More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3387 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3387  band 7 protein  100 
 
 		 308 aa  629  1e-179  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000435032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4506  band 7 protein  90.65 
 
 		 310 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.145449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0464  band 7 protein  86.98 
 
 		 315 aa  558  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3849  band 7 protein  86.08 
 
 		 311 aa  554  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.11304  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4129  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  87.71 
 
 		 311 aa  554  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0491  band 7 protein  86.08 
 
 		 311 aa  554  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000139691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0470  band 7 protein  86.08 
 
 		 311 aa  554  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000506406  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0494  band 7 protein  86.08 
 
 		 311 aa  554  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00223241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3502  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  87.04 
 
 		 311 aa  551  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000309206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0450  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  87.04 
 
 		 311 aa  550  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000868784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3677  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  86.71 
 
 		 311 aa  550  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00253892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0546  band 7 protein  85.85 
 
 		 311 aa  550  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000115645  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0463  band 7 protein  90.54 
 
 		 309 aa  547  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3400  band 7 protein  83.5 
 
 		 309 aa  535  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3071  band 7 protein  84 
 
 		 314 aa  521  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0976397  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0415  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  84 
 
 		 304 aa  497  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00776532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1188  band 7 protein  49.3 
 
 		 310 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.283944  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0705  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.63 
 
 		 309 aa  295  8e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00195694  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1055  band 7 protein  46.1 
 
 		 312 aa  294  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0935  band 7 protein  47.93 
 
 		 333 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.21928 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3004  band 7 protein  46.99 
 
 		 303 aa  280  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0929  band 7 protein  49.24 
 
 		 336 aa  276  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0932  band 7 protein  49.24 
 
 		 336 aa  275  6e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114642  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0416  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.35 
 
 		 310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00860785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0881  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.48 
 
 		 336 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3386  band 7 protein  44.86 
 
 		 311 aa  271  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0131502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0465  band 7 protein  45.21 
 
 		 311 aa  271  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.163647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3399  band 7 protein  46.53 
 
 		 312 aa  270  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4128  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.18 
 
 		 311 aa  269  5e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3501  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.83 
 
 		 310 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.136246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0451  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.83 
 
 		 310 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.024387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3676  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.83 
 
 		 310 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.294698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3848  band 7 protein  45.49 
 
 		 312 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194904  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0471  band 7 protein  45.49 
 
 		 312 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0882327  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0547  band 7 protein  45.49 
 
 		 314 aa  267  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0492  band 7 protein  45.49 
 
 		 312 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0661891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0495  band 7 protein  45.49 
 
 		 312 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0687258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4505  band 7 protein  44.86 
 
 		 310 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0455266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3070  band 7 protein  44.83 
 
 		 315 aa  263  4e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.358492  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0704  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  47.27 
 
 		 305 aa  262  4.999999999999999e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0473975  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0464  band 7 protein  44.52 
 
 		 312 aa  262  6e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5310  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.98 
 
 		 311 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0621487  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2033  band 7 protein  40.13 
 
 		 311 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295777  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1902  band 7 protein  40.13 
 
 		 311 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2456  band 7 protein  42.95 
 
 		 312 aa  259  4e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0666686  normal  0.94983 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2834  SPFH/Band 7 domain protein  42.95 
 
 		 312 aa  259  4e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1701  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.11 
 
 		 310 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0051  band 7 protein  43.88 
 
 		 317 aa  257  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1364  band 7 protein  44.14 
 
 		 309 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2436  band 7 protein  42.11 
 
 		 310 aa  256  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0177964  normal  0.0711842 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1300  band 7 protein  43.79 
 
 		 308 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.46 
 
 		 315 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32562  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2559  membrane protein GNA1220  43.46 
 
 		 315 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1304  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.46 
 
 		 315 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26064  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3279  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.46 
 
 		 315 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.571401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2468  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.46 
 
 		 315 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.46 
 
 		 315 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764976  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2033  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.46 
 
 		 315 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.30035  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1423  putative transmembrane protein  42.38 
 
 		 308 aa  255  6e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.169777  decreased coverage  0.00134863 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.52 
 
 		 303 aa  255  6e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132668  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2048  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.46 
 
 		 315 aa  254  9e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.010338  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2124  band 7 protein  42.52 
 
 		 303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.10084  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1862  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.4 
 
 		 309 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6077  band 7 protein  40.33 
 
 		 311 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2000  band 7 protein  40.33 
 
 		 311 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.882585  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2022  band 7 protein  43.1 
 
 		 303 aa  252  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2020  band 7 protein  40.46 
 
 		 311 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1276  band 7 protein  42.4 
 
 		 317 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.887258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3500  band 7 protein  44.65 
 
 		 306 aa  251  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal  0.0455255 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1319  band 7 protein  43.46 
 
 		 310 aa  250  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1455  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.28 
 
 		 312 aa  248  7e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3259  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.41 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849925  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2962  band 7 protein  43.21 
 
 		 305 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1884  band 7 protein  42.51 
 
 		 305 aa  241  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0366362 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2254  band 7 protein  43.24 
 
 		 304 aa  240  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2764  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.24 
 
 		 304 aa  240  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.146948  normal  0.716722 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1927  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.61 
 
 		 305 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105311 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77854  stomatin family protein  42.07 
 
 		 367 aa  238  6.999999999999999e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.88 
 
 		 316 aa  236  4e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1845  band 7 protein  44.02 
 
 		 312 aa  232  5e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.752422  normal  0.0149368 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1878  band 7 protein  45.23 
 
 		 311 aa  230  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292524  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2736  band 7 protein  43.73 
 
 		 309 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0198  band 7 protein  42.4 
 
 		 318 aa  220  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01287  stomatin family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09780)  39.45 
 
 		 427 aa  215  9e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.348085 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0480  band 7 protein  38.93 
 
 		 321 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0466  band 7 protein  38.93 
 
 		 321 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2247  band 7 protein  38.27 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0154537 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  34.9 
 
 		 311 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1928  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.92 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1890  stomatin-like protein  39.92 
 
 		 322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1880  stomatin-like protein  39.92 
 
 		 322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2106  SPFH domain/Band 7 family protein  39.92 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.92 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2174  SPFH domain/Band 7 family protein  39.92 
 
 		 322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2146  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.92 
 
 		 322 aa  196  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1560  band 7 protein  38.31 
 
 		 322 aa  195  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.140523  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4419  band 7 protein  35.35 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0528  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.55 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1714  band 7 protein  38.19 
 
 		 314 aa  193  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1226  band 7 protein  36.24 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>