More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2756 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013930  TK90_2756  band 7 protein  100 
 
 		 327 aa  656    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  43.64 
 
 		 326 aa  259  4e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000590764  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2310  band 7 protein  43.65 
 
 		 356 aa  257  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0360  band 7 protein  45.16 
 
 		 327 aa  256  4e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.259397 
 
 
-
 
NC_002950  PG1334  band 7/Mec-2 family protein  44.55 
 
 		 326 aa  253  3e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1902  band 7 protein  39.88 
 
 		 311 aa  245  6e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2033  band 7 protein  39.88 
 
 		 311 aa  245  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295777  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2468  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.55 
 
 		 315 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.55 
 
 		 315 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32562  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2559  membrane protein GNA1220  38.55 
 
 		 315 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3279  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.55 
 
 		 315 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.571401  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1304  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.55 
 
 		 315 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26064  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2033  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.55 
 
 		 315 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.30035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.55 
 
 		 315 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764976  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1276  band 7 protein  40.19 
 
 		 317 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.887258 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2048  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.32 
 
 		 315 aa  242  5e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.010338  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2020  band 7 protein  39.7 
 
 		 311 aa  242  7e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6077  band 7 protein  40.19 
 
 		 311 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2000  band 7 protein  40.19 
 
 		 311 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.882585  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5310  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.56 
 
 		 311 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0621487  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1319  band 7 protein  40.82 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2436  band 7 protein  38.6 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0177964  normal  0.0711842 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1701  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.91 
 
 		 310 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  40.74 
 
 		 403 aa  229  5e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1455  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.56 
 
 		 312 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1364  band 7 protein  40.54 
 
 		 309 aa  229  6e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1300  band 7 protein  40.2 
 
 		 308 aa  228  7e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1156  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.18 
 
 		 318 aa  229  7e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.149138  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1423  putative transmembrane protein  38.12 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.169777  decreased coverage  0.00134863 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1862  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41 
 
 		 309 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0061  band 7 protein  40.25 
 
 		 305 aa  228  1e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313093  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21690  SPFH domain, Band 7 family protein  41.97 
 
 		 429 aa  227  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.389538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0061  band 7 protein  40.25 
 
 		 305 aa  227  3e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0011407  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.23 
 
 		 303 aa  226  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132668  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3684  band 7 protein  41.04 
 
 		 327 aa  226  5.0000000000000005e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8850  SPFH/band 7 domain protein  41.08 
 
 		 356 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1153  band 7 protein  37.9 
 
 		 301 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.294255  hitchhiker  0.000000366449 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1330  band 7 protein  40.71 
 
 		 304 aa  224  2e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.373996  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1352  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.69 
 
 		 314 aa  224  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00440  predicted protease, membrane anchored  38.41 
 
 		 305 aa  223  4e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3121  band 7 protein  38.41 
 
 		 305 aa  223  4e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0568  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.41 
 
 		 305 aa  223  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00445  hypothetical protein  38.41 
 
 		 305 aa  223  4e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0538  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.41 
 
 		 305 aa  223  4e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3127  band 7 protein  38.41 
 
 		 305 aa  223  4e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0593  SPFH domain/band 7 family protein  38.41 
 
 		 305 aa  223  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.554445 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2022  band 7 protein  46.31 
 
 		 303 aa  223  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0424  SPFH domain/band 7 family protein  38.41 
 
 		 305 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4807  band 7 protein  39.58 
 
 		 336 aa  222  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1429  band 7 protein  39.75 
 
 		 394 aa  222  7e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0555  band 7 protein  38.1 
 
 		 305 aa  222  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.857194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0565  band 7 protein  38.1 
 
 		 305 aa  222  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0550  band 7 protein  38.1 
 
 		 305 aa  222  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0548  band 7 protein  38.1 
 
 		 305 aa  222  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2313  band 7 protein  40.73 
 
 		 398 aa  221  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0497  hypothetical protein  38.22 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.988378  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0528  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.92 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0609  band 7 protein  37.78 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1884  band 7 protein  38.6 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0366362 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.71 
 
 		 304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1927  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.62 
 
 		 305 aa  220  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3264  band 7 protein  41.75 
 
 		 359 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0364403  normal  0.314741 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0564  band 7 protein  40.57 
 
 		 309 aa  219  3.9999999999999997e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.396207  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0729  band 7 protein  39.94 
 
 		 310 aa  219  3.9999999999999997e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1446  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.26 
 
 		 305 aa  218  7.999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0162555  normal  0.124024 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  38.83 
 
 		 369 aa  218  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1359  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.16 
 
 		 334 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198882 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3259  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.25 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849925  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1034  band 7 protein  39.8 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1188  band 7 protein  38.89 
 
 		 310 aa  217  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.283944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4267  band 7 protein  41.1 
 
 		 329 aa  218  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.54 
 
 		 316 aa  217  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1268  hypothetical protein  36.22 
 
 		 304 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.169836 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3162  band 7 protein  36.22 
 
 		 304 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3024  SPFH/band 7 family protein  36.22 
 
 		 304 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  38.26 
 
 		 369 aa  216  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004150  stomatin family protein  38.96 
 
 		 305 aa  216  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  38.51 
 
 		 336 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0571  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.25 
 
 		 306 aa  216  5e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5109  band 7 protein  38.44 
 
 		 326 aa  215  8e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000505876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01317  hypothetical protein  38.96 
 
 		 304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1100  band 7 protein  37.1 
 
 		 304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  38.41 
 
 		 311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.88 
 
 		 328 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3024  band 7 protein  38.78 
 
 		 304 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0944  band 7 protein  39.81 
 
 		 331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188485  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3720  hypothetical protein  39.2 
 
 		 344 aa  213  4.9999999999999996e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2227  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.06 
 
 		 359 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491741  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2704  band 7 protein  39.02 
 
 		 332 aa  212  7.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3075  band 7 protein  37.62 
 
 		 319 aa  212  7.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0686773 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.87 
 
 		 309 aa  211  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2834  SPFH/Band 7 domain protein  40.27 
 
 		 312 aa  211  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3087  band 7 protein  38.51 
 
 		 360 aa  211  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.681726  hitchhiker  0.00992897 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2456  band 7 protein  40.27 
 
 		 312 aa  211  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0666686  normal  0.94983 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0070  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.88 
 
 		 328 aa  211  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3500  band 7 protein  38.59 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal  0.0455255 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6548  band 7 protein  39.13 
 
 		 326 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0929  Band 7 protein  39.68 
 
 		 332 aa  210  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2254  band 7 protein  45.08 
 
 		 304 aa  211  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2764  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.08 
 
 		 304 aa  211  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.146948  normal  0.716722 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>