More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2414 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2414  band 7 protein  100 
 
 
446 aa  890    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11517  hypothetical protein  75.48 
 
 
381 aa  552  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.18068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2759  band 7 protein  77.2 
 
 
406 aa  548  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.84305  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3653  band 7 protein  78.84 
 
 
403 aa  542  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3137  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  77.65 
 
 
392 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19780  SPFH domain, Band 7 family protein  70.18 
 
 
456 aa  525  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.295891  hitchhiker  0.000474854 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3126  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  77.65 
 
 
392 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3187  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  77.65 
 
 
392 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2091  band 7 protein  62.61 
 
 
401 aa  513  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0259831  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3421  band 7 protein  74.16 
 
 
402 aa  490  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2312  band 7 protein  70.64 
 
 
473 aa  491  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00180673  hitchhiker  0.000141748 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2111  band 7 protein  64.04 
 
 
395 aa  394  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2578  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  59.13 
 
 
376 aa  377  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1429  band 7 protein  60.65 
 
 
394 aa  371  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21690  SPFH domain, Band 7 family protein  60.06 
 
 
429 aa  369  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.389538  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  61.59 
 
 
403 aa  370  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4807  band 7 protein  58.01 
 
 
336 aa  364  1e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2313  band 7 protein  58.36 
 
 
398 aa  360  3e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3087  band 7 protein  56 
 
 
360 aa  358  9.999999999999999e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.681726  hitchhiker  0.00992897 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1156  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  58.94 
 
 
318 aa  355  1e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.149138  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8850  SPFH/band 7 domain protein  58.67 
 
 
356 aa  352  5.9999999999999994e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3684  band 7 protein  56.17 
 
 
327 aa  352  8e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2189  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  59.08 
 
 
328 aa  348  1e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0577591  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3264  band 7 protein  59.72 
 
 
359 aa  348  2e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0364403  normal  0.314741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2315  band 7 protein  55.74 
 
 
345 aa  347  3e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1352  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  62.59 
 
 
314 aa  345  1e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18370  SPFH domain, Band 7 family protein  58.87 
 
 
416 aa  343  2.9999999999999997e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.848038  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2051  band 7 protein  58.45 
 
 
439 aa  341  1e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.471473 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12020  SPFH domain, Band 7 family protein  59.52 
 
 
396 aa  336  5e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0191878  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1932  band 7 protein  56.73 
 
 
315 aa  334  2e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000138273 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2227  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  52.48 
 
 
359 aa  330  3e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491741  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  51.37 
 
 
369 aa  330  3e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  50 
 
 
369 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2501  band 7 protein  53.74 
 
 
406 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3439  band 7 protein  53.17 
 
 
361 aa  312  7.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717632  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5341  band 7 protein  46.35 
 
 
307 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.207546  normal  0.117184 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1863  stomatin like protein  48.51 
 
 
312 aa  288  2e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.510549  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0702  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.3 
 
 
314 aa  276  4e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  44.58 
 
 
326 aa  268  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000590764  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1714  band 7 protein  46.76 
 
 
314 aa  263  6.999999999999999e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1632  band 7 protein  41.64 
 
 
315 aa  249  6e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1226  band 7 protein  45.64 
 
 
293 aa  248  2e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2310  band 7 protein  42.28 
 
 
356 aa  246  4.9999999999999997e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1334  band 7/Mec-2 family protein  43.24 
 
 
326 aa  241  2.9999999999999997e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1890  stomatin-like protein  41.67 
 
 
322 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1880  stomatin-like protein  41.67 
 
 
322 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0729  band 7 protein  42.42 
 
 
310 aa  240  2.9999999999999997e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2146  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.67 
 
 
322 aa  240  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1928  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.67 
 
 
321 aa  240  4e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2106  SPFH domain/Band 7 family protein  41.67 
 
 
321 aa  240  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.67 
 
 
321 aa  240  4e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2174  SPFH domain/Band 7 family protein  41.67 
 
 
322 aa  240  4e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2939  band 7 protein  45.36 
 
 
312 aa  239  5e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0124635  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0564  band 7 protein  40.32 
 
 
309 aa  239  5.999999999999999e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.396207  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0061  band 7 protein  41.67 
 
 
305 aa  239  8e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2064  SPFH domain/Band 7 family protein  41 
 
 
322 aa  238  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101789  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3243  SPFH domain/Band 7 family protein  41 
 
 
322 aa  238  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000635475  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1924  band 7 protein  41.33 
 
 
322 aa  238  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1560  band 7 protein  41.67 
 
 
322 aa  237  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.140523  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0061  band 7 protein  41.33 
 
 
305 aa  237  3e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0011407  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1330  band 7 protein  42.41 
 
 
304 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.373996  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0360  band 7 protein  41.67 
 
 
327 aa  232  8.000000000000001e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.259397 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  41.08 
 
 
311 aa  226  8e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1316  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.81 
 
 
316 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0215756  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1132  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.81 
 
 
316 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  39.48 
 
 
336 aa  216  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0555  band 7 protein  39.47 
 
 
305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.857194  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0548  band 7 protein  39.47 
 
 
305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0565  band 7 protein  39.47 
 
 
305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.54 
 
 
304 aa  215  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0550  band 7 protein  39.47 
 
 
305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0609  band 7 protein  39.14 
 
 
305 aa  213  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2221  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.46 
 
 
312 aa  212  7.999999999999999e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674457 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1188  band 7 protein  38.97 
 
 
310 aa  211  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.283944  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00440  predicted protease, membrane anchored  38.82 
 
 
305 aa  210  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3121  band 7 protein  38.82 
 
 
305 aa  210  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3127  band 7 protein  38.82 
 
 
305 aa  210  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00445  hypothetical protein  38.82 
 
 
305 aa  210  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0568  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.82 
 
 
305 aa  210  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0593  SPFH domain/band 7 family protein  38.82 
 
 
305 aa  210  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.554445 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0538  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.82 
 
 
305 aa  210  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0424  SPFH domain/band 7 family protein  38.82 
 
 
305 aa  210  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1572  band 7 protein  38.49 
 
 
307 aa  209  9e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0528  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.49 
 
 
305 aa  209  9e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4419  band 7 protein  37.58 
 
 
319 aa  208  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0929  Band 7 protein  40.07 
 
 
332 aa  207  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1902  band 7 protein  40 
 
 
311 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2033  band 7 protein  40 
 
 
311 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295777  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0416  band 7 protein  39.61 
 
 
304 aa  206  5e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3720  hypothetical protein  39.67 
 
 
344 aa  206  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3607  band 7 protein  40.14 
 
 
346 aa  206  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3305  band 7 protein  40.14 
 
 
345 aa  206  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366608  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0466  band 7 protein  37.05 
 
 
321 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0531  band 7 protein  38.72 
 
 
317 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.768423 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0480  band 7 protein  37.05 
 
 
321 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.03 
 
 
309 aa  204  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4303  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.32 
 
 
311 aa  204  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004150  stomatin family protein  42.25 
 
 
305 aa  204  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1952  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.6 
 
 
321 aa  204  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.664065  normal  0.0256055 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01317  hypothetical protein  38.36 
 
 
304 aa  204  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>