More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2310 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2310  band 7 protein  100 
 
 
356 aa  719    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  65.74 
 
 
326 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000590764  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0360  band 7 protein  63.47 
 
 
327 aa  413  1e-114  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.259397 
 
 
-
 
NC_002950  PG1334  band 7/Mec-2 family protein  64.8 
 
 
326 aa  405  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1429  band 7 protein  44.03 
 
 
394 aa  281  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21690  SPFH domain, Band 7 family protein  45.37 
 
 
429 aa  273  3e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.389538  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1330  band 7 protein  45.45 
 
 
304 aa  270  2e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.373996  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0061  band 7 protein  43.48 
 
 
305 aa  270  2e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313093  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1863  stomatin like protein  45.95 
 
 
312 aa  270  2.9999999999999997e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.510549  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  46.01 
 
 
403 aa  269  5e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18370  SPFH domain, Band 7 family protein  47.28 
 
 
416 aa  269  5e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.848038  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0061  band 7 protein  43.17 
 
 
305 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0011407  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0729  band 7 protein  42.56 
 
 
310 aa  267  2e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2578  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.03 
 
 
376 aa  266  4e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1352  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.97 
 
 
314 aa  264  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4807  band 7 protein  44.32 
 
 
336 aa  264  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2313  band 7 protein  43.91 
 
 
398 aa  263  4.999999999999999e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  43.52 
 
 
369 aa  261  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2312  band 7 protein  43.71 
 
 
473 aa  261  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00180673  hitchhiker  0.000141748 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2051  band 7 protein  43.71 
 
 
439 aa  260  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.471473 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1156  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.25 
 
 
318 aa  258  9e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.149138  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8850  SPFH/band 7 domain protein  44.94 
 
 
356 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2756  band 7 protein  43.65 
 
 
327 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  43.21 
 
 
369 aa  258  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11517  hypothetical protein  40.39 
 
 
381 aa  256  3e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.18068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3684  band 7 protein  42.4 
 
 
327 aa  256  5e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0564  band 7 protein  40.94 
 
 
309 aa  256  6e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.396207  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00440  predicted protease, membrane anchored  41.61 
 
 
305 aa  255  8e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3121  band 7 protein  41.61 
 
 
305 aa  255  8e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00445  hypothetical protein  41.61 
 
 
305 aa  255  8e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3127  band 7 protein  41.61 
 
 
305 aa  255  8e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0568  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.61 
 
 
305 aa  255  8e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0538  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.61 
 
 
305 aa  255  8e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0593  SPFH domain/band 7 family protein  41.61 
 
 
305 aa  255  8e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.554445 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.99 
 
 
304 aa  255  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3087  band 7 protein  44.74 
 
 
360 aa  254  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.681726  hitchhiker  0.00992897 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0424  SPFH domain/band 7 family protein  41.61 
 
 
305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0528  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.3 
 
 
305 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2227  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.81 
 
 
359 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491741  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3264  band 7 protein  42.25 
 
 
359 aa  252  7e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0364403  normal  0.314741 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.77 
 
 
309 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3075  band 7 protein  41.3 
 
 
319 aa  251  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0686773 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0609  band 7 protein  40.37 
 
 
305 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0550  band 7 protein  40.37 
 
 
305 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0565  band 7 protein  40.37 
 
 
305 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0555  band 7 protein  40.37 
 
 
305 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.857194  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0548  band 7 protein  40.37 
 
 
305 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2501  band 7 protein  41.48 
 
 
406 aa  250  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2189  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.06 
 
 
328 aa  251  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0577591  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3421  band 7 protein  44.97 
 
 
402 aa  249  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2315  band 7 protein  41.67 
 
 
345 aa  248  8e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0497  hypothetical protein  42.24 
 
 
306 aa  248  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.988378  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3126  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.91 
 
 
392 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3187  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.91 
 
 
392 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4267  band 7 protein  40.06 
 
 
329 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2091  band 7 protein  41.61 
 
 
401 aa  246  6e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0259831  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3137  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.87 
 
 
392 aa  245  8e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19780  SPFH domain, Band 7 family protein  40.92 
 
 
456 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.295891  hitchhiker  0.000474854 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3653  band 7 protein  42.57 
 
 
403 aa  243  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0416  band 7 protein  40.25 
 
 
304 aa  242  7e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.69 
 
 
328 aa  241  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004150  stomatin family protein  42.63 
 
 
305 aa  241  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1100  band 7 protein  39.44 
 
 
304 aa  241  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12020  SPFH domain, Band 7 family protein  44.56 
 
 
396 aa  241  1e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0191878  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6548  band 7 protein  37.5 
 
 
326 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1268  hypothetical protein  41.19 
 
 
304 aa  241  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.169836 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3162  band 7 protein  41.19 
 
 
304 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3024  SPFH/band 7 family protein  41.19 
 
 
304 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3216  band 7 protein  38.51 
 
 
304 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0070  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.36 
 
 
328 aa  239  4e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2759  band 7 protein  40.06 
 
 
406 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.84305  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1932  band 7 protein  45.97 
 
 
315 aa  237  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000138273 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0280  integral membrane protein  43.09 
 
 
307 aa  237  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1153  band 7 protein  40.74 
 
 
301 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.294255  hitchhiker  0.000000366449 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01317  hypothetical protein  42.68 
 
 
304 aa  236  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0702  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.68 
 
 
314 aa  236  3e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2704  band 7 protein  39.8 
 
 
332 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1226  band 7 protein  39.56 
 
 
293 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3720  hypothetical protein  39.81 
 
 
344 aa  236  5.0000000000000005e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1446  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.4 
 
 
305 aa  235  7e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0162555  normal  0.124024 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3305  band 7 protein  41.14 
 
 
345 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366608  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4541  band 7 protein  41.45 
 
 
329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  40 
 
 
336 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2414  band 7 protein  43.23 
 
 
446 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1714  band 7 protein  41.35 
 
 
314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3607  band 7 protein  41.81 
 
 
346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3439  band 7 protein  44.03 
 
 
361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717632  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0862  band 7 protein  41.78 
 
 
336 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5341  band 7 protein  39.01 
 
 
307 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.207546  normal  0.117184 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0944  band 7 protein  41.45 
 
 
331 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188485  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4303  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.06 
 
 
311 aa  231  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01652  inner membrane protein  38.37 
 
 
321 aa  231  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2111  band 7 protein  41.16 
 
 
395 aa  230  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1359  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.5 
 
 
334 aa  230  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0198882 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2215  band 7 protein  40.98 
 
 
304 aa  230  3e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00993156  normal  0.0579 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0571  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44 
 
 
306 aa  230  4e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0138  band 7 protein  36.18 
 
 
318 aa  229  5e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0157  inner membrane protein  36.18 
 
 
318 aa  229  6e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.131876  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1034  band 7 protein  41.78 
 
 
307 aa  229  8e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3024  band 7 protein  41.12 
 
 
304 aa  225  9e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>