More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4419 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4419  band 7 protein  100 
 
 
319 aa  640    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3075  band 7 protein  63.52 
 
 
319 aa  404  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0686773 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  63.32 
 
 
309 aa  387  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01652  inner membrane protein  60.26 
 
 
321 aa  385  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00440  predicted protease, membrane anchored  60.27 
 
 
305 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3121  band 7 protein  60.27 
 
 
305 aa  382  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0548  band 7 protein  60.94 
 
 
305 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0555  band 7 protein  60.94 
 
 
305 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.857194  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00445  hypothetical protein  60.27 
 
 
305 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0593  SPFH domain/band 7 family protein  60.27 
 
 
305 aa  382  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.554445 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  59.8 
 
 
304 aa  382  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0550  band 7 protein  60.94 
 
 
305 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0424  SPFH domain/band 7 family protein  60.27 
 
 
305 aa  381  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0538  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  60.27 
 
 
305 aa  382  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0568  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  60.27 
 
 
305 aa  382  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3127  band 7 protein  60.27 
 
 
305 aa  382  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0565  band 7 protein  60.94 
 
 
305 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0609  band 7 protein  60.94 
 
 
305 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0528  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  59.93 
 
 
305 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0138  band 7 protein  55.66 
 
 
318 aa  375  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2221  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  65.86 
 
 
312 aa  376  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674457 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3720  hypothetical protein  60.27 
 
 
344 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0157  inner membrane protein  55.66 
 
 
318 aa  375  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.131876  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6548  band 7 protein  60 
 
 
326 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4541  band 7 protein  56.91 
 
 
329 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  57.83 
 
 
336 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3607  band 7 protein  61.27 
 
 
346 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2704  band 7 protein  59.4 
 
 
332 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0944  band 7 protein  60.14 
 
 
331 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188485  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3305  band 7 protein  60.92 
 
 
345 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366608  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4267  band 7 protein  59.67 
 
 
329 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0416  band 7 protein  60.48 
 
 
304 aa  366  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0497  hypothetical protein  60.81 
 
 
306 aa  364  1e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.988378  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5109  band 7 protein  56.97 
 
 
326 aa  364  1e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000505876  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0862  band 7 protein  59.79 
 
 
336 aa  362  4e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  59.93 
 
 
328 aa  360  1e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0070  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  59.57 
 
 
328 aa  358  5e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1880  band 7 protein  57.48 
 
 
334 aa  358  8e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.126513  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1359  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  59.4 
 
 
334 aa  356  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0198882 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01317  hypothetical protein  61.03 
 
 
304 aa  356  2.9999999999999997e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004150  stomatin family protein  60.69 
 
 
305 aa  355  7.999999999999999e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0929  Band 7 protein  57.47 
 
 
332 aa  352  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2215  band 7 protein  63.6 
 
 
304 aa  348  5e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00993156  normal  0.0579 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1100  band 7 protein  58.59 
 
 
304 aa  348  1e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0280  integral membrane protein  60.29 
 
 
307 aa  345  5e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1153  band 7 protein  57.14 
 
 
301 aa  345  6e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.294255  hitchhiker  0.000000366449 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3162  band 7 protein  58.11 
 
 
304 aa  342  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3024  SPFH/band 7 family protein  58.11 
 
 
304 aa  342  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3216  band 7 protein  57.24 
 
 
304 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1268  hypothetical protein  58.11 
 
 
304 aa  342  2.9999999999999997e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.169836 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0571  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  62.45 
 
 
306 aa  341  1e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4303  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  58.03 
 
 
311 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1034  band 7 protein  61.01 
 
 
307 aa  336  2.9999999999999997e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3024  band 7 protein  61.01 
 
 
304 aa  336  2.9999999999999997e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1446  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  51.96 
 
 
305 aa  324  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0162555  normal  0.124024 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0038  hypothetical protein  57.4 
 
 
300 aa  320  3e-86  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2735  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  57.8 
 
 
319 aa  312  5.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5310  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.66 
 
 
311 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0621487  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2033  band 7 protein  44.98 
 
 
311 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295777  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1902  band 7 protein  44.98 
 
 
311 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2020  band 7 protein  44.48 
 
 
311 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6077  band 7 protein  44.48 
 
 
311 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2000  band 7 protein  44.48 
 
 
311 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.882585  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  43.67 
 
 
311 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1276  band 7 protein  45.18 
 
 
317 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.887258 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1304  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.85 
 
 
315 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26064  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.85 
 
 
315 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32562  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2559  membrane protein GNA1220  43.85 
 
 
315 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3279  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.85 
 
 
315 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.571401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2468  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.85 
 
 
315 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.85 
 
 
315 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764976  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2033  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.85 
 
 
315 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.30035  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1701  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43 
 
 
310 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564295  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2436  band 7 protein  43 
 
 
310 aa  249  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0177964  normal  0.0711842 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2048  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.52 
 
 
315 aa  249  6e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.010338  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1188  band 7 protein  41.81 
 
 
310 aa  246  4e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.283944  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1455  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.81 
 
 
312 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2310  band 7 protein  41.3 
 
 
356 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  41.39 
 
 
369 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  40.73 
 
 
369 aa  241  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1330  band 7 protein  43.06 
 
 
304 aa  240  2e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.373996  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1429  band 7 protein  43.14 
 
 
394 aa  240  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1300  band 7 protein  43.58 
 
 
308 aa  239  5e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1863  stomatin like protein  42.02 
 
 
312 aa  239  5.999999999999999e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.510549  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1423  putative transmembrane protein  43.58 
 
 
308 aa  238  8e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.169777  decreased coverage  0.00134863 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1364  band 7 protein  43.24 
 
 
309 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216615  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  37.96 
 
 
326 aa  237  3e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000590764  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1055  band 7 protein  40.48 
 
 
312 aa  236  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1632  band 7 protein  41.27 
 
 
315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2189  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.72 
 
 
328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0577591  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1334  band 7/Mec-2 family protein  40.26 
 
 
326 aa  233  2.0000000000000002e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1319  band 7 protein  42.86 
 
 
310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184224  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1862  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.66 
 
 
309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3004  band 7 protein  40.77 
 
 
303 aa  233  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1316  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.2 
 
 
316 aa  233  3e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0215756  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1132  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.2 
 
 
316 aa  233  3e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2315  band 7 protein  42.81 
 
 
345 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0564  band 7 protein  41.67 
 
 
309 aa  233  4.0000000000000004e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.396207  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  43.01 
 
 
403 aa  232  5e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0932  band 7 protein  42.67 
 
 
336 aa  232  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>