More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3259 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3259  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  100 
 
 
304 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849925  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  89.07 
 
 
303 aa  554  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132668  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2962  band 7 protein  91.99 
 
 
305 aa  543  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2254  band 7 protein  88.12 
 
 
304 aa  537  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2124  band 7 protein  86.96 
 
 
303 aa  535  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.10084  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2022  band 7 protein  86.09 
 
 
303 aa  535  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2764  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  88.12 
 
 
304 aa  537  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.146948  normal  0.716722 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3500  band 7 protein  90.53 
 
 
306 aa  528  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal  0.0455255 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2736  band 7 protein  89.79 
 
 
309 aa  502  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1927  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  81.88 
 
 
305 aa  474  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0105311 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1884  band 7 protein  77.38 
 
 
305 aa  468  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0366362 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1902  band 7 protein  68.69 
 
 
311 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2033  band 7 protein  68.69 
 
 
311 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295777  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1701  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  68.92 
 
 
310 aa  433  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564295  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2436  band 7 protein  68.58 
 
 
310 aa  433  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0177964  normal  0.0711842 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1364  band 7 protein  70.86 
 
 
309 aa  431  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216615  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1455  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  71.62 
 
 
312 aa  428  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1423  putative transmembrane protein  71.19 
 
 
308 aa  427  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.169777  decreased coverage  0.00134863 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  69.93 
 
 
315 aa  424  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32562  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1300  band 7 protein  70.2 
 
 
308 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2468  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  69.93 
 
 
315 aa  424  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2559  membrane protein GNA1220  69.93 
 
 
315 aa  424  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3279  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  69.93 
 
 
315 aa  424  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.571401  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  69.93 
 
 
315 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764976  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1276  band 7 protein  69.7 
 
 
317 aa  425  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.887258 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1304  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  69.93 
 
 
315 aa  424  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26064  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2033  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  69.93 
 
 
315 aa  424  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.30035  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1319  band 7 protein  72.18 
 
 
310 aa  421  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184224  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5310  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  68.35 
 
 
311 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0621487  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2048  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  70.31 
 
 
315 aa  422  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.010338  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6077  band 7 protein  68.35 
 
 
311 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2000  band 7 protein  68.35 
 
 
311 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.882585  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2020  band 7 protein  68.35 
 
 
311 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1862  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  72.54 
 
 
309 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3004  band 7 protein  54.26 
 
 
303 aa  332  4e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2456  band 7 protein  53.82 
 
 
312 aa  332  5e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0666686  normal  0.94983 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2834  SPFH/Band 7 domain protein  53.82 
 
 
312 aa  332  5e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0935  band 7 protein  51.77 
 
 
333 aa  309  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.21928 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1188  band 7 protein  49 
 
 
310 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.283944  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1055  band 7 protein  51.92 
 
 
312 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0881  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.9 
 
 
336 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0929  band 7 protein  50.9 
 
 
336 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0932  band 7 protein  50.9 
 
 
336 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114642  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50 
 
 
316 aa  296  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1845  band 7 protein  49.65 
 
 
312 aa  289  5.0000000000000004e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.752422  normal  0.0149368 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0705  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  47.88 
 
 
309 aa  286  2e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00195694  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3070  band 7 protein  46.46 
 
 
315 aa  285  8e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.358492  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0547  band 7 protein  46.28 
 
 
314 aa  280  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4128  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.28 
 
 
311 aa  280  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3501  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.28 
 
 
310 aa  280  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.136246  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0451  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.28 
 
 
310 aa  280  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.024387  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1878  band 7 protein  50.18 
 
 
311 aa  280  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292524  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3676  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.95 
 
 
310 aa  279  4e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.294698  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3386  band 7 protein  45.83 
 
 
311 aa  278  7e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0131502  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0492  band 7 protein  45.61 
 
 
312 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0661891  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0471  band 7 protein  45.61 
 
 
312 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0882327  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3848  band 7 protein  45.61 
 
 
312 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194904  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0495  band 7 protein  45.61 
 
 
312 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0687258  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77854  stomatin family protein  45.64 
 
 
367 aa  276  2e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0051  band 7 protein  48.99 
 
 
317 aa  276  4e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0416  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  49.25 
 
 
310 aa  275  9e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00860785  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3399  band 7 protein  47.04 
 
 
312 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4505  band 7 protein  45.14 
 
 
310 aa  273  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0455266  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0464  band 7 protein  45.05 
 
 
312 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0465  band 7 protein  44.44 
 
 
311 aa  269  5e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.163647  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0704  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.54 
 
 
305 aa  267  2e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0473975  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0198  band 7 protein  48.6 
 
 
318 aa  264  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01287  stomatin family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09780)  49.13 
 
 
427 aa  257  1e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.348085 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4506  band 7 protein  43.97 
 
 
310 aa  255  5e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.145449  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0463  band 7 protein  45.32 
 
 
309 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0464  band 7 protein  43.26 
 
 
315 aa  252  7e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000987812  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3400  band 7 protein  41.81 
 
 
309 aa  248  7e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3071  band 7 protein  42.76 
 
 
314 aa  248  8e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0976397  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3387  band 7 protein  41.41 
 
 
308 aa  248  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000435032  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0450  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.02 
 
 
311 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000868784  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0546  band 7 protein  42.05 
 
 
311 aa  243  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000115645  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3677  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.68 
 
 
311 aa  243  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00253892  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3849  band 7 protein  39.73 
 
 
311 aa  242  5e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.11304  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0470  band 7 protein  39.73 
 
 
311 aa  242  5e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000506406  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0491  band 7 protein  39.73 
 
 
311 aa  242  5e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000139691  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3502  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.68 
 
 
311 aa  242  5e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000309206  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4129  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.34 
 
 
311 aa  242  6e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0494  band 7 protein  39.73 
 
 
311 aa  242  7e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00223241  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0415  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.51 
 
 
304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00776532  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4837  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.74 
 
 
325 aa  219  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2756  band 7 protein  39.25 
 
 
327 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  39.93 
 
 
311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3075  band 7 protein  40.36 
 
 
319 aa  216  5e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0686773 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0416  band 7 protein  41.61 
 
 
304 aa  212  4.9999999999999996e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00440  predicted protease, membrane anchored  39.58 
 
 
305 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3121  band 7 protein  39.58 
 
 
305 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0538  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.58 
 
 
305 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0593  SPFH domain/band 7 family protein  39.58 
 
 
305 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.554445 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3127  band 7 protein  39.58 
 
 
305 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0568  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.58 
 
 
305 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00445  hypothetical protein  39.58 
 
 
305 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0550  band 7 protein  37.71 
 
 
305 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0555  band 7 protein  37.71 
 
 
305 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.857194  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0565  band 7 protein  37.71 
 
 
305 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0548  band 7 protein  37.71 
 
 
305 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>