More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0492 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0492  band 7 protein  100 
 
 
312 aa  644    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0661891  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0471  band 7 protein  100 
 
 
312 aa  644    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0882327  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3848  band 7 protein  99.68 
 
 
312 aa  642    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194904  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0495  band 7 protein  99.36 
 
 
312 aa  642    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0687258  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3676  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  96.44 
 
 
310 aa  620  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.294698  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4128  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  95.47 
 
 
311 aa  619  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0547  band 7 protein  96.43 
 
 
314 aa  618  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3501  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  95.79 
 
 
310 aa  616  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.136246  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0451  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  95.79 
 
 
310 aa  616  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.024387  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0464  band 7 protein  89.87 
 
 
312 aa  580  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3070  band 7 protein  88.24 
 
 
315 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.358492  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3399  band 7 protein  88.89 
 
 
312 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0465  band 7 protein  88.24 
 
 
311 aa  570  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.163647  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4505  band 7 protein  87.58 
 
 
310 aa  565  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0455266  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3386  band 7 protein  85.95 
 
 
311 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0131502  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0416  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  85.81 
 
 
310 aa  542  1e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00860785  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1188  band 7 protein  53.55 
 
 
310 aa  329  4e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.283944  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1055  band 7 protein  52.52 
 
 
312 aa  316  3e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1902  band 7 protein  44.41 
 
 
311 aa  291  7e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0935  band 7 protein  52.47 
 
 
333 aa  291  7e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.21928 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0704  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.37 
 
 
305 aa  291  7e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0473975  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2033  band 7 protein  44.41 
 
 
311 aa  291  7e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295777  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0929  band 7 protein  51.33 
 
 
336 aa  291  7e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0932  band 7 protein  50.95 
 
 
336 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114642  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3004  band 7 protein  49.63 
 
 
303 aa  288  7e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0881  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.95 
 
 
336 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2436  band 7 protein  45.36 
 
 
310 aa  286  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0177964  normal  0.0711842 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2124  band 7 protein  46.62 
 
 
303 aa  285  8e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.10084  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1701  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.02 
 
 
310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564295  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5310  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.49 
 
 
311 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0621487  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1276  band 7 protein  44.06 
 
 
317 aa  281  9e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.887258 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0705  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.55 
 
 
309 aa  281  1e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00195694  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3500  band 7 protein  47.29 
 
 
306 aa  280  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal  0.0455255 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.33 
 
 
303 aa  279  5e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132668  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2048  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.55 
 
 
315 aa  278  9e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.010338  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3259  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.61 
 
 
304 aa  278  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849925  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.55 
 
 
315 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32562  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2559  membrane protein GNA1220  43.55 
 
 
315 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1300  band 7 protein  44.48 
 
 
308 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3279  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.55 
 
 
315 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.571401  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1304  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.55 
 
 
315 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2468  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.55 
 
 
315 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.55 
 
 
315 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764976  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2033  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.55 
 
 
315 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.30035  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1364  band 7 protein  45.27 
 
 
309 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216615  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1927  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.56 
 
 
305 aa  276  3e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0105311 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2022  band 7 protein  44.67 
 
 
303 aa  276  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6077  band 7 protein  42.81 
 
 
311 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2000  band 7 protein  42.81 
 
 
311 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.882585  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2020  band 7 protein  42.81 
 
 
311 aa  275  6e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1423  putative transmembrane protein  44.95 
 
 
308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.169777  decreased coverage  0.00134863 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0051  band 7 protein  48.25 
 
 
317 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1319  band 7 protein  45.93 
 
 
310 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184224  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1455  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.03 
 
 
312 aa  272  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2962  band 7 protein  46.21 
 
 
305 aa  273  4.0000000000000004e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3071  band 7 protein  44.03 
 
 
314 aa  270  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0976397  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0463  band 7 protein  45.88 
 
 
309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0464  band 7 protein  44.18 
 
 
315 aa  268  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000987812  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3387  band 7 protein  45.49 
 
 
308 aa  267  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000435032  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1884  band 7 protein  45.94 
 
 
305 aa  266  4e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0366362 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2254  band 7 protein  45.39 
 
 
304 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2764  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.39 
 
 
304 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.146948  normal  0.716722 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4506  band 7 protein  43.49 
 
 
310 aa  265  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.145449  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1862  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.84 
 
 
309 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.18 
 
 
316 aa  261  1e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3400  band 7 protein  42.32 
 
 
309 aa  261  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4129  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.98 
 
 
311 aa  260  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3502  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.64 
 
 
311 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000309206  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0546  band 7 protein  41.98 
 
 
311 aa  258  7e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000115645  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0450  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.64 
 
 
311 aa  258  9e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000868784  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0494  band 7 protein  41.3 
 
 
311 aa  257  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00223241  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2736  band 7 protein  47.04 
 
 
309 aa  256  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3677  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.3 
 
 
311 aa  257  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00253892  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0470  band 7 protein  41.3 
 
 
311 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000506406  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3849  band 7 protein  41.3 
 
 
311 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.11304  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0491  band 7 protein  41.3 
 
 
311 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000139691  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2456  band 7 protein  43.87 
 
 
312 aa  251  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0666686  normal  0.94983 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2834  SPFH/Band 7 domain protein  43.87 
 
 
312 aa  251  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0415  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.9 
 
 
304 aa  247  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00776532  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77854  stomatin family protein  43.21 
 
 
367 aa  246  3e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1845  band 7 protein  42.59 
 
 
312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.752422  normal  0.0149368 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1878  band 7 protein  42.32 
 
 
311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292524  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0198  band 7 protein  43.12 
 
 
318 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01287  stomatin family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09780)  42.59 
 
 
427 aa  226  6e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.348085 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  49.17 
 
 
403 aa  221  9.999999999999999e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21690  SPFH domain, Band 7 family protein  45.04 
 
 
429 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.389538  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1632  band 7 protein  38.14 
 
 
315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1429  band 7 protein  43.93 
 
 
394 aa  211  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2313  band 7 protein  44.87 
 
 
398 aa  204  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4837  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.01 
 
 
325 aa  202  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  38.37 
 
 
311 aa  202  5e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2051  band 7 protein  48.37 
 
 
439 aa  201  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.471473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4807  band 7 protein  41.84 
 
 
336 aa  200  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8850  SPFH/band 7 domain protein  43.67 
 
 
356 aa  199  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  42.15 
 
 
369 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3087  band 7 protein  45.62 
 
 
360 aa  196  5.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.681726  hitchhiker  0.00992897 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  42.15 
 
 
369 aa  196  6e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1863  stomatin like protein  35.67 
 
 
312 aa  195  8.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.510549  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18370  SPFH domain, Band 7 family protein  46.51 
 
 
416 aa  194  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.848038  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2315  band 7 protein  39.26 
 
 
345 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>