More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0565 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C0609  band 7 protein  99.67 
 
 
305 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0555  band 7 protein  100 
 
 
305 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.857194  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0548  band 7 protein  100 
 
 
305 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0550  band 7 protein  100 
 
 
305 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0565  band 7 protein  100 
 
 
305 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  95.39 
 
 
304 aa  597  1e-169  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00440  predicted protease, membrane anchored  94.74 
 
 
305 aa  589  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3121  band 7 protein  94.74 
 
 
305 aa  589  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0568  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  94.74 
 
 
305 aa  589  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0538  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  94.74 
 
 
305 aa  589  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00445  hypothetical protein  94.74 
 
 
305 aa  589  1e-167  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0528  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  94.41 
 
 
305 aa  588  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3127  band 7 protein  94.74 
 
 
305 aa  589  1e-167  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0593  SPFH domain/band 7 family protein  94.74 
 
 
305 aa  589  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.554445 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0424  SPFH domain/band 7 family protein  94.74 
 
 
305 aa  589  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1100  band 7 protein  87.17 
 
 
304 aa  523  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3216  band 7 protein  86.09 
 
 
304 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1153  band 7 protein  86.58 
 
 
301 aa  511  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.294255  hitchhiker  0.000000366449 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3024  band 7 protein  88.82 
 
 
304 aa  512  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1034  band 7 protein  87.54 
 
 
307 aa  509  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3024  SPFH/band 7 family protein  84.21 
 
 
304 aa  504  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1268  hypothetical protein  84.21 
 
 
304 aa  504  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.169836 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3162  band 7 protein  84.21 
 
 
304 aa  504  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0571  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  81.95 
 
 
306 aa  455  1e-127  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0038  hypothetical protein  80.29 
 
 
300 aa  448  1e-125  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0497  hypothetical protein  71.1 
 
 
306 aa  441  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.988378  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01317  hypothetical protein  71.72 
 
 
304 aa  435  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004150  stomatin family protein  71.33 
 
 
305 aa  433  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0280  integral membrane protein  74.73 
 
 
307 aa  428  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2704  band 7 protein  65.53 
 
 
332 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3607  band 7 protein  67.86 
 
 
346 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3720  hypothetical protein  63.51 
 
 
344 aa  407  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3305  band 7 protein  66.79 
 
 
345 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366608  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  66.55 
 
 
309 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0416  band 7 protein  63.7 
 
 
304 aa  402  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3075  band 7 protein  62.46 
 
 
319 aa  402  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0686773 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  65.11 
 
 
328 aa  398  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4541  band 7 protein  64.08 
 
 
329 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01652  inner membrane protein  67.02 
 
 
321 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0862  band 7 protein  64.08 
 
 
336 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4303  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  70.55 
 
 
311 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0070  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  64.75 
 
 
328 aa  397  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4267  band 7 protein  65.23 
 
 
329 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  61.9 
 
 
336 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0944  band 7 protein  63.73 
 
 
331 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188485  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1446  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  64.31 
 
 
305 aa  394  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0162555  normal  0.124024 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1880  band 7 protein  63.44 
 
 
334 aa  388  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.126513  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1359  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  63.61 
 
 
334 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0198882 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6548  band 7 protein  60.55 
 
 
326 aa  376  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2215  band 7 protein  65.12 
 
 
304 aa  375  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00993156  normal  0.0579 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5109  band 7 protein  62.37 
 
 
326 aa  372  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000505876  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0138  band 7 protein  55.74 
 
 
318 aa  370  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0157  inner membrane protein  55.74 
 
 
318 aa  370  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.131876  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2735  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  65 
 
 
319 aa  364  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0929  Band 7 protein  62.85 
 
 
332 aa  364  1e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2221  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  59.74 
 
 
312 aa  359  3e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4419  band 7 protein  62.11 
 
 
319 aa  354  1e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0729  band 7 protein  44.92 
 
 
310 aa  266  2.9999999999999995e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1330  band 7 protein  43.36 
 
 
304 aa  255  7e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.373996  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0061  band 7 protein  41.18 
 
 
305 aa  252  6e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0011407  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0061  band 7 protein  41.18 
 
 
305 aa  252  6e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313093  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2310  band 7 protein  40.37 
 
 
356 aa  251  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  42.95 
 
 
311 aa  249  4e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0360  band 7 protein  41.1 
 
 
327 aa  248  8e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.259397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  41.88 
 
 
369 aa  245  4.9999999999999997e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1429  band 7 protein  44.44 
 
 
394 aa  244  9.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  42.07 
 
 
369 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1334  band 7/Mec-2 family protein  40.79 
 
 
326 aa  242  5e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1316  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.47 
 
 
316 aa  242  6e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0215756  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1132  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.47 
 
 
316 aa  242  6e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2313  band 7 protein  44.98 
 
 
398 aa  240  2.9999999999999997e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  45.45 
 
 
403 aa  238  1e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1902  band 7 protein  42.05 
 
 
311 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2033  band 7 protein  42.05 
 
 
311 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295777  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  36.2 
 
 
326 aa  236  5.0000000000000005e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000590764  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.57 
 
 
315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32562  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2468  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.57 
 
 
315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2559  membrane protein GNA1220  42.57 
 
 
315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1304  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.57 
 
 
315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26064  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3279  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.57 
 
 
315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.571401  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.57 
 
 
315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764976  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2033  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.57 
 
 
315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.30035  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1276  band 7 protein  43 
 
 
317 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.887258 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21690  SPFH domain, Band 7 family protein  41.81 
 
 
429 aa  233  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.389538  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2051  band 7 protein  45.93 
 
 
439 aa  233  3e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.471473 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5310  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.45 
 
 
311 aa  232  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0621487  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6077  band 7 protein  41.91 
 
 
311 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2000  band 7 protein  41.91 
 
 
311 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.882585  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2020  band 7 protein  41.91 
 
 
311 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1156  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.41 
 
 
318 aa  231  9e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.149138  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2048  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.24 
 
 
315 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.010338  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2227  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.49 
 
 
359 aa  231  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491741  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4626  band 7 protein  39.45 
 
 
284 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.137042 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1300  band 7 protein  41.69 
 
 
308 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.93 
 
 
316 aa  229  6e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2578  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.52 
 
 
376 aa  228  7e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1863  stomatin like protein  40.8 
 
 
312 aa  228  8e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.510549  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1364  band 7 protein  41.36 
 
 
309 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216615  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0564  band 7 protein  37.58 
 
 
309 aa  228  1e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.396207  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4890  band 7 protein  39.78 
 
 
284 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152851  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>