More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0944 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_0944  band 7 protein  100 
 
 
331 aa  668    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188485  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4541  band 7 protein  93.85 
 
 
329 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  87.99 
 
 
336 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0862  band 7 protein  90.66 
 
 
336 aa  577  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0929  Band 7 protein  83.64 
 
 
332 aa  535  1e-151  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1359  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  86.88 
 
 
334 aa  532  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0198882 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1880  band 7 protein  72.4 
 
 
334 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.126513  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6548  band 7 protein  63.38 
 
 
326 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5109  band 7 protein  63.89 
 
 
326 aa  428  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000505876  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3720  hypothetical protein  63.64 
 
 
344 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2704  band 7 protein  63.38 
 
 
332 aa  423  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3607  band 7 protein  63.88 
 
 
346 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0416  band 7 protein  67.46 
 
 
304 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  67.58 
 
 
309 aa  413  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  62.77 
 
 
328 aa  411  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3305  band 7 protein  67.76 
 
 
345 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366608  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4267  band 7 protein  62.35 
 
 
329 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0070  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  62.46 
 
 
328 aa  410  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0424  SPFH domain/band 7 family protein  63.45 
 
 
305 aa  402  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00440  predicted protease, membrane anchored  63.45 
 
 
305 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3121  band 7 protein  63.45 
 
 
305 aa  402  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0538  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  63.45 
 
 
305 aa  402  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0593  SPFH domain/band 7 family protein  63.45 
 
 
305 aa  402  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.554445 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3127  band 7 protein  63.45 
 
 
305 aa  402  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0568  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  63.45 
 
 
305 aa  402  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00445  hypothetical protein  63.45 
 
 
305 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3075  band 7 protein  61.86 
 
 
319 aa  404  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0686773 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0609  band 7 protein  61.69 
 
 
305 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0550  band 7 protein  61.69 
 
 
305 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0555  band 7 protein  61.69 
 
 
305 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.857194  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0548  band 7 protein  61.69 
 
 
305 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0528  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  63.1 
 
 
305 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0565  band 7 protein  61.69 
 
 
305 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  62.03 
 
 
304 aa  397  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01652  inner membrane protein  62.17 
 
 
321 aa  391  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1446  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  61.51 
 
 
305 aa  377  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0162555  normal  0.124024 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1100  band 7 protein  61.72 
 
 
304 aa  372  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0157  inner membrane protein  58.5 
 
 
318 aa  372  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.131876  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0138  band 7 protein  58.5 
 
 
318 aa  373  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2215  band 7 protein  68.23 
 
 
304 aa  370  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00993156  normal  0.0579 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2735  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  64.92 
 
 
319 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3216  band 7 protein  60.34 
 
 
304 aa  364  1e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0497  hypothetical protein  62.67 
 
 
306 aa  363  1e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.988378  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4303  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  59.87 
 
 
311 aa  363  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1153  band 7 protein  59.47 
 
 
301 aa  362  4e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.294255  hitchhiker  0.000000366449 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0571  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  62.41 
 
 
306 aa  361  9e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3024  SPFH/band 7 family protein  60.2 
 
 
304 aa  359  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1268  hypothetical protein  60.2 
 
 
304 aa  359  4e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.169836 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3162  band 7 protein  60.2 
 
 
304 aa  359  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3024  band 7 protein  62.77 
 
 
304 aa  359  4e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01317  hypothetical protein  62.07 
 
 
304 aa  358  5e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1034  band 7 protein  62.06 
 
 
307 aa  358  8e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2221  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  59.29 
 
 
312 aa  357  9.999999999999999e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674457 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0280  integral membrane protein  64.03 
 
 
307 aa  357  1.9999999999999998e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004150  stomatin family protein  60.34 
 
 
305 aa  355  7.999999999999999e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4419  band 7 protein  57.65 
 
 
319 aa  353  2.9999999999999997e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0038  hypothetical protein  59.22 
 
 
300 aa  340  2e-92  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1316  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.34 
 
 
316 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0215756  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1132  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.34 
 
 
316 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0729  band 7 protein  46.98 
 
 
310 aa  243  3.9999999999999997e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  40.37 
 
 
326 aa  241  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000590764  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  41.64 
 
 
311 aa  241  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1330  band 7 protein  45.67 
 
 
304 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.373996  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1620  band 7 protein  44.18 
 
 
284 aa  238  6.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000904409  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2310  band 7 protein  41.49 
 
 
356 aa  238  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2227  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.14 
 
 
359 aa  237  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491741  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2364  band 7 protein  40.61 
 
 
286 aa  238  2e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4890  band 7 protein  42.76 
 
 
284 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152851  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0061  band 7 protein  43.39 
 
 
305 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313093  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0061  band 7 protein  43.73 
 
 
305 aa  233  3e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0011407  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4834  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.81 
 
 
284 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.220458  normal  0.54169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4712  band 7 protein  42.05 
 
 
284 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.21194 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3110  band 7 protein  42.96 
 
 
282 aa  231  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00709216  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2189  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.21 
 
 
328 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0577591  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21690  SPFH domain, Band 7 family protein  43.71 
 
 
429 aa  229  4e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.389538  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4626  band 7 protein  40.99 
 
 
284 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.137042 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  41.08 
 
 
369 aa  229  6e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  41.41 
 
 
369 aa  228  8e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1429  band 7 protein  41.98 
 
 
394 aa  228  9e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0360  band 7 protein  38.11 
 
 
327 aa  227  2e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.259397 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2578  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.5 
 
 
376 aa  227  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0321  band 7 protein  42.07 
 
 
284 aa  226  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3437  band 7 protein  41.9 
 
 
283 aa  226  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.462208  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1156  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.4 
 
 
318 aa  226  3e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.149138  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0649  putative membrane protease subunit-like protein  42.61 
 
 
291 aa  226  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.384803  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2315  band 7 protein  43.4 
 
 
345 aa  226  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0297  band 7 protein  40.62 
 
 
284 aa  225  7e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0324  band 7 protein  41.32 
 
 
284 aa  225  7e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1334  band 7/Mec-2 family protein  39.67 
 
 
326 aa  225  9e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  43.64 
 
 
403 aa  225  9e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8850  SPFH/band 7 domain protein  41.14 
 
 
356 aa  225  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0564  band 7 protein  40.27 
 
 
309 aa  223  4e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.396207  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3439  band 7 protein  43.61 
 
 
361 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717632  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0462  band 7 protein  41.33 
 
 
304 aa  221  9e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3264  band 7 protein  44.65 
 
 
359 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0364403  normal  0.314741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2501  band 7 protein  39.14 
 
 
406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3684  band 7 protein  40.5 
 
 
327 aa  220  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1902  band 7 protein  40 
 
 
311 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1300  band 7 protein  42.24 
 
 
308 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1560  band 7 protein  37.66 
 
 
322 aa  220  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.140523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>