More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0463 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0463  band 7 protein  100 
 
 
309 aa  630  1e-179  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4506  band 7 protein  92.88 
 
 
310 aa  595  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.145449  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0464  band 7 protein  90.45 
 
 
315 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000987812  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3387  band 7 protein  89.97 
 
 
308 aa  570  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000435032  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0546  band 7 protein  85.85 
 
 
311 aa  551  1e-156  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000115645  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3849  band 7 protein  85.21 
 
 
311 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.11304  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0494  band 7 protein  85.21 
 
 
311 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00223241  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0491  band 7 protein  85.21 
 
 
311 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000139691  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0450  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  84.57 
 
 
311 aa  547  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000868784  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0470  band 7 protein  85.21 
 
 
311 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000506406  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3502  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  84.24 
 
 
311 aa  545  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000309206  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3400  band 7 protein  84.79 
 
 
309 aa  546  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4129  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  83.6 
 
 
311 aa  543  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3677  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  83.92 
 
 
311 aa  543  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00253892  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3071  band 7 protein  82.12 
 
 
314 aa  521  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0976397  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0415  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  84.11 
 
 
304 aa  502  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00776532  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1188  band 7 protein  50.66 
 
 
310 aa  315  9e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.283944  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0705  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.44 
 
 
309 aa  298  7e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00195694  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0935  band 7 protein  51.26 
 
 
333 aa  298  8e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.21928 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1055  band 7 protein  46.26 
 
 
312 aa  295  6e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3004  band 7 protein  48.12 
 
 
303 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0929  band 7 protein  48.86 
 
 
336 aa  278  6e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0932  band 7 protein  48.86 
 
 
336 aa  278  9e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114642  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0881  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  49.24 
 
 
336 aa  276  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3399  band 7 protein  46.53 
 
 
312 aa  276  3e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3501  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.83 
 
 
310 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.136246  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0451  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.83 
 
 
310 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.024387  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4128  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.83 
 
 
311 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3676  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.49 
 
 
310 aa  273  3e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.294698  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0492  band 7 protein  45.49 
 
 
312 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0661891  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0471  band 7 protein  45.49 
 
 
312 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0882327  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3848  band 7 protein  45.49 
 
 
312 aa  272  6e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194904  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0547  band 7 protein  45.14 
 
 
314 aa  272  6e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0495  band 7 protein  45.49 
 
 
312 aa  272  6e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0687258  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0416  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  47.25 
 
 
310 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00860785  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0704  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.44 
 
 
305 aa  269  4e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0473975  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4505  band 7 protein  45.21 
 
 
310 aa  269  4e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0455266  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0465  band 7 protein  44.52 
 
 
311 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.163647  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3386  band 7 protein  44.52 
 
 
311 aa  268  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0131502  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3070  band 7 protein  44.25 
 
 
315 aa  265  7e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.358492  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2124  band 7 protein  43.52 
 
 
303 aa  264  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.10084  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0464  band 7 protein  43.84 
 
 
312 aa  264  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1902  band 7 protein  40.26 
 
 
311 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2033  band 7 protein  40.26 
 
 
311 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295777  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1701  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.46 
 
 
310 aa  262  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564295  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.45 
 
 
303 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132668  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2436  band 7 protein  42.46 
 
 
310 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0177964  normal  0.0711842 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0051  band 7 protein  44.33 
 
 
317 aa  260  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3259  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.45 
 
 
304 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849925  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2022  band 7 protein  43.45 
 
 
303 aa  257  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.96 
 
 
315 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764976  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.96 
 
 
315 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32562  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2559  membrane protein GNA1220  41.96 
 
 
315 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1304  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.96 
 
 
315 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26064  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3279  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.96 
 
 
315 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.571401  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2033  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.96 
 
 
315 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.30035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2468  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.96 
 
 
315 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2048  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.96 
 
 
315 aa  256  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.010338  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5310  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.26 
 
 
311 aa  255  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0621487  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1423  putative transmembrane protein  42 
 
 
308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.169777  decreased coverage  0.00134863 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1300  band 7 protein  42.41 
 
 
308 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1364  band 7 protein  42.41 
 
 
309 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216615  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1455  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.86 
 
 
312 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3500  band 7 protein  43.91 
 
 
306 aa  254  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal  0.0455255 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1276  band 7 protein  41.26 
 
 
317 aa  253  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.887258 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2020  band 7 protein  41.26 
 
 
311 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6077  band 7 protein  41.26 
 
 
311 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2000  band 7 protein  41.26 
 
 
311 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.882585  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1319  band 7 protein  45.11 
 
 
310 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184224  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2254  band 7 protein  45.33 
 
 
304 aa  251  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1862  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.57 
 
 
309 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2764  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.33 
 
 
304 aa  251  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.146948  normal  0.716722 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2456  band 7 protein  44.93 
 
 
312 aa  250  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0666686  normal  0.94983 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2834  SPFH/Band 7 domain protein  44.93 
 
 
312 aa  250  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2962  band 7 protein  43.91 
 
 
305 aa  248  7e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1884  band 7 protein  42.36 
 
 
305 aa  245  6e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0366362 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77854  stomatin family protein  42.8 
 
 
367 aa  243  1.9999999999999999e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1927  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.38 
 
 
305 aa  242  6e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0105311 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2736  band 7 protein  46.39 
 
 
309 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.2 
 
 
316 aa  232  7.000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1845  band 7 protein  43.24 
 
 
312 aa  230  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.752422  normal  0.0149368 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1878  band 7 protein  43.98 
 
 
311 aa  227  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292524  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0198  band 7 protein  43.82 
 
 
318 aa  216  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01287  stomatin family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09780)  38.33 
 
 
427 aa  214  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.348085 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0466  band 7 protein  40.3 
 
 
321 aa  208  7e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0480  band 7 protein  40.3 
 
 
321 aa  208  7e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2247  band 7 protein  38.27 
 
 
324 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0154537 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1226  band 7 protein  36.58 
 
 
293 aa  199  6e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1890  stomatin-like protein  39.52 
 
 
322 aa  199  7e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1880  stomatin-like protein  39.52 
 
 
322 aa  199  7e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2146  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.52 
 
 
322 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1928  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.52 
 
 
321 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.52 
 
 
321 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2174  SPFH domain/Band 7 family protein  39.52 
 
 
322 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2106  SPFH domain/Band 7 family protein  39.52 
 
 
321 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06901  Band 7 protein  38.89 
 
 
304 aa  198  7.999999999999999e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1560  band 7 protein  37.9 
 
 
322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.140523  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  36.78 
 
 
311 aa  196  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2064  SPFH domain/Band 7 family protein  38.31 
 
 
322 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101789  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3243  SPFH domain/Band 7 family protein  38.31 
 
 
322 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000635475  normal  0.334624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>