More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3533 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  100 
 
 		 316 aa  639    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1845  band 7 protein  72.03 
 
 		 312 aa  457  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.752422  normal  0.0149368 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1878  band 7 protein  72.58 
 
 		 311 aa  442  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292524  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0198  band 7 protein  71.61 
 
 		 318 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77854  stomatin family protein  52.1 
 
 		 367 aa  310  2e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1188  band 7 protein  49.01 
 
 		 310 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.283944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3004  band 7 protein  51.24 
 
 		 303 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  51.04 
 
 		 303 aa  300  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132668  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2962  band 7 protein  52.48 
 
 		 305 aa  301  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0881  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.54 
 
 		 336 aa  298  5e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0929  band 7 protein  51.26 
 
 		 336 aa  299  5e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2033  band 7 protein  47.59 
 
 		 311 aa  298  6e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295777  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1902  band 7 protein  47.59 
 
 		 311 aa  298  6e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0932  band 7 protein  50.9 
 
 		 336 aa  297  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114642  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3259  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50 
 
 		 304 aa  296  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849925  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2124  band 7 protein  49.15 
 
 		 303 aa  294  1e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.10084  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0935  band 7 protein  49.46 
 
 		 333 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.21928 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4837  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  47.98 
 
 		 325 aa  292  5e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1927  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.34 
 
 		 305 aa  291  7e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105311 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2436  band 7 protein  47.22 
 
 		 310 aa  291  7e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0177964  normal  0.0711842 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1364  band 7 protein  49.34 
 
 		 309 aa  291  7e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1300  band 7 protein  49.01 
 
 		 308 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1884  band 7 protein  50.17 
 
 		 305 aa  290  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0366362 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2254  band 7 protein  52.38 
 
 		 304 aa  290  3e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2022  band 7 protein  50.35 
 
 		 303 aa  290  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2764  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  52.38 
 
 		 304 aa  290  3e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.146948  normal  0.716722 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3500  band 7 protein  51.43 
 
 		 306 aa  289  5.0000000000000004e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal  0.0455255 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1701  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.53 
 
 		 310 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564295  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1423  putative transmembrane protein  48.68 
 
 		 308 aa  285  8e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.169777  decreased coverage  0.00134863 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2736  band 7 protein  52.76 
 
 		 309 aa  282  6.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5310  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.33 
 
 		 311 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0621487  normal  0.151164 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01287  stomatin family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09780)  48.96 
 
 		 427 aa  279  5e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.348085 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1276  band 7 protein  46.79 
 
 		 317 aa  279  5e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.887258 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.69 
 
 		 315 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764976  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.69 
 
 		 315 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32562  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2559  membrane protein GNA1220  46.69 
 
 		 315 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2468  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.69 
 
 		 315 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3279  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.69 
 
 		 315 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.571401  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1304  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.69 
 
 		 315 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26064  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2033  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.69 
 
 		 315 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.30035  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1455  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.8 
 
 		 312 aa  276  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2048  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.69 
 
 		 315 aa  275  5e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.010338  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6077  band 7 protein  47.33 
 
 		 311 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2000  band 7 protein  47.33 
 
 		 311 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.882585  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2020  band 7 protein  47.33 
 
 		 311 aa  275  9e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1862  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.93 
 
 		 309 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1319  band 7 protein  47.72 
 
 		 310 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1055  band 7 protein  45.12 
 
 		 312 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0705  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.57 
 
 		 309 aa  267  1e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00195694  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2834  SPFH/Band 7 domain protein  46.95 
 
 		 312 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2456  band 7 protein  46.95 
 
 		 312 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0666686  normal  0.94983 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3386  band 7 protein  43.49 
 
 		 311 aa  264  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0131502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0051  band 7 protein  44.66 
 
 		 317 aa  263  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4505  band 7 protein  44.18 
 
 		 310 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0455266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3501  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.06 
 
 		 310 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.136246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0451  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.06 
 
 		 310 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.024387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3676  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.16 
 
 		 310 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.294698  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4128  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.44 
 
 		 311 aa  261  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0492  band 7 protein  44.18 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0661891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3848  band 7 protein  44.18 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194904  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0547  band 7 protein  44.44 
 
 		 314 aa  261  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0495  band 7 protein  44.18 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0687258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0464  band 7 protein  43.49 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0471  band 7 protein  44.18 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0882327  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0416  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.44 
 
 		 310 aa  260  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00860785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3070  band 7 protein  41.61 
 
 		 315 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.358492  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3399  band 7 protein  43.94 
 
 		 312 aa  258  7e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0465  band 7 protein  43.15 
 
 		 311 aa  258  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.163647  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0704  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.7 
 
 		 305 aa  248  9e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0473975  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4506  band 7 protein  42.91 
 
 		 310 aa  237  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.145449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3387  band 7 protein  43.88 
 
 		 308 aa  236  4e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000435032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0416  band 7 protein  42.86 
 
 		 304 aa  235  6e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0546  band 7 protein  40.13 
 
 		 311 aa  235  9e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000115645  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0464  band 7 protein  42.2 
 
 		 315 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3677  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.99 
 
 		 311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00253892  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4129  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.99 
 
 		 311 aa  233  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3502  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.99 
 
 		 311 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000309206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.04 
 
 		 309 aa  232  6e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0450  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.64 
 
 		 311 aa  231  9e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000868784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0609  band 7 protein  40.42 
 
 		 305 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00440  predicted protease, membrane anchored  39.48 
 
 		 305 aa  230  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3121  band 7 protein  39.48 
 
 		 305 aa  230  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0538  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.48 
 
 		 305 aa  230  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0424  SPFH domain/band 7 family protein  39.48 
 
 		 305 aa  230  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0568  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.48 
 
 		 305 aa  230  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00445  hypothetical protein  39.48 
 
 		 305 aa  230  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3127  band 7 protein  39.48 
 
 		 305 aa  230  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0593  SPFH domain/band 7 family protein  39.48 
 
 		 305 aa  230  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.554445 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0548  band 7 protein  39.93 
 
 		 305 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0555  band 7 protein  39.93 
 
 		 305 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.857194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0550  band 7 protein  39.93 
 
 		 305 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0528  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.16 
 
 		 305 aa  229  6e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0565  band 7 protein  39.93 
 
 		 305 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0463  band 7 protein  43.28 
 
 		 309 aa  228  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3849  band 7 protein  41.28 
 
 		 311 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.11304  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0494  band 7 protein  41.28 
 
 		 311 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00223241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0491  band 7 protein  41.28 
 
 		 311 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000139691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0470  band 7 protein  41.28 
 
 		 311 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000506406  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.28 
 
 		 304 aa  226  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3075  band 7 protein  43.21 
 
 		 319 aa  226  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0686773 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>