352  4e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0038  hypothetical protein  62.14 
 
 		 300 aa  350  2e-95  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4419  band 7 protein  61.56 
 
 		 319 aa  349  3e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0280  integral membrane protein  63.87 
 
 		 307 aa  347  1e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0729  band 7 protein  48.18 
 
 		 310 aa  261  1e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1330  band 7 protein  45.14 
 
 		 304 aa  251  1e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.373996  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2310  band 7 protein  40.89 
 
 		 356 aa  250  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0061  band 7 protein  44.3 
 
 		 305 aa  249  3e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313093  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0061  band 7 protein  43.96 
 
 		 305 aa  249  6e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0011407  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1316  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.38 
 
 		 316 aa  245  6.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0215756  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1132  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.38 
 
 		 316 aa  245  6.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2227  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.7 
 
 		 359 aa  243  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491741  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0360  band 7 protein  41.41 
 
 		 327 aa  243  3.9999999999999997e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.259397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  43.77 
 
 		 369 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  44.11 
 
 		 369 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  43.1 
 
 		 311 aa  242  5e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1429  band 7 protein  43.77 
 
 		 394 aa  239  5e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  39.13 
 
 		 326 aa  236  3e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000590764  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  42.76 
 
 		 403 aa  235  8e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0564  band 7 protein  40.26 
 
 		 309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.396207  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2313  band 7 protein  42.51 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21690  SPFH domain, Band 7 family protein  43.25 
 
 		 429 aa  231  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.389538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1560  band 7 protein  40.92 
 
 		 322 aa  230  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.140523  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1928  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.2 
 
 		 321 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1890  stomatin-like protein  40.2 
 
 		 322 aa  230  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1880  stomatin-like protein  40.2 
 
 		 322 aa  230  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2315  band 7 protein  43.01 
 
 		 345 aa  230  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.2 
 
 		 321 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2106  SPFH domain/Band 7 family protein  40.2 
 
 		 321 aa  230  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2146  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.53 
 
 		 322 aa  229  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1863  stomatin like protein  42.11 
 
 		 312 aa  229  4e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.510549  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2174  SPFH domain/Band 7 family protein  39.87 
 
 		 322 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2064  SPFH domain/Band 7 family protein  39.54 
 
 		 322 aa  227  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101789  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1334  band 7/Mec-2 family protein  39.14 
 
 		 326 aa  226  3e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1352  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.74 
 
 		 314 aa  226  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2051  band 7 protein  42.01 
 
 		 439 aa  226  3e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.471473 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3243  SPFH domain/Band 7 family protein  39.54 
 
 		 322 aa  226  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000635475  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4807  band 7 protein  43.42 
 
 		 336 aa  225  6e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1924  band 7 protein  39.17 
 
 		 322 aa  225  7e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12020  SPFH domain, Band 7 family protein  44.94 
 
 		 396 aa  225  8e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0191878  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2501  band 7 protein  41.01 
 
 		 406 aa  225  8e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3087  band 7 protein  42.05 
 
 		 360 aa  223  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.681726  hitchhiker  0.00992897 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3439  band 7 protein  46.39 
 
 		 361 aa  223  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717632  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.55 
 
 		 316 aa  223  4.9999999999999996e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18370  SPFH domain, Band 7 family protein  43.85 
 
 		 416 aa  222  7e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.848038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1156  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.57 
 
 		 318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.149138  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3421  band 7 protein  43.17 
 
 		 402 aa  219  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>