More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1188 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1188  band 7 protein  100 
 
 
310 aa  627  1e-179  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.283944  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1055  band 7 protein  60.64 
 
 
312 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0935  band 7 protein  58.21 
 
 
333 aa  349  3e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.21928 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0932  band 7 protein  56.94 
 
 
336 aa  347  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114642  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0051  band 7 protein  58.31 
 
 
317 aa  347  2e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0881  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  56.58 
 
 
336 aa  345  4e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0929  band 7 protein  56.58 
 
 
336 aa  345  5e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3386  band 7 protein  55.67 
 
 
311 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0131502  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3004  band 7 protein  53.98 
 
 
303 aa  338  7e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4128  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  54.26 
 
 
311 aa  333  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3501  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  53.15 
 
 
310 aa  333  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.136246  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0451  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  53.15 
 
 
310 aa  333  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.024387  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3676  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  53.9 
 
 
310 aa  332  4e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.294698  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0416  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  58.17 
 
 
310 aa  332  5e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00860785  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0547  band 7 protein  53.55 
 
 
314 aa  332  6e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1902  band 7 protein  50.32 
 
 
311 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2033  band 7 protein  50.32 
 
 
311 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295777  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2436  band 7 protein  51.16 
 
 
310 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0177964  normal  0.0711842 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3399  band 7 protein  54.84 
 
 
312 aa  330  2e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0471  band 7 protein  53.55 
 
 
312 aa  329  4e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0882327  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0492  band 7 protein  53.55 
 
 
312 aa  329  4e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0661891  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0495  band 7 protein  53.55 
 
 
312 aa  329  4e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0687258  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3070  band 7 protein  53.15 
 
 
315 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.358492  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3848  band 7 protein  53.55 
 
 
312 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194904  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1701  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.83 
 
 
310 aa  328  8e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564295  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0465  band 7 protein  53.9 
 
 
311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.163647  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2022  band 7 protein  52.22 
 
 
303 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1423  putative transmembrane protein  52.63 
 
 
308 aa  326  3e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.169777  decreased coverage  0.00134863 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1300  band 7 protein  52.3 
 
 
308 aa  324  9e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2124  band 7 protein  52.4 
 
 
303 aa  323  3e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.10084  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1455  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  52.9 
 
 
312 aa  322  5e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4505  band 7 protein  52.48 
 
 
310 aa  322  6e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0455266  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1364  band 7 protein  52.82 
 
 
309 aa  322  7e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216615  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0464  band 7 protein  52.58 
 
 
312 aa  321  8e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.49 
 
 
315 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32562  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2468  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.49 
 
 
315 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1304  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.49 
 
 
315 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26064  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2559  membrane protein GNA1220  50.49 
 
 
315 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3279  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.49 
 
 
315 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.571401  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.49 
 
 
315 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764976  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2033  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.49 
 
 
315 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.30035  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1276  band 7 protein  50 
 
 
317 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.887258 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5310  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  51.01 
 
 
311 aa  319  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0621487  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2048  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.33 
 
 
315 aa  319  3e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.010338  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  52.05 
 
 
303 aa  320  3e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132668  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3500  band 7 protein  52.45 
 
 
306 aa  317  1e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal  0.0455255 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2020  band 7 protein  51.01 
 
 
311 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6077  band 7 protein  51.01 
 
 
311 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2000  band 7 protein  51.01 
 
 
311 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.882585  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1927  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  52.16 
 
 
305 aa  317  2e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0105311 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0705  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.5 
 
 
309 aa  316  4e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00195694  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2962  band 7 protein  53.82 
 
 
305 aa  315  5e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1862  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  55.11 
 
 
309 aa  315  8e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1884  band 7 protein  51.52 
 
 
305 aa  313  1.9999999999999998e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0366362 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0463  band 7 protein  51.2 
 
 
309 aa  310  2e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3259  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  49 
 
 
304 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849925  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  49.01 
 
 
316 aa  307  1.0000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3071  band 7 protein  51.72 
 
 
314 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0976397  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2254  band 7 protein  51.67 
 
 
304 aa  306  3e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2764  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  51.67 
 
 
304 aa  306  3e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.146948  normal  0.716722 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1319  band 7 protein  51.97 
 
 
310 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184224  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3387  band 7 protein  49.3 
 
 
308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000435032  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4506  band 7 protein  48.94 
 
 
310 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.145449  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0464  band 7 protein  49.3 
 
 
315 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000987812  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0546  band 7 protein  48.81 
 
 
311 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000115645  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3677  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50 
 
 
311 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00253892  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4129  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  49.64 
 
 
311 aa  301  9e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3502  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50 
 
 
311 aa  301  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000309206  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3849  band 7 protein  48.79 
 
 
311 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.11304  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0491  band 7 protein  48.79 
 
 
311 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000139691  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0470  band 7 protein  48.79 
 
 
311 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000506406  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0494  band 7 protein  48.79 
 
 
311 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00223241  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0450  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  49.64 
 
 
311 aa  300  3e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000868784  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3400  band 7 protein  49.65 
 
 
309 aa  299  3e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77854  stomatin family protein  49.46 
 
 
367 aa  297  1e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0704  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  52 
 
 
305 aa  296  3e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0473975  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2736  band 7 protein  52.46 
 
 
309 aa  295  9e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0415  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.93 
 
 
304 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00776532  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2834  SPFH/Band 7 domain protein  46.29 
 
 
312 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2456  band 7 protein  46.29 
 
 
312 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0666686  normal  0.94983 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01287  stomatin family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09780)  48.59 
 
 
427 aa  273  2.0000000000000002e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.348085 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1878  band 7 protein  46.29 
 
 
311 aa  273  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292524  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1845  band 7 protein  45.26 
 
 
312 aa  271  8.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.752422  normal  0.0149368 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0198  band 7 protein  46.71 
 
 
318 aa  259  6e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1632  band 7 protein  44.01 
 
 
315 aa  236  3e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3075  band 7 protein  41.23 
 
 
319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0686773 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4419  band 7 protein  41.64 
 
 
319 aa  232  5e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01652  inner membrane protein  40.88 
 
 
321 aa  232  7.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  49.57 
 
 
403 aa  226  3e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  37.58 
 
 
326 aa  225  9e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000590764  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21690  SPFH domain, Band 7 family protein  40.96 
 
 
429 aa  224  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.389538  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4837  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.39 
 
 
325 aa  222  4.9999999999999996e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2221  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.4 
 
 
312 aa  221  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674457 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00440  predicted protease, membrane anchored  37.86 
 
 
305 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3121  band 7 protein  37.86 
 
 
305 aa  218  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0568  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.86 
 
 
305 aa  218  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0157  inner membrane protein  36.89 
 
 
318 aa  218  1e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.131876  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1714  band 7 protein  41.2 
 
 
314 aa  218  1e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3127  band 7 protein  37.86 
 
 
305 aa  218  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0538  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.86 
 
 
305 aa  218  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>