More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2578 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2578  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  100 
 
 
376 aa  752    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1156  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  67.82 
 
 
318 aa  430  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.149138  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2189  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  68.46 
 
 
328 aa  405  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0577591  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3421  band 7 protein  68.4 
 
 
402 aa  399  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8850  SPFH/band 7 domain protein  63.87 
 
 
356 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2312  band 7 protein  65.17 
 
 
473 aa  395  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00180673  hitchhiker  0.000141748 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3087  band 7 protein  69.86 
 
 
360 aa  393  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.681726  hitchhiker  0.00992897 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11517  hypothetical protein  63.33 
 
 
381 aa  392  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.18068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3684  band 7 protein  62.75 
 
 
327 aa  390  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2313  band 7 protein  61.19 
 
 
398 aa  389  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19780  SPFH domain, Band 7 family protein  63.18 
 
 
456 aa  387  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.295891  hitchhiker  0.000474854 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3264  band 7 protein  69.42 
 
 
359 aa  387  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0364403  normal  0.314741 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1932  band 7 protein  69.68 
 
 
315 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000138273 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2111  band 7 protein  61.82 
 
 
395 aa  388  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2759  band 7 protein  53.59 
 
 
406 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.84305  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1429  band 7 protein  63.12 
 
 
394 aa  379  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1352  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  70.9 
 
 
314 aa  381  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  60.2 
 
 
369 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3653  band 7 protein  53.16 
 
 
403 aa  380  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  58.36 
 
 
369 aa  380  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  65.64 
 
 
403 aa  377  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21690  SPFH domain, Band 7 family protein  65.38 
 
 
429 aa  374  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.389538  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12020  SPFH domain, Band 7 family protein  63.67 
 
 
396 aa  372  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0191878  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2315  band 7 protein  61.59 
 
 
345 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18370  SPFH domain, Band 7 family protein  66.79 
 
 
416 aa  373  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.848038  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2091  band 7 protein  59.74 
 
 
401 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0259831  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2501  band 7 protein  62.72 
 
 
406 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2414  band 7 protein  59.81 
 
 
446 aa  366  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2227  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  60 
 
 
359 aa  367  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491741  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4807  band 7 protein  62.15 
 
 
336 aa  365  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3126  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  61.75 
 
 
392 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3187  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  61.75 
 
 
392 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3137  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  61.75 
 
 
392 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2051  band 7 protein  66.79 
 
 
439 aa  363  3e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.471473 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5341  band 7 protein  54.36 
 
 
307 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.207546  normal  0.117184 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3439  band 7 protein  60.95 
 
 
361 aa  350  2e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717632  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1863  stomatin like protein  54.85 
 
 
312 aa  318  9e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.510549  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1714  band 7 protein  50.35 
 
 
314 aa  286  2.9999999999999996e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  45.34 
 
 
326 aa  286  4e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000590764  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0061  band 7 protein  47.26 
 
 
305 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0011407  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0702  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.81 
 
 
314 aa  282  8.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0061  band 7 protein  46.92 
 
 
305 aa  281  9e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313093  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2310  band 7 protein  41.97 
 
 
356 aa  275  8e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1632  band 7 protein  49.31 
 
 
315 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1560  band 7 protein  47 
 
 
322 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.140523  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1334  band 7/Mec-2 family protein  47.04 
 
 
326 aa  273  3e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1330  band 7 protein  47.25 
 
 
304 aa  270  2e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.373996  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2939  band 7 protein  48.62 
 
 
312 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0124635  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1890  stomatin-like protein  46 
 
 
322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1880  stomatin-like protein  46 
 
 
322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2146  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46 
 
 
322 aa  270  4e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1928  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46 
 
 
321 aa  270  4e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2106  SPFH domain/Band 7 family protein  46 
 
 
321 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46 
 
 
321 aa  270  4e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2174  SPFH domain/Band 7 family protein  46 
 
 
322 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3243  SPFH domain/Band 7 family protein  46 
 
 
322 aa  270  4e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000635475  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2064  SPFH domain/Band 7 family protein  46 
 
 
322 aa  270  4e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101789  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0729  band 7 protein  47.42 
 
 
310 aa  267  2e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0564  band 7 protein  43.56 
 
 
309 aa  267  2e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.396207  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1924  band 7 protein  46 
 
 
322 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0360  band 7 protein  43.73 
 
 
327 aa  261  1e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.259397 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1226  band 7 protein  45.42 
 
 
293 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00440  predicted protease, membrane anchored  43.27 
 
 
305 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3121  band 7 protein  43.27 
 
 
305 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3127  band 7 protein  43.27 
 
 
305 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00445  hypothetical protein  43.27 
 
 
305 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0593  SPFH domain/band 7 family protein  43.27 
 
 
305 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.554445 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0538  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.27 
 
 
305 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0568  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.27 
 
 
305 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0424  SPFH domain/band 7 family protein  43.27 
 
 
305 aa  238  9e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0548  band 7 protein  43.23 
 
 
305 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0550  band 7 protein  43.23 
 
 
305 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0609  band 7 protein  43.23 
 
 
305 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0565  band 7 protein  43.23 
 
 
305 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0555  band 7 protein  43.23 
 
 
305 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.857194  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0528  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.95 
 
 
305 aa  237  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.14 
 
 
304 aa  237  3e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  45.33 
 
 
336 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3720  hypothetical protein  43.81 
 
 
344 aa  229  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1100  band 7 protein  42.32 
 
 
304 aa  227  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1359  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.59 
 
 
334 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0198882 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3216  band 7 protein  42.32 
 
 
304 aa  226  7e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.26 
 
 
309 aa  225  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0944  band 7 protein  45.85 
 
 
331 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188485  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3305  band 7 protein  44.16 
 
 
345 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366608  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1703  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.06 
 
 
345 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0862  band 7 protein  42.09 
 
 
336 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3607  band 7 protein  44.16 
 
 
346 aa  222  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0497  hypothetical protein  40.92 
 
 
306 aa  223  6e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.988378  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6548  band 7 protein  40.06 
 
 
326 aa  222  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1902  band 7 protein  40.94 
 
 
311 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0416  band 7 protein  41.31 
 
 
304 aa  221  9.999999999999999e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4541  band 7 protein  42.67 
 
 
329 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2033  band 7 protein  40.94 
 
 
311 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295777  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3024  SPFH/band 7 family protein  41.58 
 
 
304 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3162  band 7 protein  41.58 
 
 
304 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1268  hypothetical protein  41.58 
 
 
304 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.169836 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1153  band 7 protein  42.66 
 
 
301 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.294255  hitchhiker  0.000000366449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5109  band 7 protein  43.2 
 
 
326 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000505876  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0466  band 7 protein  38.46 
 
 
321 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>